Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DPF0

Protein Details
Accession A5DPF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MKKPKKHKIHKNSQRLTKKHKIAQSNKLRQNPTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
2-22KKPKKHKIHKNSQRLTKKHKI
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.332, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pgu:PGUG_05151  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MKKPKKHKIHKNSQRLTKKHKIAQSNKLRQNPTSSHSNLSTSSHSPYLLSLFHIHTPAPKTKLRTATTPIMANPISVTSSRHTTSLDGALSGHLQNSFIGTGNPGVSVMSRVLMSLRSGIDTEIVWALSTLTEYSSTNTSLLNLESAEFVGHELMNYFFRPYALINEGNPVTRAQISQSCDALLSLRNLCQDLINQQWLSQSKAFKKHATEVVKFCSGWLYGSTVHEPHLQPFENEFIETFNHLLDLLEILSCYYIDNTKNDQLVQQILALSLVAREKNVVVSTLTILTHLLYTRDDKPEDDVEKTPNNCIDAITINHLETFANYLLIADNELALAALNFFNQYLSSDTFHPSHAHSVRSSRGERLSLLLQLKSTKTIFEIFVKQLPRLIVQDLPLSGAPAVPVASLSRRSQHSSIPSQLPHLPSELYDVIVKFPEPLRATTWLRCCYEPYFETTTTASGQTDVIPGEVTQISLWKAYEKQFEQVWQTAKTRPNPDWPPLLPAVDFIKNVNSAFPNSEAMVVTLDAEGDQPAKKKFIIKGIQPRQFVVNIDVANYEALKQKSASTLTNTSNGSLPIGHIDQEKFQHTLKQKIEQTLTQNSNAIPPLAKGNPVNTVSVELMSRVFSEVIQTDDSGELGNVFRVFNSYWLPDVVYANPALVQHGYIDGKWLGYLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.91
3 0.9
4 0.89
5 0.88
6 0.85
7 0.83
8 0.83
9 0.82
10 0.84
11 0.85
12 0.85
13 0.84
14 0.85
15 0.81
16 0.73
17 0.73
18 0.67
19 0.61
20 0.59
21 0.53
22 0.49
23 0.47
24 0.47
25 0.4
26 0.38
27 0.39
28 0.32
29 0.33
30 0.29
31 0.27
32 0.25
33 0.24
34 0.23
35 0.19
36 0.19
37 0.19
38 0.2
39 0.22
40 0.23
41 0.22
42 0.24
43 0.3
44 0.34
45 0.36
46 0.38
47 0.42
48 0.49
49 0.58
50 0.55
51 0.56
52 0.56
53 0.59
54 0.58
55 0.55
56 0.47
57 0.44
58 0.4
59 0.34
60 0.28
61 0.2
62 0.18
63 0.16
64 0.18
65 0.15
66 0.2
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.24
72 0.26
73 0.23
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.15
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.14
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.22
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.18
163 0.2
164 0.22
165 0.23
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.18
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.22
182 0.2
183 0.2
184 0.25
185 0.25
186 0.28
187 0.27
188 0.29
189 0.31
190 0.4
191 0.44
192 0.44
193 0.46
194 0.49
195 0.53
196 0.54
197 0.53
198 0.48
199 0.49
200 0.47
201 0.43
202 0.36
203 0.3
204 0.23
205 0.18
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.14
210 0.16
211 0.14
212 0.16
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.23
217 0.21
218 0.2
219 0.21
220 0.23
221 0.18
222 0.18
223 0.15
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.07
243 0.08
244 0.12
245 0.16
246 0.19
247 0.2
248 0.2
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.17
253 0.13
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.1
281 0.13
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.2
286 0.25
287 0.25
288 0.25
289 0.23
290 0.24
291 0.28
292 0.28
293 0.26
294 0.22
295 0.21
296 0.18
297 0.16
298 0.14
