Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S2N7F8

Protein Details
Accession A0A4S2N7F8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-51IDGVLAERRPRKRVKPSRAQLEEELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-42RRPRKRVKP
513-550KKKAPPPAPTGQAQRGGPNARGGQRGGQRGGQRGGRGG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, nucl 10, cyto_mito 8.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MTTHTSEKLSAAIRAVNLSETPADDWIDGVLAERRPRKRVKPSRAQLEEELESSFLSPSQRFEGEWLNRLQQRWETPPDYASLMTLAPTMSRTVIRFTREGLEGRVTGYTEVTIPAQTITAKNSTSLLRKPATKADFVRGKAGFFPFSPGGIDAGSANERAEELELAEKAMAEKIGRDGLLRVAPGMSRGLKFDEDEKEVNGEDVVKETEEEGFEFGDIKPVRVARNRIEVEKKRQTEKLSELDSIDDLLPVEFPMLAPKGDLYTAAVKPKNKEWAHMVDVNKELTNFRELVPNMAREWPFELDTFQKEAVYHLEQGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRHVFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPDHVNLILLSATVPNTKEFASWVGRTKKKDIYVIATPKRPVPLEHYVWASKQMFKIVNAEKMFLMQGWKDAHDSLVKKKAPPPAPTGQAQRGGPNARGGQRGGQRGGQRGGRGGAQKHAQAVTRSAPGAMRSANQDKNIWVHLVQHLKKENLLPAVIFVFSKKRCEENADALSNIDYCNATEKSAIHMIVEKSIARLKPEDRQLPQIRRIRELLSRGLAVHHGGLLPIVKEMVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGTRKHDGRSFRDLLPGEYIQMAGRAGRRGIDTAGTVIIVSRDDEPPPAHTLKQMILGDPTRLQSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENTTQMLLPEHERKVQMSEADLKKLKREDCDICDVDLNVCHDSAMKVKELTQQMMLKAMNIRRGPKLFLPGRLVVVLDETSTRTVGVLTDGGIHTGPQPLLRILVLKPENNKKRPEDLIPFALHATAEITSLDCSSRPMRAVLLPVTAIEHLTRHFVAFDHKAAQRGEVAVLQAAQEELRLLTTDFSAPQWDEADWTKIKDLTFLEAFEARRRELEAAPTFTAPSCPNFHRHFAMRHEEYIISENIAQLKQLISDQNLQLLPDYEQRVAVLKELNFIDEHSSVQLKGRVACEVNSANELVLTELILENVLSSYDPEEIVALLSCFVFQEKTDTLPSITPRLETGKQQIIAIAKRINAIQDAHQVAIPESEDFEKISRFGLMEVVYEWAKGMSFSNITEMTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKSAARIIGDPGLYQKMQECQELIKRDVCHCASLYLCHSNHDMDAKIRSERTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.09
16 0.1
17 0.13
18 0.16
19 0.23
20 0.32
21 0.37
22 0.45
23 0.55
24 0.63
25 0.69
26 0.77
27 0.8
28 0.83
29 0.88
30 0.91
31 0.88
32 0.84
33 0.78
34 0.73
35 0.65
36 0.54
37 0.45
38 0.34
39 0.27
40 0.22
41 0.17
42 0.12
43 0.14
44 0.14
45 0.16
46 0.2
47 0.21
48 0.21
49 0.24
50 0.32
51 0.34
52 0.38
53 0.39
54 0.42
55 0.44
56 0.45
57 0.47
58 0.43
59 0.45
60 0.46
61 0.51
62 0.46
63 0.45
64 0.45
65 0.42
66 0.38
67 0.31
68 0.25
69 0.18
70 0.15
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.2
81 0.25
82 0.28
83 0.29
84 0.3
85 0.33
86 0.34
87 0.35
88 0.32
89 0.32
90 0.28
91 0.28
92 0.26
93 0.22
94 0.19
95 0.17
96 0.14
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.13
106 0.15
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.2
111 0.24
112 0.28
113 0.31
114 0.35
115 0.36
116 0.4
117 0.43
118 0.5
119 0.49
120 0.51
121 0.49
122 0.52
123 0.55
124 0.52
125 0.56
126 0.47
127 0.44
128 0.42
129 0.41
130 0.34
131 0.27
132 0.31
133 0.24
134 0.24
135 0.24
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.15
140 0.09
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.08
150 0.08
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.17
167 0.19
168 0.18
