Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DGH9

Protein Details
Accession A5DGH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-47APPPTPKPTPSQKPIPPKNPEEHydrophilic
989-1014VELKQKIHDFKIQKKQERRQETEDVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG pgu:PGUG_02380  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSSSNVAEKSPRTSNSDTKSPIAQAAPPPTPKPTPSQKPIPPKNPEELLSQWLTEELEPIFHASLSGNHDRVLTSLADELRDENRAFSASDLDSVFMQILTEMGPPSSFPIPLVYLFHVYQKSFQLKRVLPKKDQLYESKIGILNEIISLSCSYSLICFQMDDMFVNNDIKASVLRFVTSDDMSTFLVDIVKKSIEQETLTELMNIIFPTLAAELYTVNLNDRSYSQFLSVIETLVSIKPVAAIFYQLDGFQPPDPTQPLDFENKTLLGSMYRLSPLIDSISAYYFAETVEHGSSAQLSASYEALQNEYKVVSDRLYFITDKLIRGSPETRNALLKWFADLINLSHLRRGSHADLSKLPSDGIMFNISLMLIRLCGPFLDYPTYAKIDKIDMDFFGKSSLIDVSEESRINSSLSEATDYAKDQAGETNFISDCFFLTLAYFHYGVGGIYLHYDRLKSQIKQLSSRVELISNNRVPPGTNPMMSHLYRNQLPTLQKSLNKMKASKHAIQAIFGFRSMQLELFDFVIGTTTFFTRVVDPKHLFPKSKLKIPLYSIARVSELDDHEFLQTKTPKPWKYYPEYILEGVVNYCKFVTNFRNPPLFQNDEKLNSFVEFAVILLRCPELVGNPHMKAHLVEVLFVGTLPLMDGRPGFISNIYNTNELVRENILYALLDFYVMVEKTGASSQFYDKFNSRYCISVILEELWKHGTYREQLNHYSKHNVEFFVRFIARMLNDTTYLLDETFNELNSIHKYQQELKKRQAGAEPDTETFGNDEELNGNLDSAESKAKSYMGLTNKTMELFKLFTKSVPKGFVLPEIVDRLASMLNYNLAILVGPKCSNLKVQDPQKYEFDPRKTLGDLCEIYNNLATQNEFLVAVARDGRSFDVSYFNKAAQILSTKTYTDPRTIQTFQEFAAKAAKQKELDEDEELELGEVPDEFLDPLMFTLMEDPVILPGSKISIDRSTIKAHLLSDPTDPFNRMPLKLEDVKEDVELKQKIHDFKIQKKQERRQETEDVTMAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.61
4 0.59
5 0.55
6 0.55
7 0.5
8 0.47
9 0.4
10 0.38
11 0.36
12 0.4
13 0.43
14 0.44
15 0.44
16 0.46
17 0.48
18 0.46
19 0.47
20 0.51
21 0.55
22 0.58
23 0.66
24 0.69
25 0.76
26 0.84
27 0.86
28 0.84
29 0.79
30 0.78
31 0.73
32 0.66
33 0.61
34 0.53
35 0.49
36 0.42
37 0.36
38 0.29
39 0.25
40 0.24
41 0.18
42 0.17
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.14
52 0.2
53 0.25
54 0.24
55 0.24
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.23
60 0.17
61 0.12
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.18
68 0.22
69 0.21
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.16
75 0.18
76 0.15
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.1
84 0.09
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.2
101 0.18
102 0.21
103 0.21
104 0.26
105 0.26
106 0.25
107 0.27
108 0.32
109 0.38
110 0.37
111 0.41
112 0.45
113 0.47
114 0.57
115 0.63
116 0.64
117 0.61
118 0.67
119 0.7
120 0.69
121 0.7
122 0.66
123 0.64
124 0.6
125 0.55
126 0.52
127 0.46
128 0.38
129 0.34
130 0.27
131 0.2
132 0.16
133 0.15
134 0.1
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.14
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.12
173 0.09
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.19
189 0.16
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.16
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.23
217 0.21
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.16
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.22
247 0.26
248 0.26
249 0.24
250 0.24
251 0.22
252 0.21
253 0.19
254 0.16
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.22
307 0.23
308 0.22
309 0.23
310 0.23
311 0.21
312 0.24
313 0.28
314 0.24
315 0.3
316 0.32
317 0.31
318 0.31
319 0.31
320 0.31
321 0.3
322 0.26
323 0.2
324 0.18
325 0.17
326 0.15
327 0.15
328 0.12
329 0.17
330 0.19
331 0.17
332 0.18
333 0.19
334 0.19
335 0.2
336 0.24
337 0.2
338 0.25
339 0.27
340 0.27
341 0.29
342 0.33
343 0.32
344 0.27
345 0.24
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.12
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.05
