Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7TZD4

Protein Details
Accession A0A4Y7TZD4    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-53SSAPSSSSQKRLTKKQQKALAFRDRKSGKRTKGSSKDDDLHydrophilic
146-166EVEKGQPRKKKKQAGKEGEDSBasic
328-354VEETHRGGKKHVRGKKKPKTLGTGVNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-45KKQQKALAFRDRKSGKRTK
93-126KKGDTTSKGKGKRKGEDGDAKVEVAAKLGGKRKR
150-163GQPRKKKKQAGKEG
265-290KVKERNKGLLSQRQKKVEAADKGKKK
333-346RGGKKHVRGKKKPK
Subcellular Location(s) mito 21, mito_nucl 13.333, cyto_mito 11.833, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSLVTPAPVSTLSSSAPSSSSQKRLTKKQQKALAFRDRKSGKRTKGSSKDDDLAEMDANAIPAMEDQDLASLTGGEVEVAAVLDQAQDQERGKKGDTTSKGKGKRKGEDGDAKVEVAAKLGGKRKREQDEEGEGEGVAMDVDGGVEVEKGQPRKKKKQAGKEGEDSRKQKFILFVGNLQYTTPKEAIQKHFAACDPPPEIRLLTPKPRPGVTARPKSKGCAFLEFKSKVGLQQALKLHQSMLDGRMINVELTAGGGGKSETRINKVKERNKGLLSQRQKKVEAADKGKKKNASQETLSRPDRPQRWSSTSGLDEAATAKKTWTVGDVVEETHRGGKKHVRGKKKPKTLGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.18
5 0.23
6 0.28
7 0.35
8 0.41
9 0.48
10 0.56
11 0.65
12 0.74
13 0.78
14 0.81
15 0.83
16 0.83
17 0.84
18 0.86
19 0.85
20 0.84
21 0.82
22 0.73
23 0.74
24 0.72
25 0.69
26 0.69
27 0.69
28 0.68
29 0.7
30 0.75
31 0.76
32 0.8
33 0.82
34 0.8
35 0.77
36 0.73
37 0.63
38 0.58
39 0.48
40 0.39
41 0.31
42 0.23
43 0.17
44 0.12
45 0.11
46 0.09
47 0.07
48 0.05
49 0.05
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.06
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.05
73 0.06
74 0.09
75 0.1
76 0.16
77 0.19
78 0.21
79 0.23
80 0.26
81 0.28
82 0.35
83 0.4
84 0.42
85 0.47
86 0.54
87 0.62
88 0.65
89 0.7
90 0.69
91 0.69
92 0.7
93 0.66
94 0.66
95 0.66
96 0.61
97 0.59
98 0.51
99 0.44
100 0.36
101 0.33
102 0.24
103 0.15
104 0.13
105 0.09
106 0.13
107 0.2
108 0.24
109 0.27
110 0.32
111 0.4
112 0.46
113 0.5
114 0.5
115 0.5
116 0.53
117 0.52
118 0.48
119 0.4
120 0.32
121 0.27
122 0.22
123 0.15
124 0.08
125 0.04
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.05
135 0.08
136 0.11
137 0.17
138 0.23
139 0.32
140 0.43
141 0.52
142 0.6
143 0.66
144 0.74
145 0.8
146 0.83
147 0.81
148 0.79
149 0.78
150 0.75
151 0.74
152 0.65
153 0.56
154 0.5
155 0.44
156 0.37
157 0.3
158 0.25
159 0.24
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.19
166 0.19
167 0.12
168 0.14
169 0.12
170 0.1
171 0.14
172 0.2
173 0.25
174 0.28
175 0.3
176 0.28
177 0.29
178 0.28
179 0.26
180 0.21
181 0.2
182 0.17
183 0.15
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.2
189 0.2
190 0.26
191 0.31
192 0.34
193 0.35
194 0.35
195 0.37
196 0.35
197 0.41
198 0.43
199 0.49
200 0.5
201 0.55
202 0.55
203 0.56
204 0.55
205 0.52
206 0.45
207 0.43
208 0.42
209 0.39
210 0.47
211 0.45
212 0.4
213 0.35
214 0.33
215 0.26
216 0.25
217 0.27
218 0.19
219 0.24
220 0.27
221 0.28
222 0.29
223 0.27
224 0.24
225 0.2
226 0.21
227 0.16
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.15
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.07
246 0.11
247 0.12
248 0.18
249 0.25
250 0.3
251 0.39
252 0.48
253 0.54
254 0.6
255 0.66
256 0.67
257 0.63
258 0.66
259 0.65
260 0.65
261 0.68
262 0.69
263 0.68
264 0.67
265 0.66
266 0.6
267 0.59
268 0.58
269 0.57
270 0.56
271 0.59
272 0.63
273 0.68
274 0.72
275 0.7
276 0.64
277 0.65
278 0.64
279 0.61
280 0.58
281 0.6
282 0.62
283 0.66
284 0.66
285 0.61
286 0.57
287 0.59
288 0.59
289 0.57
290 0.56
291 0.55
292 0.59
293 0.59
294 0.57
295 0.55
296 0.51
297 0.46
298 0.39
299 0.31
300 0.24
301 0.22
302 0.22
303 0.17
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.19
313 0.19
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.24
319 0.26
320 0.22
321 0.27
322 0.34
323 0.42
324 0.51
325 0.58
326 0.63
327 0.71
328 0.82
329 0.87
330 0.89
331 0.9
332 0.88
333 0.88
334 0.85
335 0.84
336 0.78
337 0.75
338 0.64