Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7TYP8

Protein Details
Accession A0A4Y7TYP8    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-191RDDVDKRKEKERRREEKELRKMAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-191KRKEKERRREEKELRKMAA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MDVDPDTYREHVRGPAREIITVETRIRPENKGFALLARMGWSEGQPLGLSGDGRVDPIPFQLKNDSTGIGKITQDIRMIETTVSQRKGLEVERQQKETEVQRKARQELVARKAAVEDEISSVLRAFYCELCDKQFKNVAQYDEHTNSYGHHHKARLRDMNANARPTSRDDVDKRKEKERRREEKELRKMAAAAGIKMPKVAALALAAGPAIVPPSDPMTPSSAQSGTTSESSQPQNGGWATVSVPASQPGTVKKSGWATVGSVPPAPTFGLSPRPPAAVTSAQRTSAAPSQTSSAPAFRNAGWTSLDTGSSQQVPSQPPLSLAAPPRPPYPPPMSSQDSRMSPQAPLPGLGPTTGPAPTPIPTALQPHRPSGGGGWKQFQSSMKTKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.45
4 0.46
5 0.44
6 0.41
7 0.38
8 0.37
9 0.35
10 0.31
11 0.32
12 0.37
13 0.39
14 0.39
15 0.39
16 0.43
17 0.42
18 0.41
19 0.39
20 0.34
21 0.35
22 0.31
23 0.27
24 0.21
25 0.2
26 0.16
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.08
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.15
45 0.21
46 0.18
47 0.21
48 0.26
49 0.27
50 0.29
51 0.3
52 0.28
53 0.23
54 0.24
55 0.23
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.2
61 0.21
62 0.2
63 0.21
64 0.2
65 0.21
66 0.17
67 0.18
68 0.22
69 0.27
70 0.28
71 0.26
72 0.25
73 0.25
74 0.28
75 0.28
76 0.3
77 0.33
78 0.42
79 0.46
80 0.48
81 0.47
82 0.45
83 0.47
84 0.47
85 0.47
86 0.45
87 0.47
88 0.52
89 0.58
90 0.59
91 0.59
92 0.54
93 0.54
94 0.54
95 0.54
96 0.53
97 0.47
98 0.45
99 0.4
100 0.36
101 0.29
102 0.2
103 0.14
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.1
115 0.13
116 0.14
117 0.18
118 0.24
119 0.24
120 0.27
121 0.33
122 0.31
123 0.35
124 0.37
125 0.36
126 0.32
127 0.34
128 0.35
129 0.31
130 0.31
131 0.26
132 0.22
133 0.2
134 0.24
135 0.28
136 0.25
137 0.26
138 0.29
139 0.32
140 0.38
141 0.46
142 0.48
143 0.45
144 0.48
145 0.5
146 0.56
147 0.56
148 0.52
149 0.44
150 0.37
151 0.36
152 0.33
153 0.31
154 0.23
155 0.26
156 0.27
157 0.37
158 0.44
159 0.51
160 0.51
161 0.57
162 0.63
163 0.66
164 0.72
165 0.74
166 0.76
167 0.76
168 0.83
169 0.84
170 0.87
171 0.87
172 0.83
173 0.72
174 0.62
175 0.54
176 0.43
177 0.39
178 0.28
179 0.19
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.03
200 0.03
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.16
223 0.15
224 0.15
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.16
238 0.18
239 0.18
240 0.2
241 0.22
242 0.23
243 0.24
244 0.21
245 0.19
246 0.22
247 0.23
248 0.21
249 0.19
250 0.18
251 0.16
252 0.16
253 0.14
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.18
258 0.18
259 0.22
260 0.22
261 0.23
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.24
266 0.25
267 0.28
268 0.28
269 0.28
270 0.28
271 0.28
272 0.28
273 0.25
274 0.25
275 0.2
276 0.19
277 0.21
278 0.21
279 0.24
280 0.21
281 0.19
282 0.18
283 0.2
284 0.21
285 0.18
286 0.24
287 0.21
288 0.22
289 0.2
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.21
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.16
299 0.15
300 0.19
301 0.21
302 0.24
303 0.24
304 0.22
305 0.22
306 0.25
307 0.24
308 0.24
309 0.25
310 0.29
311 0.33
312 0.35
313 0.37
314 0.37
315 0.38
316 0.4
317 0.44
318 0.4
319 0.39
320 0.44
321 0.47
322 0.45
323 0.49
324 0.48
325 0.44
326 0.43
327 0.42
328 0.37
329 0.32
330 0.33
331 0.34
332 0.29
333 0.26
334 0.24
335 0.23
336 0.22
337 0.21
338 0.18
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.14
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.2
350 0.27
351 0.31
352 0.39
353 0.4
354 0.42
355 0.43
356 0.41
357 0.4
358 0.38
359 0.43
360 0.41
361 0.41
362 0.42
363 0.42
364 0.42
365 0.45
366 0.43
367 0.41
368 0.4
369 0.47