Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DKP1

Protein Details
Accession A5DKP1    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-358NDKPMSKESKRKLRISRANAHAKPHydrophilic
367-386DNVKKARTPKQQLSEAQKSKHydrophilic
409-442IEGQRARKGDKPGKKKKPRIRERTQNYKKESNTTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-351KRKLRISR
384-396KSKLGRAKAVLGR
406-431KPIIEGQRARKGDKPGKKKKPRIRER
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_03842  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MILKLFGVFPVCVQDALISHSPSRIIFGAHRIAFIFMSSFSGLFGDAPVDNDLSKLFSDTTQKVERPVRARTEVETRKRVTKTTAETNDENDPSEVESEDSASEEDSRPRKSEEDDDIEGKYFQALNKDTHPKNTDEKKDRTRTPKVATATKVDLKEDEFDKAERTVFVGNVPATVVTSKSTQKQFKKLFSEVGPVESVRFRSIAFGEALPRKAAFAQKKLHGARDSVNAYVVYKEKTPSRNAVSRLNAREFDHHHLRVDHVAHPVAKDNKRTIFVGNLDFEASEEELWRYFNSHTDNDVESVRVVRDSKTNLGKGFALVQFKDSLSVNKCILLNDKPMSKESKRKLRISRANAHAKPSVLSPNHIDNVKKARTPKQQLSEAQKSKLGRAKAVLGRADRATIGQVKPIIEGQRARKGDKPGKKKKPRIRERTQNYKKESNTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.2
4 0.24
5 0.2
6 0.2
7 0.22
8 0.23
9 0.21
10 0.24
11 0.19
12 0.17
13 0.18
14 0.24
15 0.31
16 0.3
17 0.31
18 0.28
19 0.29
20 0.26
21 0.23
22 0.18
23 0.1
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.12
45 0.19
46 0.21
47 0.27
48 0.32
49 0.33
50 0.39
51 0.44
52 0.49
53 0.48
54 0.53
55 0.54
56 0.53
57 0.54
58 0.51
59 0.55
60 0.57
61 0.61
62 0.61
63 0.58
64 0.6
65 0.61
66 0.59
67 0.54
68 0.53
69 0.51
70 0.54
71 0.57
72 0.55
73 0.54
74 0.54
75 0.55
76 0.47
77 0.41
78 0.31
79 0.24
80 0.19
81 0.19
82 0.16
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.1
91 0.1
92 0.17
93 0.21
94 0.23
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.31
99 0.36
100 0.37
101 0.39
102 0.4
103 0.39
104 0.38
105 0.37
106 0.33
107 0.25
108 0.19
109 0.14
110 0.12
111 0.16
112 0.18
113 0.19
114 0.26
115 0.35
116 0.35
117 0.41
118 0.43
119 0.41
120 0.48
121 0.54
122 0.58
123 0.57
124 0.65
125 0.68
126 0.73
127 0.77
128 0.77
129 0.77
130 0.74
131 0.71
132 0.69
133 0.64
134 0.62
135 0.56
136 0.52
137 0.48
138 0.45
139 0.41
140 0.35
141 0.31
142 0.26
143 0.27
144 0.23
145 0.2
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.12
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.06
165 0.09
166 0.11
167 0.17
168 0.24
169 0.32
170 0.37
171 0.46
172 0.51
173 0.55
174 0.6
175 0.56
176 0.53
177 0.46
178 0.48
179 0.38
180 0.34
181 0.27
182 0.21
183 0.2
184 0.16
185 0.16
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.14
195 0.16
196 0.17
197 0.15
198 0.15
199 0.13
200 0.14
201 0.2
202 0.19
203 0.23
204 0.27
205 0.3
206 0.38
207 0.39
208 0.42
209 0.37
210 0.34
211 0.3
212 0.32
213 0.3
214 0.22
215 0.22
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.16
224 0.19
225 0.22
226 0.25
227 0.29
228 0.34
229 0.36
230 0.41
231 0.42
232 0.45
233 0.47
234 0.44
235 0.41
236 0.37
237 0.38
238 0.35
239 0.37
240 0.37
241 0.34
242 0.32
243 0.31
244 0.31
245 0.3
246 0.29
247 0.25
248 0.2
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.24
253 0.28
254 0.29
255 0.3
256 0.32
257 0.33
258 0.35
259 0.35
260 0.31
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.23
265 0.2
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.13
270 0.1
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.13
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.21
284 0.22
285 0.22
286 0.22
287 0.18
288 0.14
289 0.14
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.15
295 0.18
296 0.25
297 0.3
298 0.33
299 0.32
300 0.33
301 0.32
302 0.28
303 0.29
304 0.26
305 0.23
306 0.2
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.21
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.23
315 0.22
316 0.23
317 0.24
318 0.23
319 0.27
320 0.25
321 0.27
322 0.27
323 0.31
324 0.29
325 0.32
326 0.38
327 0.39
328 0.46
329 0.49
330 0.56
331 0.61
332 0.68
333 0.75
334 0.79
335 0.83
336 0.82
337 0.83
338 0.81
339 0.84
340 0.77
341 0.73
342 0.64
343 0.55
344 0.47
345 0.4
346 0.39
347 0.3
348 0.3
349 0.29
350 0.32
351 0.35
352 0.37
353 0.35
354 0.32
355 0.4
356 0.42
357 0.42
358 0.42
359 0.49
360 0.57
361 0.65
362 0.69
363 0.68
364 0.72
365 0.76
366 0.79
367 0.8
368 0.75
369 0.68
370 0.63
371 0.56
372 0.55
373 0.53
374 0.46
375 0.39
376 0.37
377 0.43
378 0.43
379 0.48
380 0.47
381 0.43
382 0.44
383 0.41
384 0.39
385 0.3
386 0.26
387 0.25
388 0.26
389 0.24
390 0.25
391 0.26
392 0.26
393 0.27
394 0.31
395 0.3
396 0.29
397 0.35
398 0.37
399 0.44
400 0.47
401 0.49
402 0.51
403 0.58
404 0.63
405 0.66
406 0.7
407 0.72
408 0.8
409 0.88
410 0.92
411 0.93
412 0.94
413 0.95
414 0.94
415 0.94
416 0.94
417 0.93
418 0.94
419 0.94
420 0.92
421 0.89
422 0.88