FuNGI

A0A4Y7SCQ3

Protein Details

Accession

A0A4Y7SCQ3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
752-772	VGPSRLRFNRRKEQATKKVMV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N

Amino Acid Sequences

MLSRTARRLEKTSLLVSRQSLPRPRVSSSPVSTPHPQNQHTTPPRRQLPSPLPPSSTPVLPVPLLSSSPGPSTSFLARPTRFTILPAPLPKDDKAKDTIFTDTVTQDKLAVMDACLYNLHNVPRAKMLFNRLRATNKAILTIDMYNRLLSAYLQMAVREEVGRKQWVHDAWNLFTAMTRSEEDMSPDHTSYALMLYAWHHRNGHRRPLDYRALSDLITADPRKPSLIDIVAHPAISTPEIARDIMTQLSRIALEDKDTKTVNALAKAVVIASGEKIDTRTRRCRVEALKDADGNVTSEVPFKIQNLRDHLTSIAYARQVLPDDMVARQRHLELAAYDMAEDRVEKVQEYMHNWHERLRKKLAEEVKLIEKEEGEGMFRNSATELTPYLTLVAPDRLSMITILEIMRLTGTGGSRGPDGNVWTDFGYSNLYQRRLGESWTAEWTQLTRAQVGSVLLECLMGVAEVDKQAVDRNTGRVDTQPAIYHGYEYIRGTKKVPPRIYRRGPRELVMEGLNVLGRTPWRINKPVFDVVLKVWNAGERLGKVPPAVYDKPEPALPEDESDLNARSRWIEKKSFPRRDDLLPAQPRLPWPRLPHPPHLNHIGDDLSRGLLKFADSKPLGIHLANLHGFDKADFDGRVDWVDQRLELIKDSAKNPLGGERWWMKADDPWQCLATGDPLAYESSLPVHQDGTVNLAPVDRPSDVYTFVKDKVDKLIEKDAENGNEKVVKQTVMTTVYGLHKQLEDRGDISPDIVGPSRLRFNRRKEQATKKVMVGVGKLRKVVEEAEASGAKKVQKGQKKVPVVGMANFRKEQMTSVPYRKLARKQVMTNLQSVFISDPNVQSEVNTMKQASAFPPNFVHSLDATHMMLTAIECSRQDLTFASVHDSYWTHACDIDEMSKVIRRTFIKLHDSERLRKLHEEFMERYKGYLVPIMHLQQNTTLNKKLVEAGVRVKMTAEKAKHYAMLGKLVEVVEEQDAGASTAVIEDVSLPSAAAQAADILASLGMAEEDVVESKVETKEKEERRVKMEVAERNLLNKFIDVTSVLPPVPDRGTFDVNQIKESQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.51
3	0.48
4	0.5
5	0.49
6	0.52
7	0.53
8	0.52
9	0.57
10	0.57
11	0.58
12	0.57
13	0.57
14	0.58
15	0.54
16	0.58
17	0.53
18	0.55
19	0.59
20	0.59
21	0.61
22	0.61
23	0.59
24	0.57
25	0.59
26	0.64
27	0.66
28	0.69
29	0.69
30	0.7
31	0.76
32	0.74
33	0.72
34	0.72
35	0.71
36	0.72
37	0.72
38	0.67
39	0.63
40	0.59
41	0.61
42	0.54
43	0.45
44	0.37
45	0.31
46	0.3
47	0.25
48	0.24
49	0.21
50	0.19
51	0.19
52	0.18
53	0.17
54	0.16
55	0.17
56	0.19
57	0.18
58	0.18
59	0.21
60	0.23
61	0.25
62	0.29
63	0.36
64	0.36
65	0.38
66	0.42
67	0.43
68	0.39
69	0.39
70	0.41
71	0.38
72	0.44
73	0.45
74	0.45
75	0.45
76	0.48
77	0.48
78	0.49
79	0.45
80	0.42
81	0.42
82	0.4
83	0.38
84	0.37
85	0.39
86	0.31
87	0.3
88	0.28
89	0.24
90	0.24
91	0.22
92	0.2
93	0.16
94	0.15
95	0.14
96	0.14
97	0.13
98	0.11
99	0.14
100	0.14
101	0.14
102	0.14
103	0.15
104	0.15
105	0.17
106	0.19
107	0.21
108	0.23
109	0.24
110	0.31
111	0.32
112	0.33
113	0.35
114	0.42
115	0.44
116	0.5
117	0.53
118	0.51
119	0.54
120	0.54
121	0.56
122	0.53
123	0.45
124	0.43
125	0.38
126	0.34
127	0.32
128	0.32
129	0.28
130	0.26
131	0.25
132	0.21
133	0.2
134	0.19
135	0.16
136	0.13
137	0.13
138	0.1
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.14
143	0.14
144	0.15
145	0.14
146	0.14
147	0.16
148	0.2
149	0.25
150	0.24
151	0.26
152	0.31
153	0.32
154	0.34
155	0.36
156	0.36
157	0.33
158	0.35
159	0.33