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.08
308 0.1
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.04
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.05
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.14
340 0.19
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.21
345 0.24
346 0.28
347 0.28
348 0.24
349 0.25
350 0.24
351 0.23
352 0.23
353 0.2
354 0.19
355 0.2
356 0.17
357 0.16
358 0.17
359 0.16
360 0.17
361 0.16
362 0.12
363 0.11
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.19
368 0.17
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.21
373 0.21
374 0.19
375 0.16
376 0.17
377 0.14
378 0.14
379 0.15
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.08
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.07
393 0.1
394 0.11
395 0.15
396 0.17
397 0.21
398 0.23
399 0.26
400 0.31
401 0.33
402 0.37
403 0.37
404 0.35
405 0.34
406 0.36
407 0.33
408 0.28
409 0.24
410 0.19
411 0.15
412 0.19
413 0.16
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.09
421 0.1
422 0.15
423 0.15
424 0.17
425 0.19
426 0.25
427 0.28
428 0.32
429 0.38
430 0.37
431 0.38
432 0.37
433 0.37
434 0.33
435 0.36
436 0.31
437 0.3
438 0.29
439 0.28
440 0.29
441 0.26
442 0.25
443 0.21
444 0.21
445 0.15
446 0.11
447 0.11
448 0.09
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.13
464 0.17
465 0.24
466 0.24
467 0.27
468 0.27
469 0.3
470 0.32
471 0.34
472 0.33
473 0.3
474 0.31
475 0.34
476 0.39
477 0.43
478 0.44
479 0.43
480 0.49
481 0.5
482 0.52
483 0.53
484 0.48
485 0.46
486 0.42
487 0.4
488 0.3
489 0.27
490 0.27
491 0.22
492 0.22
493 0.17
494 0.18
495 0.18
496 0.18
497 0.19
498 0.16
499 0.15
500 0.17
501 0.18
502 0.17
503 0.16
504 0.17
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.09
517 0.12
518 0.14
519 0.16
520 0.18
521 0.23
522 0.27
523 0.35
524 0.4
525 0.46
526 0.56
527 0.64
528 0.69
529 0.65
530 0.62
531 0.56
532 0.5
533 0.43
534 0.35
535 0.29
536 0.22
537 0.21
538 0.2
539 0.18
540 0.16
541 0.15
542 0.13
543 0.14
544 0.15
545 0.16
546 0.16
547 0.17
548 0.21
549 0.24
550 0.25
551 0.25
552 0.31
553 0.32
554 0.37
555 0.36
556 0.32
557 0.31
558 0.28
559 0.23
560 0.17
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.15
565 0.17
566 0.17
567 0.2
568 0.24
569 0.26
570 0.24
571 0.25
572 0.31
573 0.33
574 0.42
575 0.43
576 0.48
577 0.51
578 0.56
579 0.59
580 0.56
581 0.57
582 0.57
583 0.56
584 0.48
585 0.45
586 0.38
587 0.38
588 0.34
589 0.29
590 0.2
591 0.17
592 0.22
593 0.21
594 0.24
595 0.22
596 0.24
597 0.3
598 0.31
599 0.31
600 0.25
601 0.27
602 0.24
603 0.23
604 0.21
605 0.15
606 0.14
607 0.13
608 0.13
609 0.11
610 0.11
611 0.1
612 0.13
613 0.13
614 0.15
615 0.16
616 0.15
617 0.15
618 0.15
619 0.15
620 0.12
621 0.11
622 0.09
623 0.09
624 0.11
625 0.11
626 0.1
627 0.1
628 0.13
629 0.13
630 0.15
631 0.19
632 0.18
633 0.19
634 0.2
635 0.21
636 0.2
637 0.22
638 0.2
639 0.19
640 0.17
641 0.16
642 0.16
643 0.15
644 0.15
645 0.13
646 0.12
647 0.1
648 0.15
649 0.16
650 0.15
651 0.19
652 0.17
653 0.17