Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Y7SKP8

Protein Details
Accession A0A4Y7SKP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-512ALQKKDREKAERNKSRRRMRGGBasic
804-828MKSYAKPTGKYPPKKKPGEQAQGNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-512KKDREKAERNKSRRRMRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, nucl 10, cyto 9, cysk 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSTLLPFHKAILEEIHDPATSDLLVLARGLGLRRVVCSLLQIYDSPKSLVLLVNATTEEETAIGEELSIHGITALYKGGGLIMVTSRILVVDMLTGDIPIKLISGILVLNAEKVTPLVLESFVIRLLREKNTNAFVKAFTDQPEHITSGLSPLKNIMKELRIRRVHIYPRFHETIKKSLERRKADVVELSQGMTESMADIHHAIIQCMTATLAELKRSNTSLDLDDLTVENAYFKSFSVIVRKQLDPTKQLVSDLATLRNLLYYLLTYDAFEFNGYLDNLIESNTVTASGGAKVNQSPWTMTDAAHVIFDTGRRRCFTLSSTSKTLPTVIDVDEDEDAWEALNEAQGIQVDAKGKSVASRPGWLPSTVDPVLEELPKWELLTDVLQEIEEETVRIESMKKPPPILGSNTVLIMASSTRTCNLIKDFLATYDPNGKKGAKGRTMMMRRLRLYLWWKGKLVERKEQGRGSFAMPSGSSIRDAKKQSETDISEALQKKDREKAERNKSRRRMRGGAPASSDSRPTQPTPEANSGKVEEAVLAEFFATQATAESGLTPFDIANVNSAALDFGSQLLESEFNDHYGLVAPEETVLIRAYSDDSDDRILAELQPRFIVMYEPNMEFIRRIEVYRSSHPGLGVRVYHMVYGNSCEEHQYLAGIRKEKDSFERLIKERGSMLLPIIEEKREGAGYSEDTVKTISSRYAGGRRELNTEPSKVIVDLREFRSSLPSLLHAANNLVVPATLTVGDYIVTPDICVERKSIPDLMSSFNSGRLYTQCEIMSVHYKHPVLLIEFEEDKAFSLDTIGEMKSYAKPTGKYPPKKKPGEQAQGNSPAYSSIALQSKIVLLTLSFPRLRIIWSSSPFATAEIFNDLKRNNPEPDHIKAVATGADDDPDVGAGVNTSAEELLRCLPGITPKNVKYVMSKVRNLRELCEMDVMGLQDLLGVEPGKACWEFIHKGEGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.23
4 0.23
5 0.21
6 0.18
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.08
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.22
25 0.22
26 0.2
27 0.21
28 0.2
29 0.22
30 0.25
31 0.26
32 0.23
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.14
113 0.18
114 0.23
115 0.27
116 0.3
117 0.33
118 0.4
119 0.44
120 0.41
121 0.39
122 0.34
123 0.33
124 0.31
125 0.29
126 0.25
127 0.25
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.25
132 0.23
133 0.22
134 0.18
135 0.21
136 0.26
137 0.22
138 0.19
139 0.22
140 0.27
141 0.27
142 0.29
143 0.27
144 0.28
145 0.36
146 0.44
147 0.5
148 0.5
149 0.52
150 0.55
151 0.6
152 0.63
153 0.63
154 0.64
155 0.58
156 0.61
157 0.62
158 0.58
159 0.56
160 0.51
161 0.51
162 0.51
163 0.54
164 0.53
165 0.58
166 0.66
167 0.65
168 0.66
169 0.66
170 0.61
171 0.57
172 0.55
173 0.49
174 0.44
175 0.38
176 0.33
177 0.24
178 0.21
179 0.18
180 0.12
181 0.1
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.05
197 0.06
198 0.1
199 0.11
200 0.15
201 0.16
202 0.18
203 0.2
204 0.22
205 0.22
206 0.19
207 0.2
208 0.18
209 0.19
210 0.18
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.12
225 0.2
226 0.23
227 0.29
228 0.34
229 0.35
230 0.37
231 0.43
232 0.45
233 0.4
234 0.4
235 0.38
236 0.34
237 0.34
238 0.3
239 0.26
240 0.26
241 0.24
242 0.22
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.14
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.05
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.15
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.09
295 0.09
296 0.12
297 0.16
298 0.18
299 0.2
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.25
305 0.29
306 0.33
307 0.36
308 0.39
309 0.39
310 0.39
311 0.37
312 0.36
313 0.25
314 0.21
315 0.17
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.07
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.14
344 0.19
345 0.18
346 0.21
347 0.21
348 0.25
349 0.27
350 0.25
351 0.24
352 0.19
353 0.24
354 0.21
355 0.2
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.1
384 0.18
385 0.25
386 0.26
387 0.27
388 0.29
389 0.33
390 0.35
391 0.35
392 0.31
393 0.26
394 0.25
395 0.25
396 0.23
397 0.18
398 0.15
399 0.11
400 0.07
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.1
408 0.12
409 0.14
410 0.14
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.17
415 0.15
416 0.14
417 0.21
418 0.21
419 0.2
420 0.22
421 0.21
422 0.22
423 0.28
424 0.34
425 0.3
426 0.31
427 0.33
428 0.39
429 0.44
430 0.48
431 0.48
432 0.46
433 0.42
434 0.42
435 0.39
436 0.35
437 0.36
438 0.37
439 0.37
440 0.34
441 0.34
442 0.33
443 0.39
444 0.42
445 0.41
446 0.41
447 0.4
448 0.42
449 0.47
450 0.48
451 0.43
452 0.38
453 0.34
454 0.28
455 0.24
456 0.2
457 0.16
458 0.13
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.12
463 0.11
464 0.13
465 0.18
466 0.2
467 0.21
468 0.26
469 0.26
470 0.27
471 0.31
472 0.3
473 0.26
474 0.26
475 0.23
476 0.24
477 0.25
478 0.24
479 0.24
480 0.24
481 0.24
482 0.3
483 0.33
484 0.35
485 0.42
486 0.51
487 0.56
488 0.65
489 0.72
490 0.75
491 0.81
492 0.83
493 0.82
494 0.79
495 0.74
496 0.69
497 0.71
498 0.65
499 0.58
500 0.51
501 0.46
502 0.41
503 0.35
504 0.32
505 0.23
506 0.21
507 0.21
508 0.19
509 0.2
510 0.2
511 0.23
512 0.26
513 0.34
514 0.33
515 0.31
516 0.32
517 0.3
518 0.27
519 0.24
520 0.18
521 0.1
522 0.08
523 0.08
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.09
591 0.14
592 0.14
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.13
599 0.08
600 0.12
601 0.14
602 0.14
603 0.16
604 0.16
605 0.16
606 0.15
607 0.15
608 0.15
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.2
613 0.24
614 0.28
615 0.33
616 0.3
617 0.3
618 0.3
619 0.3
620 0.25
621 0.24
622 0.2
623 0.16
624 0.16
625 0.15
626 0.16
627 0.15
628 0.14
629 0.12
630 0.14
631 0.13
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.12
637 0.11
638 0.09
639 0.11
640 0.16
641 0.19
642 0.22
643 0.22
644 0.26
645 0.28
646 0.29
647 0.32
648 0.3
649 0.3
650 0.33
651 0.39
652 0.37
653 0.42
654 0.4
655 0.37
656 0.33
657 0.31
658 0.26
659 0.19
660 0.17
661 0.13
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.13
666 0.12
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.11
671 0.1
672 0.11
673 0.12
674 0.13
675 0.16
676 0.15
677 0.15
678 0.15
679 0.14
680 0.12
681 0.12
682 0.11
683 0.09
684 0.11
685 0.15
686 0.22
687 0.24
688 0.27
689 0.32
690 0.32
691 0.36
692 0.36
693 0.4
694 0.37
695 0.36
696 0.33
697 0.29
698 0.28
699 0.23
700 0.23
701 0.18
702 0.2
703 0.24
704 0.27
705 0.29
706 0.28
707 0.28
708 0.31
709 0.3
710 0.25
711 0.21
712 0.19
713 0.18
714 0.2
715 0.2
716 0.15
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.12
721 0.09
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.07
737 0.1
738 0.11
739 0.11
740 0.13
741 0.14
742 0.16
743 0.2
744 0.23
745 0.21
746 0.24
747 0.25
748 0.27
749 0.26
750 0.27
751 0.24
752 0.24
753 0.24
754 0.21
755 0.21
756 0.19
757 0.24
758 0.21
759 0.24
760 0.2
761 0.2
762 0.21
763 0.23
764 0.3
765 0.25
766 0.27
767 0.3
768 0.3
769 0.29
770 0.3
771 0.29
772 0.22
773 0.23
774 0.22
775 0.2
776 0.2
777 0.21
778 0.19
779 0.16
780 0.15
781 0.13
782 0.12
783 0.08
784 0.08
785 0.07
786 0.08
787 0.1
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.11
792 0.15
793 0.18
794 0.21
795 0.23
796 0.24
797 0.29
798 0.4
799 0.49
800 0.55
801 0.62
802 0.69
803 0.75
804 0.82
805 0.84
806 0.83
807 0.84
808 0.84
809 0.83
810 0.77
811 0.75
812 0.76
813 0.71
814 0.6
815 0.49
816 0.38
817 0.3
818 0.25
819 0.17
820 0.13
821 0.17
822 0.18
823 0.18
824 0.18
825 0.18
826 0.18
827 0.17
828 0.12
829 0.08
830 0.12
831 0.15
832 0.2
833 0.19
834 0.19
835 0.21
836 0.21
837 0.23
838 0.22
839 0.26
840 0.28
841 0.32
842 0.36
843 0.34
844 0.36
845 0.34
846 0.31
847 0.26
848 0.18
849 0.16
850 0.18
851 0.19
852 0.18
853 0.22
854 0.22
855 0.27
856 0.33
857 0.36
858 0.36
859 0.38
860 0.46
861 0.46
862 0.52
863 0.52
864 0.46
865 0.42
866 0.36
867 0.34
868 0.28
869 0.24
870 0.2
871 0.14
872 0.14
873 0.13
874 0.13
875 0.11
876 0.1
877 0.08
878 0.06
879 0.06
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.05
884 0.05
885 0.05
886 0.06
887 0.06
888 0.08
889 0.1
890 0.11
891 0.11
892 0.11
893 0.13
894 0.22
895 0.28
896 0.32
897 0.39
898 0.41
899 0.48
900 0.5
901 0.49
902 0.45
903 0.49
904 0.53
905 0.53
906 0.57
907 0.59
908 0.66
909 0.72
910 0.68
911 0.61
912 0.6
913 0.54
914 0.49
915 0.45
916 0.36
917 0.29
918 0.3
919 0.27
920 0.19
921 0.15
922 0.12
923 0.09
924 0.09
925 0.09
926 0.08
927 0.08
928 0.08
929 0.09
930 0.09
931 0.12
932 0.12
933 0.13
934 0.13
935 0.2
936 0.23
937 0.24