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.2
178 0.2
179 0.21
180 0.25
181 0.27
182 0.28
183 0.29
184 0.28
185 0.27
186 0.25
187 0.24
188 0.19
189 0.15
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.19
208 0.21
209 0.27
210 0.32
211 0.38
212 0.35
213 0.45
214 0.47
215 0.51
216 0.59
217 0.62
218 0.65
219 0.69
220 0.69
221 0.64
222 0.67
223 0.64
224 0.61
225 0.59
226 0.57
227 0.5
228 0.47
229 0.42
230 0.38
231 0.34
232 0.28
233 0.22
234 0.14
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.05
241 0.05
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.15
252 0.17
253 0.24
254 0.28
255 0.31
256 0.34
257 0.39
258 0.46
259 0.41
260 0.42
261 0.41
262 0.44
263 0.46
264 0.49
265 0.45
266 0.4
267 0.41
268 0.39
269 0.34
270 0.28
271 0.23
272 0.19
273 0.2
274 0.16
275 0.15
276 0.21
277 0.2
278 0.26
279 0.28
280 0.28
281 0.26
282 0.31
283 0.31
284 0.25
285 0.28
286 0.24
287 0.22
288 0.21
289 0.21
290 0.19
291 0.21
292 0.23
293 0.19
294 0.18
295 0.17
296 0.18
297 0.2
298 0.19
299 0.19
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.1
306 0.08
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.12
336 0.18
337 0.19
338 0.21
339 0.23
340 0.26
341 0.27
342 0.3
343 0.38
344 0.38
345 0.47
346 0.47
347 0.52
348 0.55
349 0.56
350 0.62
351 0.54
352 0.47
353 0.44
354 0.43
355 0.36
356 0.31
357 0.3
358 0.19
359 0.18
360 0.15
361 0.09
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.07
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.07
408 0.09
409 0.09
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.12
443 0.15
444 0.17
445 0.24
446 0.32
447 0.37
448 0.4
449 0.44
450 0.46
451 0.45
452 0.48
453 0.43
454 0.39
455 0.43
456 0.49
457 0.49
458 0.47
459 0.45
460 0.42
461 0.42
462 0.37
463 0.3
464 0.28
465 0.3
466 0.3
467 0.31
468 0.33
469 0.31
470 0.31
471 0.35
472 0.3
473 0.24
474 0.22
475 0.24
476 0.22
477 0.22
478 0.29
479 0.26
480 0.32
481 0.3
482 0.3
483 0.25
484 0.24
485 0.24
486 0.16
487 0.15
488 0.08
489 0.12
490 0.11
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.17
496 0.19
497 0.2
498 0.28
499 0.28
500 0.3
501 0.34
502 0.42
503 0.43
504 0.45
505 0.46
506 0.43
507 0.45
508 0.47
509 0.48
510 0.43
511 0.4
512 0.37
513 0.32
514 0.31
515 0.29
516 0.26
517 0.25
518 0.25
519 0.23
520 0.24
521 0.23
522 0.24
523 0.28
524 0.3
525 0.28
526 0.29
527 0.29
528 0.31
529 0.33
530 0.3
531 0.25
532 0.23
533 0.22
534 0.21
535 0.22
536 0.19
537 0.2
538 0.2
539 0.2
540 0.21
541 0.21
542 0.2
543 0.18
544 0.19
545 0.17
546 0.17
547 0.16
548 0.15
549 0.14
550 0.12
551 0.13
552 0.11
553 0.1
554 0.13
555 0.19
556 0.21
557 0.22
558 0.22
559 0.22
560 0.23
561 0.23
562 0.19
563 0.13
564 0.13
565 0.16
566 0.24
567 0.24
568 0.27
569 0.29
570 0.29
571 0.3
572 0.29
573 0.27
574 0.21
575 0.19
576 0.14
577 0.12
578 0.12
579 0.11
580 0.09
581 0.07
582 0.12
583 0.12
584 0.16
585 0.17
586 0.18
587 0.19
588 0.25
589 0.28
590 0.3
591 0.34
592 0.32
593 0.31
594 0.28
595 0.27
596 0.21
597 0.18
598 0.11
599 0.06
600 0.05
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.1
