Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DLR2

Protein Details
Accession A5DLR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-280STPPDVQKRLPRGPRRAPPSGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-306KRLPRGPRRAPPSGPSGGHRGRGGYRGRDRGYHPYSRGGRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034156  Hrp1_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_04213  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12577  RRM1_Hrp1p  
Amino Acid Sequences MFIGGLNWDTTEQGLVEYFSKFGEVVDHTIMRDSATGKSRGFGFLTFKDTKSVDAVIQGDHVLDGKLIDPKRAIAREEQDKVGKIFVGGIDPMVNEKEFHDFFSQFGSIIDAQLMIDKDTGRSRGFGFITFDSPEAVDRVTVNKFLTLKGKSMEVKRAEPRGAHHGGSQQQGYGYNPYNQYGGGAGGGAAPYGQYNQGVNGMNADMMQYWQQMQQWYMYQQQQQQSSQQDYQENPDQQPLNPQQQGENESAPTRSESNSTPPDVQKRLPRGPRRAPPSGPSGGHRGRGGYRGRDRGYHPYSRGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.12
11 0.13
12 0.16
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.17
22 0.21
23 0.25
24 0.24
25 0.26
26 0.27
27 0.28
28 0.27
29 0.24
30 0.25
31 0.23
32 0.31
33 0.31
34 0.3
35 0.32
36 0.31
37 0.3
38 0.26
39 0.25
40 0.18
41 0.19
42 0.2
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.15
57 0.18
58 0.25
59 0.27
60 0.28
61 0.27
62 0.34
63 0.41
64 0.44
65 0.44
66 0.41
67 0.4
68 0.39
69 0.33
70 0.26
71 0.18
72 0.15
73 0.12
74 0.11
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.13
85 0.13
86 0.15
87 0.18
88 0.17
89 0.17
90 0.2
91 0.19
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.11
107 0.14
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.19
115 0.17
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.18
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.21
139 0.23
140 0.29
141 0.26
142 0.3
143 0.33
144 0.35
145 0.34
146 0.31
147 0.31
148 0.32
149 0.31
150 0.27
151 0.24
152 0.25
153 0.27
154 0.28
155 0.25
156 0.18
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.11
169 0.1
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.22
205 0.25
206 0.27
207 0.31
208 0.36
209 0.38
210 0.38
211 0.41
212 0.4
213 0.41
214 0.4
215 0.38
216 0.37
217 0.34
218 0.38
219 0.41
220 0.39
221 0.34
222 0.37
223 0.35
224 0.31
225 0.39
226 0.39
227 0.39
228 0.39
229 0.38
230 0.36
231 0.38
232 0.42
233 0.35
234 0.31
235 0.25
236 0.24
237 0.24
238 0.22
239 0.2
240 0.18
241 0.16
242 0.17
243 0.18
244 0.25
245 0.29
246 0.32
247 0.34
248 0.39
249 0.45
250 0.47
251 0.5
252 0.51
253 0.55
254 0.61
255 0.66
256 0.71
257 0.73
258 0.79
259 0.83
260 0.82
261 0.81
262 0.76
263 0.7
264 0.67
265 0.64
266 0.56
267 0.5
268 0.51
269 0.47
270 0.47
271 0.44
272 0.4
273 0.36
274 0.41
275 0.45
276 0.45
277 0.5
278 0.55
279 0.57
280 0.58
281 0.6
282 0.64
283 0.64
284 0.63
285 0.56
286 0.57