160	0.26
161	0.24
162	0.22
163	0.17
164	0.15
165	0.15
166	0.14
167	0.16
168	0.17
169	0.19
170	0.19
171	0.22
172	0.23
173	0.22
174	0.2
175	0.18
176	0.17
177	0.15
178	0.14
179	0.1
180	0.06
181	0.07
182	0.09
183	0.17
184	0.2
185	0.22
186	0.24
187	0.29
188	0.39
189	0.45
190	0.54
191	0.52
192	0.55
193	0.56
194	0.61
195	0.65
196	0.58
197	0.53
198	0.47
199	0.41
200	0.37
201	0.33
202	0.27
203	0.19
204	0.21
205	0.2
206	0.17
207	0.18
208	0.19
209	0.19
210	0.19
211	0.19
212	0.19
213	0.22
214	0.2
215	0.2
216	0.26
217	0.26
218	0.25
219	0.23
220	0.18
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.07
225	0.1
226	0.11
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.15
232	0.15
233	0.13
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.1
240	0.13
241	0.19
242	0.2
243	0.23
244	0.23
245	0.22
246	0.22
247	0.27
248	0.26
249	0.23
250	0.22
251	0.19
252	0.18
253	0.18
254	0.16
255	0.11
256	0.08
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.09
263	0.14
264	0.2
265	0.27
266	0.36
267	0.41
268	0.46
269	0.49
270	0.55
271	0.57
272	0.61
273	0.63
274	0.6
275	0.59
276	0.54
277	0.52
278	0.45
279	0.37
280	0.28
281	0.2
282	0.14
283	0.09
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.11
288	0.11
289	0.18
290	0.23
291	0.28
292	0.33
293	0.35
294	0.34
295	0.35
296	0.34
297	0.28
298	0.23
299	0.19
300	0.15
301	0.13
302	0.13
303	0.12
304	0.13
305	0.14
306	0.13
307	0.12
308	0.11
309	0.12
310	0.13
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.18
315	0.18
316	0.17
317	0.17
318	0.16
319	0.1
320	0.13
321	0.13
322	0.11
323	0.11
324	0.11
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.08
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.13
334	0.16
335	0.21
336	0.24
337	0.28
338	0.32
339	0.32
340	0.38
341	0.42
342	0.45
343	0.46
344	0.48
345	0.45
346	0.43
347	0.5
348	0.51
349	0.49
350	0.46
351	0.43
352	0.44
353	0.41
354	0.4
355	0.32
356	0.25
357	0.2
358	0.19
359	0.16
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.1
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.06
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.12
413	0.1
414	0.15
415	0.17
416	0.19
417	0.19
418	0.2
419	0.24
420	0.22
421	0.23
422	0.22
423	0.2
424	0.2
425	0.22
426	0.21
427	0.17
428	0.16
429	0.15
430	0.14
431	0.15
432	0.14
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.1
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.03
447	0.02
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.07
455	0.07
456	0.1
457	0.11
458	0.13
459	0.14
460	0.15
461	0.16
462	0.15
463	0.17
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.14
468	0.17
469	0.16
470	0.15
471	0.13
472	0.12
473	0.13
474	0.12
475	0.18
476	0.18
477	0.19
478	0.2