605 0.11
606 0.13
607 0.15
608 0.15
609 0.11
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.11
615 0.1
616 0.13
617 0.14
618 0.12
619 0.14
620 0.15
621 0.2
622 0.26
623 0.31
624 0.29
625 0.38
626 0.44
627 0.47
628 0.54
629 0.53
630 0.48
631 0.46
632 0.46
633 0.39
634 0.35
635 0.33
636 0.28
637 0.23
638 0.22
639 0.2
640 0.18
641 0.16
642 0.13
643 0.1
644 0.07
645 0.06
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.08
664 0.06
665 0.07
666 0.06
667 0.06
668 0.08
669 0.07
670 0.09
671 0.07
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.06
677 0.07
678 0.06
679 0.07
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.08
686 0.1
687 0.13
688 0.18
689 0.22
690 0.28
691 0.28
692 0.3
693 0.33
694 0.36
695 0.39
696 0.42
697 0.41
698 0.36
699 0.41
700 0.4
701 0.36
702 0.33
703 0.27
704 0.2
705 0.16
706 0.16
707 0.1
708 0.1
709 0.09
710 0.06
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.07
723 0.06
724 0.06
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.1
732 0.1
733 0.12
734 0.16
735 0.17
736 0.16
737 0.16
738 0.17
739 0.17
740 0.23
741 0.21
742 0.17
743 0.19
744 0.19
745 0.19
746 0.19
747 0.19
748 0.15
749 0.15
750 0.15
751 0.14
752 0.19
753 0.22
754 0.22
755 0.26
756 0.24
757 0.28
758 0.29
759 0.28
760 0.24
761 0.19
762 0.18
763 0.13
764 0.13
765 0.08
766 0.07
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.06
771 0.07
772 0.09
773 0.1
774 0.13
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.16
779 0.17
780 0.17
781 0.2
782 0.2
783 0.21
784 0.22
785 0.21
786 0.2
787 0.19
788 0.19
789 0.18
790 0.21
791 0.2
792 0.21
793 0.22
794 0.22
795 0.23
796 0.23
797 0.2
798 0.17
799 0.25
800 0.24
801 0.29
802 0.32
803 0.3
804 0.33
805 0.37
806 0.37
807 0.31
808 0.36
809 0.36
810 0.37
811 0.44
812 0.41
813 0.36
814 0.35
815 0.32
816 0.26
817 0.22
818 0.2
819 0.12
820 0.11
821 0.1
822 0.09
823 0.1
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.12
828 0.15
829 0.21
830 0.23
831 0.24
832 0.25
833 0.25
834 0.24
835 0.27
836 0.25
837 0.2
838 0.23
839 0.24
840 0.26
841 0.27
842 0.29
843 0.3
844 0.32
845 0.34
846 0.31
847 0.39
848 0.35
849 0.37
850 0.39
851 0.35
852 0.34
853 0.32
854 0.29
855 0.2
856 0.18
857 0.13
858 0.09
859 0.08
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.07
865 0.07
866 0.06
867 0.07
868 0.06
869 0.06
870 0.08
871 0.08
872 0.09
873 0.08
874 0.08
875 0.08
876 0.1
877 0.1
878 0.09
879 0.1
880 0.1
881 0.11
882 0.11
883 0.12
884 0.1
885 0.18
886 0.2
887 0.22
888 0.29
889 0.38
890 0.48
891 0.51
892 0.57
893 0.53
894 0.57
895 0.58
896 0.59
897 0.55
898 0.51
899 0.51
900 0.46
901 0.42
902 0.36
903 0.31
904 0.24
905 0.17
906 0.13
907 0.07
908 0.07
909 0.06
910 0.06
911 0.07
912 0.07
913 0.08
914 0.07
915 0.1
916 0.11
917 0.13
918 0.14
919 0.14
920 0.16
921 0.17
922 0.2
923 0.19
924 0.18
925 0.16
926 0.15
927 0.15
928 0.14
929 0.12
930 0.09
931 0.09
932 0.08
933 0.11
934 0.11
935 0.1
936 0.11
937 0.11
938 0.16
939 0.18
940 0.2
941 0.22
942 0.23
943 0.27
944 0.27
945 0.28
