Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V3SJK8

Protein Details
Accession A0A4V3SJK8    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MGKRKKKSNNNNNNNNNNAKRFHydrophilic
87-111SSSVPRPPPRPQRLRHQPSPRTYEVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MGKRKKKSNNNNNNNNNNAKRFKSNDGKSNDNYDASRGYFDSTTGQRGAFPGLSREDEPFLGPAHDGLSYLRMVRSEAALVPPLLLSSSVPRPPPRPQRLRHQPSPRTYEVSVDTLDYDDPVPALDALDYDDPSSTSPPNPVDQQQQEALATSPTYSDNTDDDDDPNCFFAESTYVSLQKSPPPPPPPPYHTSLVSKFRAVRNKSHTNPPPPTPGLEFPRKFAHKWTMDTRPTMGLLWAMDMPKVISMTQNVTRMIGSGTRTVRRGIPKRVGEWVWALLVRCEDAMGPDEVYVVREMGKTALAVLKDVKEQWGEENGEVEEGGVENVEEEKTEQVEEAVEEDTGDPTNDAQPDTVQVDETEKGHVESLDSTTQNESVEQEQGPVHNNVDLSEPVKPKVVEEDVDWGYTQATLDMIISVVGDYFGQRDLLETRTLMEVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.86
3 0.82
4 0.79
5 0.74
6 0.67
7 0.65
8 0.62
9 0.64
10 0.66
11 0.66
12 0.67
13 0.67
14 0.7
15 0.65
16 0.67
17 0.61
18 0.54
19 0.46
20 0.4
21 0.37
22 0.31
23 0.29
24 0.22
25 0.22
26 0.19
27 0.19
28 0.23
29 0.22
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.21
34 0.22
35 0.25
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.22
40 0.25
41 0.25
42 0.27
43 0.25
44 0.24
45 0.24
46 0.21
47 0.18
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.1
75 0.16
76 0.19
77 0.23
78 0.27
79 0.32
80 0.42
81 0.52
82 0.58
83 0.62
84 0.64
85 0.72
86 0.79
87 0.84
88 0.84
89 0.84
90 0.82
91 0.81
92 0.83
93 0.75
94 0.69
95 0.6
96 0.54
97 0.46
98 0.39
99 0.31
100 0.24
101 0.21
102 0.16
103 0.16
104 0.12
105 0.1
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.13
125 0.15
126 0.17
127 0.2
128 0.22
129 0.28
130 0.29
131 0.31
132 0.29
133 0.28
134 0.25
135 0.23
136 0.2
137 0.13
138 0.11
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.19
167 0.23
168 0.24
169 0.3
170 0.35
171 0.39
172 0.43
173 0.49
174 0.49
175 0.48
176 0.49
177 0.44
178 0.42
179 0.42
180 0.43
181 0.43
182 0.38
183 0.36
184 0.35
185 0.37
186 0.43
187 0.41
188 0.43
189 0.44
190 0.52
191 0.53
192 0.59
193 0.61
194 0.6
195 0.62
196 0.57
197 0.55
198 0.46
199 0.45
200 0.38
201 0.35
202 0.33
203 0.38
204 0.35
205 0.31
206 0.37
207 0.38
208 0.35
209 0.35
210 0.38
211 0.32
212 0.36
213 0.4
214 0.41
215 0.42
216 0.43
217 0.4
218 0.32
219 0.29
220 0.25
221 0.19
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.11
236 0.14
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.14
244 0.12
245 0.15
246 0.17
247 0.19
248 0.2
249 0.21
250 0.25
251 0.33
252 0.38
253 0.41
254 0.46
255 0.47
256 0.48
257 0.53
258 0.49
259 0.41
260 0.36
261 0.29
262 0.21
263 0.19
264 0.17
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.19
300 0.2
301 0.18
302 0.19
303 0.18
304 0.17
305 0.16
306 0.13
307 0.08
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.12
343 0.11
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.12
354 0.15
355 0.18
356 0.18
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.19
361 0.18
362 0.17
363 0.14
364 0.17
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.18
369 0.21
370 0.2
371 0.19
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.18
376 0.18
377 0.16
378 0.22
379 0.23
380 0.23
381 0.28
382 0.27
383 0.25
384 0.3
385 0.32
386 0.26
387 0.26
388 0.32
389 0.28
390 0.29
391 0.28
392 0.21
393 0.18
394 0.17
395 0.15
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.1
414 0.12
415 0.15
416 0.17
417 0.16
418 0.17