479	0.26
480	0.32
481	0.39
482	0.46
483	0.46
484	0.53
485	0.62
486	0.69
487	0.72
488	0.72
489	0.72
490	0.66
491	0.6
492	0.54
493	0.45
494	0.37
495	0.28
496	0.21
497	0.13
498	0.12
499	0.1
500	0.07
501	0.06
502	0.05
503	0.04
504	0.07
505	0.09
506	0.13
507	0.17
508	0.22
509	0.23
510	0.26
511	0.31
512	0.32
513	0.31
514	0.27
515	0.24
516	0.2
517	0.24
518	0.21
519	0.16
520	0.13
521	0.13
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.08
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.16
533	0.16
534	0.17
535	0.18
536	0.19
537	0.2
538	0.2
539	0.19
540	0.14
541	0.16
542	0.14
543	0.13
544	0.13
545	0.12
546	0.12
547	0.13
548	0.12
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.09
553	0.13
554	0.17
555	0.21
556	0.25
557	0.3
558	0.41
559	0.52
560	0.6
561	0.57
562	0.58
563	0.57
564	0.54
565	0.55
566	0.49
567	0.48
568	0.42
569	0.42
570	0.38
571	0.35
572	0.36
573	0.34
574	0.33
575	0.28
576	0.29
577	0.36
578	0.45
579	0.49
580	0.55
581	0.58
582	0.58
583	0.57
584	0.58
585	0.51
586	0.41
587	0.37
588	0.29
589	0.21
590	0.18
591	0.15
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.07
596	0.06
597	0.07
598	0.11
599	0.11
600	0.18
601	0.18
602	0.18
603	0.18
604	0.2
605	0.21
606	0.16
607	0.17
608	0.1
609	0.13
610	0.13
611	0.14
612	0.12
613	0.11
614	0.11
615	0.1
616	0.11
617	0.08
618	0.09
619	0.08
620	0.09
621	0.09
622	0.1
623	0.11
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.1
628	0.09
629	0.09
630	0.11
631	0.11
632	0.1
633	0.11
634	0.12
635	0.14
636	0.15
637	0.2
638	0.19
639	0.19
640	0.19
641	0.22
642	0.21
643	0.19
644	0.23
645	0.2
646	0.22
647	0.22
648	0.22
649	0.18
650	0.2
651	0.25
652	0.28
653	0.27
654	0.26
655	0.26
656	0.25
657	0.25
658	0.22
659	0.18
660	0.11
661	0.09
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.07
667	0.05
668	0.06
669	0.07
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.09
675	0.09
676	0.14
677	0.13
678	0.13
679	0.13
680	0.13
681	0.12
682	0.11
683	0.14
684	0.08
685	0.09
686	0.11
687	0.12
688	0.15
689	0.16
690	0.18
691	0.18
692	0.2
693	0.22
694	0.21
695	0.21
696	0.25
697	0.29
698	0.27
699	0.29
700	0.35
701	0.33
702	0.33
703	0.36
704	0.33
705	0.31
706	0.33
707	0.29
708	0.22
709	0.23
710	0.23
711	0.21
712	0.2
713	0.17
714	0.14
715	0.15
716	0.17
717	0.17
718	0.17
719	0.14
720	0.16
721	0.18
722	0.2
723	0.18
724	0.16
725	0.15
726	0.15
727	0.19
728	0.18
729	0.17
730	0.17
731	0.17
732	0.18
733	0.16
734	0.16
735	0.12
736	0.1
737	0.1
738	0.09
739	0.1
740	0.09
741	0.12
742	0.19
743	0.22
744	0.3
745	0.36
746	0.45
747	0.54
748	0.61
749	0.68
750	0.7
751	0.78
752	0.8
753	0.81
754	0.75
755	0.66
756	0.62
757	0.55
758	0.47
759	0.39
760	0.37
761	0.35
762	0.34
763	0.34
764	0.29
