Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7TJZ2

Protein Details
Accession A0A4Y7TJZ2    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-124SPEKSKLSAKPKPEPKKQQKKVADKNKTPVSRRKQRDPKPIKGAEEBasic
322-366VPPEQLTRAKHNKKRDDDEQYAAGRRLIKRQNQRKRKLEELGINYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-48KDKSAKPTPTAEPKEKKEAAPAKSLKRKS
64-120KPSSSKKSKTIPAAPSPEKSKLSAKPKPEPKKQQKKVADKNKTPVSRRKQRDPKPIK
348-357LIKRQNQRKR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKSASTKPSGSSSSSKATKDKSAKPTPTAEPKEKKEAAPAKSLKRKSDAAEVKSSTTTEEAAKPSSSKKSKTIPAAPSPEKSKLSAKPKPEPKKQQKKVADKNKTPVSRRKQRDPKPIKGAEESDEEEEEKNVEEEEEEPAKATEDKKGKAPKATVEDESDEEEDEEEVELHGFSTDEDSSDEESDMEVDASAFDVGKLPTIAKDDATVKKKLEKAKRNPTGERGVLFLGRIPHGFYEEQMKSYFTQFGDVTRVRLSRNKKTGKSKHYGFIEFDSASVAKIVAETMDNYLLNGHIMQCKVIPKDKVHPQLWVGANRKWRTVPPEQLTRAKHNKKRDDDEQYAAGRRLIKRQNQRKRKLEELGINYDFEGAGYKKIPKNAESPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.47
4 0.48
5 0.49
6 0.54
7 0.57
8 0.62
9 0.63
10 0.68
11 0.71
12 0.7
13 0.72
14 0.71
15 0.73
16 0.72
17 0.72
18 0.71
19 0.71
20 0.76
21 0.73
22 0.65
23 0.65
24 0.65
25 0.58
26 0.59
27 0.61
28 0.61
29 0.67
30 0.72
31 0.67
32 0.64
33 0.65
34 0.58
35 0.62
36 0.6
37 0.56
38 0.58
39 0.55
40 0.52
41 0.48
42 0.44
43 0.35
44 0.27
45 0.23
46 0.18
47 0.2
48 0.2
49 0.21
50 0.22
51 0.23
52 0.27
53 0.35
54 0.39
55 0.39
56 0.43
57 0.49
58 0.55
59 0.62
60 0.66
61 0.64
62 0.66
63 0.71
64 0.68
65 0.65
66 0.62
67 0.59
68 0.52
69 0.48
70 0.46
71 0.45
72 0.52
73 0.53
74 0.56
75 0.6
76 0.69
77 0.76
78 0.79
79 0.82
80 0.83
81 0.88
82 0.9
83 0.9
84 0.9
85 0.91
86 0.91
87 0.91
88 0.9
89 0.85
90 0.85
91 0.84
92 0.81
93 0.76
94 0.75
95 0.75
96 0.75
97 0.76
98 0.78
99 0.8
100 0.82
101 0.87
102 0.86
103 0.85
104 0.85
105 0.83
106 0.75
107 0.69
108 0.61
109 0.52
110 0.47
111 0.39
112 0.31
113 0.26
114 0.23
115 0.19
116 0.17
117 0.14
118 0.1
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.17
133 0.21
134 0.22
135 0.29
136 0.36
137 0.39
138 0.41
139 0.43
140 0.42
141 0.42
142 0.45
143 0.4
144 0.34
145 0.33
146 0.29
147 0.29
148 0.23
149 0.17
150 0.14
151 0.12
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.09
190 0.1
191 0.08
192 0.1
193 0.15
194 0.21
195 0.25
196 0.26
197 0.24
198 0.3
199 0.34
200 0.4
201 0.46
202 0.5
203 0.56
204 0.65
205 0.73
206 0.74
207 0.73
208 0.7
209 0.67
210 0.58
211 0.48
212 0.38
213 0.3
214 0.24
215 0.21
216 0.17
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.17
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.17
231 0.19
232 0.22
233 0.14
234 0.16
235 0.15
236 0.16
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.22
242 0.21
243 0.28
244 0.34
245 0.37
246 0.47
247 0.54
248 0.58
249 0.68
250 0.76
251 0.78
252 0.8
253 0.74
254 0.72
255 0.69
256 0.64
257 0.55
258 0.48
259 0.43
260 0.34
261 0.3
262 0.24
263 0.18
264 0.15
265 0.13
266 0.1
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.18
287 0.22
288 0.27
289 0.3
290 0.31
291 0.4
292 0.49
293 0.56
294 0.53
295 0.53
296 0.48
297 0.52
298 0.53
299 0.52
300 0.47
301 0.42
302 0.5
303 0.48
304 0.5
305 0.44
306 0.44
307 0.43
308 0.48
309 0.53
310 0.51
311 0.59
312 0.62
313 0.67
314 0.68
315 0.7
316 0.72
317 0.72
318 0.73
319 0.73
320 0.78
321 0.79
322 0.83
323 0.83
324 0.81
325 0.76
326 0.74
327 0.69
328 0.63
329 0.58
330 0.51
331 0.44
332 0.41
333 0.37
334 0.42
335 0.45
336 0.5
337 0.57
338 0.67
339 0.75
340 0.8
341 0.88
342 0.89
343 0.88
344 0.87
345 0.85
346 0.83
347 0.81
348 0.77
349 0.75
350 0.67
351 0.6
352 0.5
353 0.42
354 0.33
355 0.23
356 0.2
357 0.12
358 0.14
359 0.17
360 0.25
361 0.28
362 0.35
363 0.39
364 0.38