946 0.24
947 0.21
948 0.21
949 0.16
950 0.15
951 0.11
952 0.11
953 0.1
954 0.08
955 0.08
956 0.06
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.05
961 0.06
962 0.06
963 0.06
964 0.08
965 0.09
966 0.09
967 0.09
968 0.12
969 0.11
970 0.12
971 0.13
972 0.12
973 0.13
974 0.15
975 0.2
976 0.18
977 0.19
978 0.2
979 0.21
980 0.21
981 0.23
982 0.22
983 0.22
984 0.21
985 0.21
986 0.21
987 0.22
988 0.23
989 0.25
990 0.27
991 0.22
992 0.22
993 0.23
994 0.24
995 0.22
996 0.3
997 0.3
998 0.32
999 0.33
1000 0.32
1001 0.31
1002 0.28
1003 0.29
1004 0.22
1005 0.2
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.28
1009 0.31
1010 0.36
1011 0.38
1012 0.42
1013 0.44
1014 0.46
1015 0.53
1016 0.49
1017 0.46
1018 0.45
1019 0.4
1020 0.36
1021 0.34
1022 0.27
1023 0.19
1024 0.16
1025 0.16
1026 0.17
1027 0.16
1028 0.14
1029 0.12
1030 0.12
1031 0.11
1032 0.14
1033 0.15
1034 0.15
1035 0.2
1036 0.21
1037 0.25
1038 0.25
1039 0.24
1040 0.22
1041 0.21
1042 0.2
1043 0.21
1044 0.23
1045 0.19
1046 0.19
1047 0.19
1048 0.22
1049 0.2
1050 0.21
1051 0.2
1052 0.17
1053 0.21
1054 0.21
1055 0.22
1056 0.19
1057 0.19
1058 0.21
1059 0.16
1060 0.17
1061 0.14
1062 0.15
1063 0.15
1064 0.18
1065 0.22
1066 0.2
1067 0.22
1068 0.23
1069 0.25
1070 0.25
1071 0.25
1072 0.28
1073 0.26
1074 0.26
1075 0.24
1076 0.23
1077 0.18
1078 0.17
1079 0.17
1080 0.11
1081 0.09
1082 0.07
1083 0.06
1084 0.06
1085 0.06
1086 0.06
1087 0.06
1088 0.05
1089 0.05
1090 0.05
1091 0.05
1092 0.05
1093 0.07
1094 0.08
1095 0.08
1096 0.08
1097 0.08
1098 0.08
1099 0.08
1100 0.08
1101 0.07
1102 0.06
1103 0.06
1104 0.06
1105 0.06
1106 0.07
1107 0.07
1108 0.07
1109 0.13
1110 0.13
1111 0.17
1112 0.19
1113 0.2
1114 0.21
1115 0.24
1116 0.27
1117 0.27
1118 0.27
1119 0.24
1120 0.25
1121 0.3
1122 0.31
1123 0.32
1124 0.36
1125 0.38
1126 0.38
1127 0.38
1128 0.38
1129 0.38
1130 0.38
1131 0.38
1132 0.33
1133 0.27
1134 0.27
1135 0.28
1136 0.26
1137 0.24
1138 0.23
1139 0.22
1140 0.27
1141 0.28
1142 0.27
1143 0.27
1144 0.26
1145 0.24
1146 0.23
1147 0.2
1148 0.12
1149 0.12
1150 0.13
1151 0.13
1152 0.13
1153 0.14
1154 0.14
1155 0.14
1156 0.14
1157 0.14
1158 0.13
1159 0.13
1160 0.15
1161 0.14
1162 0.13
1163 0.14
1164 0.15
1165 0.14
1166 0.14
1167 0.13
1168 0.1
1169 0.09
1170 0.09
1171 0.1
1172 0.11
1173 0.12
1174 0.13
1175 0.18
1176 0.18
1177 0.19
1178 0.18
1179 0.17
1180 0.15
1181 0.14
1182 0.13
1183 0.09
1184 0.09
1185 0.09
1186 0.09
1187 0.11
1188 0.09
1189 0.09
1190 0.1
1191 0.1
1192 0.11
1193 0.15
1194 0.17
1195 0.19
1196 0.23
1197 0.29
1198 0.33
1199 0.34
1200 0.34
1201 0.31
1202 0.32
1203 0.36
1204 0.39
1205 0.37
1206 0.34
1207 0.33
1208 0.34
1209 0.38
1210 0.34
1211 0.26
1212 0.23
1213 0.25
1214 0.22
1215 0.22
1216 0.22
1217 0.24
1218 0.27
1219 0.29
1220 0.26
1221 0.28
1222 0.36
1223 0.41
1224 0.42
1225 0.41
1226 0.42
1227 0.43
1228 0.5
1229 0.45
1230 0.41
1231 0.36
1232 0.37
1233 0.32
1234 0.33
1235 0.36
1236 0.36
1237 0.34
1238 0.33
1239 0.34
1240 0.32
1241 0.33
1242 0.33
1243 0.3
1244 0.25
1245 0.31
1246 0.31
1247 0.34