Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DFQ9

Protein Details
Accession A5DFQ9    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-97APSSTPSKHYKKPFDRHSRSGKSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-70PAKAKKKSKATGNEAALKNKANNK
79-101PSKHYKKPFDRHSRSGKSDSGKK
199-211KKAKAKAPKEKKF
225-263PRGDFGGRGRGGRDGNRGGNRGRGAPRGRGGNRGGAREG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_02110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MLLTQNLYHLLGNDVEDDSTPILATKEVVKNTTSSKKADVPPPSADPAKAKKKSKATGNEAALKNKANNKEVSAPSSTPSKHYKKPFDRHSRSGKSDSGKKIKQSWGQKSAADLEVEAEAEGAADAVAGLEEDAESAEPVDNTPKKSLADYIAELELKQKELDGAKKVRQANQGAESKWTSAEKIEKAEQGYVEPSVVKKAKAKAPKEKKFLEIDAKFADSEPAPRGDFGGRGRGGRDGNRGGNRGRGAPRGRGGNRGGAREGAGSAKPTVDDKNFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.15
13 0.2
14 0.22
15 0.24
16 0.24
17 0.26
18 0.33
19 0.41
20 0.37
21 0.34
22 0.37
23 0.43
24 0.48
25 0.54
26 0.53
27 0.49
28 0.51
29 0.52
30 0.53
31 0.46
32 0.42
33 0.41
34 0.44
35 0.49
36 0.53
37 0.55
38 0.59
39 0.67
40 0.72
41 0.75
42 0.75
43 0.73
44 0.73
45 0.73
46 0.73
47 0.67
48 0.63
49 0.55
50 0.47
51 0.43
52 0.41
53 0.41
54 0.36
55 0.35
56 0.35
57 0.41
58 0.41
59 0.4
60 0.37
61 0.32
62 0.3
63 0.34
64 0.3
65 0.27
66 0.34
67 0.37
68 0.41
69 0.49
70 0.58
71 0.63
72 0.72
73 0.79
74 0.81
75 0.83
76 0.83
77 0.85
78 0.82
79 0.77
80 0.72
81 0.66
82 0.61
83 0.61
84 0.61
85 0.6
86 0.55
87 0.54
88 0.56
89 0.58
90 0.59
91 0.61
92 0.61
93 0.59
94 0.58
95 0.54
96 0.49
97 0.45
98 0.39
99 0.29
100 0.21
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.09
105 0.06
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.18
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.13
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.09
148 0.12
149 0.16
150 0.19
151 0.23
152 0.26
153 0.33
154 0.35
155 0.39
156 0.42
157 0.42
158 0.4
159 0.43
160 0.44
161 0.38
162 0.39
163 0.34
164 0.28
165 0.27
166 0.23
167 0.16
168 0.14
169 0.19
170 0.18
171 0.21
172 0.23
173 0.24
174 0.25
175 0.26
176 0.23
177 0.19
178 0.19
179 0.15
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.15
184 0.17
185 0.17
186 0.21
187 0.27
188 0.34
189 0.42
190 0.5
191 0.54
192 0.64
193 0.72
194 0.74
195 0.72
196 0.7
197 0.66
198 0.63
199 0.63
200 0.52
201 0.47
202 0.41
203 0.39
204 0.34
205 0.29
206 0.26
207 0.16
208 0.18
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.21
216 0.2
217 0.26
218 0.24
219 0.25
220 0.26
221 0.29
222 0.31
223 0.31
224 0.36
225 0.34
226 0.4
227 0.45
228 0.47
229 0.44
230 0.47
231 0.44
232 0.44
233 0.43
234 0.43
235 0.42
236 0.46
237 0.5
238 0.53
239 0.53
240 0.53
241 0.52
242 0.53
243 0.53
244 0.5
245 0.46
246 0.37
247 0.36
248 0.3
249 0.29
250 0.22
251 0.19
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.16
256 0.18
257 0.23
258 0.24
259 0.28