765	0.28
766	0.28
767	0.26
768	0.21
769	0.16
770	0.15
771	0.17
772	0.19
773	0.19
774	0.18
775	0.2
776	0.17
777	0.18
778	0.24
779	0.28
780	0.36
781	0.43
782	0.52
783	0.59
784	0.64
785	0.64
786	0.62
787	0.6
788	0.54
789	0.5
790	0.5
791	0.44
792	0.42
793	0.4
794	0.36
795	0.3
796	0.28
797	0.26
798	0.22
799	0.24
800	0.26
801	0.32
802	0.36
803	0.39
804	0.44
805	0.49
806	0.52
807	0.56
808	0.58
809	0.6
810	0.6
811	0.66
812	0.7
813	0.66
814	0.62
815	0.53
816	0.45
817	0.37
818	0.33
819	0.25
820	0.16
821	0.17
822	0.14
823	0.14
824	0.15
825	0.16
826	0.15
827	0.14
828	0.17
829	0.18
830	0.18
831	0.19
832	0.17
833	0.16
834	0.17
835	0.19
836	0.18
837	0.24
838	0.23
839	0.23
840	0.25
841	0.27
842	0.27
843	0.26
844	0.26
845	0.16
846	0.17
847	0.17
848	0.17
849	0.15
850	0.14
851	0.13
852	0.11
853	0.11
854	0.09
855	0.1
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.12
860	0.14
861	0.13
862	0.14
863	0.12
864	0.15
865	0.16
866	0.17
867	0.19
868	0.18
869	0.18
870	0.19
871	0.19
872	0.17
873	0.19
874	0.19
875	0.15
876	0.16
877	0.17
878	0.16
879	0.18
880	0.19
881	0.17
882	0.16
883	0.18
884	0.2
885	0.21
886	0.2
887	0.24
888	0.24
889	0.28
890	0.34
891	0.4
892	0.44
893	0.47
894	0.5
895	0.53
896	0.57
897	0.59
898	0.6
899	0.56
900	0.52
901	0.53
902	0.52
903	0.51
904	0.51
905	0.5
906	0.46
907	0.49
908	0.53
909	0.47
910	0.44
911	0.38
912	0.33
913	0.28
914	0.29
915	0.23
916	0.18
917	0.23
918	0.25
919	0.27
920	0.26
921	0.26
922	0.26
923	0.33
924	0.34
925	0.35
926	0.36
927	0.34
928	0.34
929	0.35
930	0.33
931	0.3
932	0.3
933	0.29
934	0.31
935	0.36
936	0.35
937	0.34
938	0.31
939	0.31
940	0.32
941	0.36
942	0.32
943	0.31
944	0.35
945	0.37
946	0.38
947	0.36
948	0.37
949	0.31
950	0.36
951	0.3
952	0.27
953	0.27
954	0.25
955	0.24
956	0.18
957	0.18
958	0.11
959	0.1
960	0.1
961	0.08
962	0.08
963	0.08
964	0.08
965	0.06
966	0.05
967	0.05
968	0.05
969	0.05
970	0.04
971	0.05
972	0.05
973	0.07
974	0.07
975	0.06
976	0.07
977	0.08
978	0.08
979	0.07
980	0.06
981	0.05
982	0.06
983	0.06
984	0.05
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.03
990	0.03
991	0.03
992	0.03
993	0.03
994	0.04
995	0.05
996	0.06
997	0.06
998	0.07
999	0.11
1000	0.15
1001	0.18
1002	0.19
1003	0.24
1004	0.33
1005	0.41
1006	0.52
1007	0.56
1008	0.59
1009	0.61
1010	0.65
1011	0.61
1012	0.59
1013	0.59
1014	0.56
1015	0.55
1016	0.55
1017	0.51
1018	0.5
1019	0.5
1020	0.44
1021	0.36
1022	0.29
1023	0.25
1024	0.18
1025	0.19
1026	0.16
1027	0.16
1028	0.18
1029	0.2
1030	0.19
1031	0.17
1032	0.18
1033	0.2
1034	0.22
1035	0.21
1036	0.22
1037	0.25
1038	0.31
1039	0.31
1040	0.38
1041	0.42
1042	0.4
1043	0.41
1044	0.38
1045	0.35
1046	0.33

A0A4Y7SCQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer