Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7SKP8

Protein Details
Accession A0A4Y7SKP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-512ALQKKDREKAERNKSRRRMRGGBasic
804-828MKSYAKPTGKYPPKKKPGEQAQGNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-512KKDREKAERNKSRRRMRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, nucl 10, cyto 9, cysk 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSTLLPFHKAILEEIHDPATSDLLVLARGLGLRRVVCSLLQIYDSPKSLVLLVNATTEEETAIGEELSIHGITALYKGGGLIMVTSRILVVDMLTGDIPIKLISGILVLNAEKVTPLVLESFVIRLLREKNTNAFVKAFTDQPEHITSGLSPLKNIMKELRIRRVHIYPRFHETIKKSLERRKADVVELSQGMTESMADIHHAIIQCMTATLAELKRSNTSLDLDDLTVENAYFKSFSVIVRKQLDPTKQLVSDLATLRNLLYYLLTYDAFEFNGYLDNLIESNTVTASGGAKVNQSPWTMTDAAHVIFDTGRRRCFTLSSTSKTLPTVIDVDEDEDAWEALNEAQGIQVDAKGKSVASRPGWLPSTVDPVLEELPKWELLTDVLQEIEEETVRIESMKKPPPILGSNTVLIMASSTRTCNLIKDFLATYDPNGKKGAKGRTMMMRRLRLYLWWKGKLVERKEQGRGSFAMPSGSSIRDAKKQSETDISEALQKKDREKAERNKSRRRMRGGAPASSDSRPTQPTPEANSGKVEEAVLAEFFATQATAESGLTPFDIANVNSAALDFGSQLLESEFNDHYGLVAPEETVLIRAYSDDSDDRILAELQPRFIVMYEPNMEFIRRIEVYRSSHPGLGVRVYHMVYGNSCEEHQYLAGIRKEKDSFERLIKERGSMLLPIIEEKREGAGYSEDTVKTISSRYAGGRRELNTEPSKVIVDLREFRSSLPSLLHAANNLVVPATLTVGDYIVTPDICVERKSIPDLMSSFNSGRLYTQCEIMSVHYKHPVLLIEFEEDKAFSLDTIGEMKSYAKPTGKYPPKKKPGEQAQGNSPAYSSIALQSKIVLLTLSFPRLRIIWSSSPFATAEIFNDLKRNNPEPDHIKAVATGADDDPDVGAGVNTSAEELLRCLPGITPKNVKYVMSKVRNLRELCEMDVMGLQDLLGVEPGKACWEFIHKGEGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.23
4 0.23
5 0.21
6 0.18
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.08
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.22
25 0.22
26 0.2
27 0.21
28 0.2
29 0.22
30 0.25
31 0.26
32 0.23
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.14
113 0.18
114 0.23
115 0.27
116 0.3
117 0.33
118 0.4
119 0.44
120 0.41
121 0.39
122 0.34
123 0.33
124 0.31
125 0.29
126 0.25
127 0.25
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.25
132 0.23
133 0.22
134 0.18
135 0.21
136 0.26
137 0.22
138 0.19
139 0.22
140 0.27
141 0.27
142 0.29
143 0.27
144 0.28
145 0.36
146 0.44
147 0.5
148 0.5
149 0.52
150 0.55
151 0.6
152 0.63
153 0.63
154 0.64
155 0.58
156 0.61
157 0.62
158 0.58
159 0.56
160 0.51
161 0.51
162 0.51
163 0.54
164 0.53
165 0.58
166 0.66
167 0.65
168 0.66
169 0.66
170 0.61
171 0.57
172 0.55
173 0.49
174 0.44
175 0.38
176 0.33
177 0.24
178 0.21
179 0.18
180 0.12
181 0.1
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.05
197 0.06
198 0.1
199 0.11
200 0.15
201 0.16
202 0.18
203 0.2
204 0.22
205 0.22
206 0.19
207 0.2
208 0.18
209 0.19
210 0.18
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.12
225 0.2
226 0.23
227 0.29
228 0.34
229 0.35
230 0.37
231 0.43
232 0.45
233 0.4
234 0.4
235 0.38
236 0.34
237 0.34
238 0.3
239 0.26
240 0.26
241 0.24
242 0.22
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.14
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.05
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.15
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.09
295 0.09
296 0.12
297 0.16
298 0.18
299 0.2
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.25
305 0.29
306 0.33
307 0.36
308 0.39
309 0.39
310 0.39
311 0.37
312 0.36
313 0.25
314 0.21
315 0.17
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.07
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.14
344 0.19
345 0.18
346 0.21
347 0.21
348 0.25
349 0.27
350 0.25
351 0.24
352 0.19
353 0.24
354 0.21
355 0.2
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.1
384 0.18
385 0.25
386 0.26
387 0.27
388 0.29
389 0.33
390 0.35
391 0.35
392 0.31
393 0.26
394 0.25
395 0.25
396 0.23
397 0.18
398 0.15
399 0.11
400 0.07
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.1
408 0.12
409 0.14
410 0.14
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.17
415 0.15
416 0.14
417 0.21
418 0.21
419 0.2
420 0.22
421 0.21
422 0.22
423 0.28
424 0.34
425 0.3
426 0.31
427 0.33
428 0.39
429 0.44
430 0.48
431 0.48
432 0.46
433 0.42
434 0.42
435 0.39
436 0.35
437 0.36
438 0.37
439 0.37
440 0.34
441 0.34
442 0.33
443 0.39
444 0.42
445 0.41
446 0.41
447 0.4
448 0.42
449 0.47
450 0.48
451 0.43
452 0.38
453 0.34
454 0.28
455 0.24
456 0.2
457 0.16
458 0.13
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.12
463 0.11
464 0.13
465 0.18
466 0.2
467 0.21
468 0.26
469 0.26
470 0.27
471 0.31
472 0.3
473 0.26
474 0.26
475 0.23
476 0.24
477 0.25
478 0.24
479 0.24
480 0.24
481 0.24
482 0.3
483 0.33
484 0.35
485 0.42
486 0.51
487 0.56
488 0.65
489 0.72
490 0.75
491 0.81
492 0.83
493 0.82
494 0.79
495 0.74
496 0.69
497 0.71
498 0.65
499 0.58
500 0.51
501 0.46
502 0.41
503 0.35
504 0.32
505 0.23
506 0.21
507 0.21
508 0.19
509 0.2
510 0.2
511 0.23
512 0.26
513 0.34
514 0.33
515 0.31
516 0.32
517 0.3
518 0.27
519 0.24
520 0.18
521 0.1
522 0.08
523 0.08
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.09
591 0.14
592 0.14
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.13
599 0.08
600 0.12
601 0.14
602 0.14
603 0.16
604 0.16
605 0.16
606 0.15
607 0.15
608 0.15
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.2
613 0.24
614 0.28
615 0.33
616 0.3
617 0.3
618 0.3
619 0.3
620 0.25
621 0.24
622 0.2
623 0.16
624 0.16
625 0.15
626 0.16
627 0.15
628 0.14
629 0.12
630 0.14
631 0.13
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.12
637 0.11
638 0.09
639 0.11
640 0.16
641 0.19
642 0.22
643 0.22
644 0.26
645 0.28
646 0.29
647 0.32
648 0.3
649 0.3
650 0.33
651 0.39
652 0.37
653 0.42
654 0.4
655 0.37
656 0.33
657 0.31
658 0.26
659 0.19
660 0.17
661 0.13
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.13
666 0.12
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.11
671 0.1
672 0.11
673 0.12
674 0.13
675 0.16
676 0.15
677 0.15
678 0.15
679 0.14
680 0.12
681 0.12
682 0.11
683 0.09
684 0.11
685 0.15
686 0.22
687 0.24
688 0.27
689 0.32
690 0.32
691 0.36
692 0.36
693 0.4
694 0.37
695 0.36
696 0.33
697 0.29
698 0.28
699 0.23
700 0.23
701 0.18
702 0.2
703 0.24
704 0.27
705 0.29
706 0.28
707 0.28
708 0.31
709 0.3
710 0.25
711 0.21
712 0.19
713 0.18
714 0.2
715 0.2
716 0.15
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.12
721 0.09
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.07
737 0.1
738 0.11
739 0.11
740 0.13
741 0.14
742 0.16
743 0.2
744 0.23
745 0.21
746 0.24
747 0.25
748 0.27
749 0.26
750 0.27
751 0.24
752 0.24
753 0.24
754 0.21
755 0.21
756 0.19
757 0.24
758 0.21
759 0.24
760 0.2
761 0.2
762 0.21
763 0.23
764 0.3
765 0.25
766 0.27
767 0.3
768 0.3
769 0.29
770 0.3
771 0.29
772 0.22
773 0.23
774 0.22
775 0.2
776 0.2
777 0.21
778 0.19
779 0.16
780 0.15
781 0.13
782 0.12
783 0.08
784 0.08
785 0.07
786 0.08
787 0.1
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.11
792 0.15
793 0.18
794 0.21
795 0.23
796 0.24
797 0.29
798 0.4
799 0.49
800 0.55
801 0.62
802 0.69
803 0.75
804 0.82
805 0.84
806 0.83
807 0.84
808 0.84
809 0.83
810 0.77
811 0.75
812 0.76
813 0.71
814 0.6
815 0.49
816 0.38
817 0.3
818 0.25
819 0.17
820 0.13
821 0.17
822 0.18
823 0.18
824 0.18
825 0.18
826 0.18
827 0.17
828 0.12
829 0.08
830 0.12
831 0.15
832 0.2
833 0.19
834 0.19
835 0.21
836 0.21
837 0.23
838 0.22
839 0.26
840 0.28
841 0.32
842 0.36
843 0.34
844 0.36
845 0.34
846 0.31
847 0.26
848 0.18
849 0.16
850 0.18
851 0.19
852 0.18
853 0.22
854 0.22
855 0.27
856 0.33
857 0.36
858 0.36
859 0.38
860 0.46
861 0.46
862 0.52
863 0.52
864 0.46
865 0.42
866 0.36
867 0.34
868 0.28
869 0.24
870 0.2
871 0.14
872 0.14
873 0.13
874 0.13
875 0.11
876 0.1
877 0.08
878 0.06
879 0.06
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.05
884 0.05
885 0.05
886 0.06
887 0.06
888 0.08
889 0.1
890 0.11
891 0.11
892 0.11
893 0.13
894 0.22
895 0.28
896 0.32
897 0.39
898 0.41
899 0.48
900 0.5
901 0.49
902 0.45
903 0.49
904 0.53
905 0.53
906 0.57
907 0.59
908 0.66
909 0.72
910 0.68
911 0.61
912 0.6
913 0.54
914 0.49
915 0.45
916 0.36
917 0.29
918 0.3
919 0.27
920 0.19
921 0.15
922 0.12
923 0.09
924 0.09
925 0.09
926 0.08
927 0.08
928 0.08
929 0.09
930 0.09
931 0.12
932 0.12
933 0.13
934 0.13
935 0.2
936 0.23
937 0.24