Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DCV6

Protein Details
Accession A5DCV6    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-327NYNDAKPNKKISKTKQRKKKGAMTDTTSHydrophilic
410-430DSVSKGKAANRRKQNSSVDKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-320KPNKKISKTKQRKKKG
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG pgu:PGUG_01111  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRRFDKKGAVTYSVVHRAHDDSLYYDNDASRHVLVPSSDAKNVQKKSYSVAELEEKLGKESTEKIRANEGLAAQYGVFFDDSKYDYMQHLKPMGEAPDAVFVGPEEVAKKPSGNIEDLFRDQLPSEESRRVDNVLENIPKELQGFNPDLDPRLREVIEALEDEAYIEPEASDKEEKDVFAELLASGEVEDDDEFYYGSAAEDDEWDMDNYEDIYAKYDAPDGQDVQDMPYNEGEAPEEALAPGEVPMTNSSWQKDFHKFKVETKNQANEWDSDDDFDDDDDDHYDEEDRDVLPDLPNYNDAKPNKKISKTKQRKKKGAMTDTTSFSMTSSALFRTEGLTLLDDRFEQLSKKYEQDEEPEYENFKMENERSDFDSMLDDFLDNYDLEKGGRRLVKKDAELKRLQEAADSVSKGKAANRRKQNSSVDKLGRAFNSMKLSNQQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.58
4 0.49
5 0.39
6 0.36
7 0.34
8 0.35
9 0.33
10 0.26
11 0.19
12 0.23
13 0.24
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.2
26 0.25
27 0.26
28 0.26
29 0.29
30 0.35
31 0.42
32 0.45
33 0.47
34 0.45
35 0.43
36 0.46
37 0.49
38 0.45
39 0.38
40 0.38
41 0.39
42 0.35
43 0.37
44 0.36
45 0.29
46 0.27
47 0.27
48 0.22
49 0.18
50 0.24
51 0.29
52 0.35
53 0.37
54 0.37
55 0.43
56 0.44
57 0.43
58 0.4
59 0.33
60 0.25
61 0.23
62 0.22
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.22
77 0.24
78 0.26
79 0.28
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.28
84 0.23
85 0.21
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.07
96 0.08
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.26
107 0.27
108 0.28
109 0.23
110 0.21
111 0.18
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.19
116 0.22
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.26
121 0.24
122 0.23
123 0.23
124 0.24
125 0.26
126 0.24
127 0.24
128 0.23
129 0.22
130 0.21
131 0.18
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.11
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.11
169 0.09
170 0.1
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.2
244 0.28
245 0.32
246 0.34
247 0.42
248 0.43
249 0.49
250 0.58
251 0.59
252 0.59
253 0.59
254 0.61
255 0.53
256 0.56
257 0.49
258 0.4
259 0.37
260 0.31
261 0.25
262 0.2
263 0.2
264 0.16
265 0.14
266 0.13
267 0.1
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.24
290 0.26
291 0.31
292 0.35
293 0.44
294 0.47
295 0.53
296 0.61
297 0.64
298 0.73
299 0.78
300 0.83
301 0.84
302 0.88
303 0.9
304 0.89
305 0.88
306 0.87
307 0.86
308 0.82
309 0.78
310 0.72
311 0.65
312 0.57
313 0.48
314 0.37
315 0.28
316 0.22
317 0.15
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.19
339 0.21
340 0.24
341 0.26
342 0.3
343 0.31
344 0.35
345 0.38
346 0.35
347 0.36
348 0.34
349 0.33
350 0.29
351 0.27
352 0.22
353 0.18
354 0.21
355 0.19
356 0.24
357 0.26
358 0.28
359 0.3
360 0.32
361 0.31
362 0.26
363 0.28
364 0.21
365 0.18
366 0.16
367 0.12
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.15
377 0.16
378 0.21
379 0.27
380 0.29
381 0.31
382 0.4
383 0.47
384 0.49
385 0.58
386 0.6
387 0.63
388 0.66
389 0.65
390 0.63
391 0.58
392 0.51
393 0.43
394 0.36
395 0.32
396 0.32
397 0.3
398 0.25
399 0.23
400 0.24
401 0.23
402 0.28
403 0.32
404 0.37
405 0.45
406 0.55
407 0.62
408 0.68
409 0.76
410 0.8
411 0.81
412 0.79
413 0.8
414 0.74
415 0.72
416 0.68
417 0.65
418 0.55
419 0.5
420 0.44
421 0.4
422 0.42
423 0.38
424 0.38