Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DQM9

Protein Details
Accession A5DQM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-185EIEDKKKKKSERITKLDNKETDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-172KKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG pgu:PGUG_05580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSDTDSSDALSDVSLDEEDEELIWRVFYNTRERNLRAESHEFEMDDQVEVESISDLSDIDEPELVNEYRNLKNGTIGQNLTQEEKNKLIVSAFSEDHMDRFVAYRRVGINKPGIKKLCNGFLGQSVSQNMAIALSGISKVFLGEIITRAFEIQDREYRAQLRDEIEDKKKKKSERITKLDNKETDETESAGLPRLEYNGDTTRPLQPCHIREAWRLYRLENEGAFSGQRRRQGEADGRFFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.1
13 0.13
14 0.17
15 0.25
16 0.3
17 0.37
18 0.44
19 0.46
20 0.5
21 0.52
22 0.53
23 0.49
24 0.5
25 0.46
26 0.44
27 0.43
28 0.37
29 0.34
30 0.31
31 0.25
32 0.19
33 0.16
34 0.11
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.04
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.16
55 0.17
56 0.21
57 0.23
58 0.2
59 0.23
60 0.27
61 0.29
62 0.29
63 0.28
64 0.26
65 0.28
66 0.28
67 0.28
68 0.26
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.18
74 0.18
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.11
86 0.07
87 0.09
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.16
92 0.17
93 0.22
94 0.22
95 0.24
96 0.29
97 0.3
98 0.33
99 0.37
100 0.36
101 0.33
102 0.36
103 0.35
104 0.32
105 0.28
106 0.26
107 0.21
108 0.22
109 0.24
110 0.2
111 0.19
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.09
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.12
140 0.16
141 0.21
142 0.22
143 0.24
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.24
149 0.23
150 0.25
151 0.29
152 0.35
153 0.43
154 0.43
155 0.49
156 0.53
157 0.55
158 0.61
159 0.66
160 0.68
161 0.7
162 0.76
163 0.78
164 0.82
165 0.85
166 0.83
167 0.75
168 0.69
169 0.61
170 0.54
171 0.48
172 0.39
173 0.32
174 0.24
175 0.23
176 0.18
177 0.18
178 0.17
179 0.13
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.17
185 0.18
186 0.19
187 0.21
188 0.23
189 0.3
190 0.31
191 0.32
192 0.35
193 0.39
194 0.4
195 0.45
196 0.49
197 0.45
198 0.48
199 0.57
200 0.56
201 0.55
202 0.53
203 0.47
204 0.48
205 0.48
206 0.48
207 0.38
208 0.33
209 0.28
210 0.28
211 0.28
212 0.24
213 0.29
214 0.28
215 0.34
216 0.34
217 0.38
218 0.39
219 0.47
220 0.53
221 0.54