Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DB72

Protein Details
Accession A5DB72    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-426ISWQVMKRQKHHDPNGPINDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 21, E.R. 3, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG pgu:PGUG_00527  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MGWFEQITTETATRSLPTWTPSSIPASTSLSSIDPTNANGLWETVLSASAVAMTATETPVLYQVSKVLRGAAASLTIIEAEKYLATANPTETASISMAQELVFNATLNLKALEWDSNLYTNALNIPANAIFTALFGLLFIVFVAWMFTGKQIYFGVCFACGTVLEFCGYFARTLAAKDYANPDKYLCQIICLTMAPAFIMAGIYYILGQLRIVYGNYGILPPSWYTYLFIFCDVVSLFTQAVGGAIAATEVRRYIFRPTGTNIMIAGISFQLFSMTLFVICWCDMLFKACFRADPNFKFSLGRCMHLLLNTPKGRQYRQQLEPFYDPAFVDVRRGYLFGYLPLVVSASVLFVYIRCAYRVAELSQGWTGFLITHEQFIMTLDALMVFLACVFYVPLYPSQIFGNAISWQVMKRQKHHDPNGPINDEKSLYKCDTKTTIEKVDEKFRTHEHSNSRSEESTAYDNESFYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.23
6 0.24
7 0.25
8 0.27
9 0.31
10 0.28
11 0.27
12 0.26
13 0.28
14 0.27
15 0.25
16 0.24
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.13
29 0.12
30 0.11
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.09
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.15
51 0.17
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.19
58 0.14
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.07
136 0.07
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.11
164 0.13
165 0.19
166 0.23
167 0.24
168 0.24
169 0.23
170 0.22
171 0.23
172 0.26
173 0.2
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.09
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.1
242 0.15
243 0.16
244 0.19
245 0.21
246 0.26
247 0.26
248 0.25
249 0.21
250 0.17
251 0.15
252 0.12
253 0.1
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.16
279 0.23
280 0.28
281 0.3
282 0.35
283 0.33
284 0.34
285 0.35
286 0.33
287 0.36
288 0.29
289 0.28
290 0.23
291 0.23
292 0.24
293 0.23
294 0.28
295 0.21
296 0.29
297 0.29
298 0.3
299 0.33
300 0.35
301 0.37
302 0.38
303 0.45
304 0.45
305 0.51
306 0.58
307 0.56
308 0.58
309 0.58
310 0.53
311 0.44
312 0.37
313 0.28
314 0.22
315 0.21
316 0.16
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.14
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.07
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.17
346 0.2
347 0.19
348 0.21
349 0.2
350 0.22
351 0.23
352 0.23
353 0.19
354 0.16
355 0.14
356 0.09
357 0.1
358 0.13
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.05
381 0.07
382 0.09
383 0.14
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.16
390 0.17
391 0.14
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.2
397 0.28
398 0.31
399 0.37
400 0.46
401 0.55
402 0.65
403 0.73
404 0.76
405 0.77
406 0.82
407 0.84
408 0.79
409 0.7
410 0.61
411 0.55
412 0.47
413 0.4
414 0.33
415 0.3
416 0.29
417 0.34
418 0.34
419 0.36
420 0.4
421 0.44
422 0.48
423 0.5
424 0.54
425 0.53
426 0.59
427 0.58
428 0.63
429 0.61
430 0.57
431 0.54
432 0.51
433 0.53
434 0.51
435 0.54
436 0.53
437 0.56
438 0.59
439 0.6
440 0.61
441 0.54
442 0.51
443 0.45
444 0.4
445 0.36
446 0.31
447 0.32
448 0.28