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.15
370 0.18
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.13
375 0.15
376 0.16
377 0.15
378 0.13
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.12
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.12
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.12
411 0.12
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.06
441 0.13
442 0.18
443 0.18
444 0.25
445 0.29
446 0.32
447 0.35
448 0.38
449 0.37
450 0.34
451 0.35
452 0.28
453 0.25
454 0.24
455 0.24
456 0.28
457 0.25
458 0.23
459 0.22
460 0.21
461 0.2
462 0.2
463 0.24
464 0.19
465 0.18
466 0.18
467 0.21
468 0.26
469 0.25
470 0.26
471 0.21
472 0.22
473 0.22
474 0.23
475 0.2
476 0.2
477 0.21
478 0.22
479 0.25
480 0.25
481 0.26
482 0.3
483 0.37
484 0.4
485 0.41
486 0.41
487 0.39
488 0.44
489 0.48
490 0.47
491 0.44
492 0.43
493 0.4
494 0.38
495 0.37
496 0.3
497 0.24
498 0.19
499 0.16
500 0.1
501 0.11
502 0.1
503 0.08
504 0.07
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.06
518 0.07
519 0.08
520 0.12
521 0.14
522 0.2
523 0.21
524 0.24
525 0.32
526 0.34
527 0.33
528 0.33
529 0.42
530 0.39
531 0.44
532 0.46
533 0.42
534 0.43
535 0.45
536 0.49
537 0.41
538 0.4
539 0.34
540 0.29
541 0.27
542 0.23
543 0.21
544 0.17
545 0.14
546 0.14
547 0.13
548 0.13
549 0.13
550 0.15
551 0.14
552 0.16
553 0.19
554 0.19
555 0.25
556 0.33
557 0.36
558 0.4
559 0.47
560 0.47
561 0.51
562 0.56
563 0.53
564 0.5
565 0.49
566 0.43
567 0.37
568 0.31
569 0.23
570 0.17
571 0.15
572 0.1
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.12
578 0.18
579 0.25
580 0.31
581 0.35
582 0.4
583 0.4
584 0.44
585 0.46
586 0.43
587 0.35
588 0.34
589 0.33
590 0.31
591 0.32
592 0.28
593 0.23
594 0.18
595 0.18
596 0.14
597 0.11
598 0.07
599 0.06
600 0.09
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.05
609 0.08
610 0.12
611 0.15
612 0.16
613 0.17
614 0.17
615 0.18
616 0.17
617 0.15
618 0.16
619 0.11
620 0.11
621 0.1
622 0.11
623 0.1
624 0.09
625 0.08
626 0.04
627 0.03
628 0.03
629 0.04
630 0.03
631 0.04
632 0.04
633 0.05
634 0.06
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.09
639 0.1
640 0.16
641 0.17
642 0.16
643 0.16
644 0.17
645 0.16
646 0.15
647 0.15
648 0.1
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.04
659 0.04
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.07
666 0.09
667 0.09
668 0.08
669 0.1
670 0.13
671 0.19
672 0.2
673 0.23
674 0.23
675 0.27
676 0.29
677 0.31
678 0.29
679 0.25
680 0.24
681 0.26
682 0.24
683 0.21
684 0.19
685 0.17
686 0.18
687 0.16
688 0.17
689 0.14
690 0.14
691 0.13
692 0.13
693 0.15
694 0.17
695 0.25
696 0.29
697 0.31
698 0.38
699 0.44
700 0.46
701 0.45
702 0.48
703 0.41
704 0.41
705 0.39
706 0.33
707 0.31
708 0.28
709 0.26
710 0.26
711 0.24
712 0.19
713 0.18
714 0.19
715 0.17
716 0.17
717 0.18
718 0.14
719 0.14
720 0.15
721 0.15
722 0.13
723 0.13
724 0.11
725 0.09
726 0.09
727 0.13
728 0.13
729 0.12
730 0.11
731 0.11
732 0.13
733 0.16
734 0.19
735 0.16
736 0.18
737 0.21
738 0.29
739 0.38
740 0.46
741 0.49
742 0.53
743 0.6
744 0.6
745 0.59
746 0.57
747 0.54
748 0.48
749 0.48
750 0.43
751 0.35
752 0.36
753 0.33
754 0.27
755 0.22
756 0.18
757 0.12
758 0.09
759 0.09
760 0.08
761 0.09
762 0.1
763 0.1
764 0.09
765 0.07
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.12
773 0.12
774 0.13
775 0.14
776 0.2
777 0.22
778 0.27
779 0.27
780 0.29
781 0.3
782 0.3
783 0.29
784 0.23
785 0.19
786 0.16
787 0.17
788 0.18
789 0.18
790 0.19
791 0.26
792 0.29
793 0.3
794 0.32
795 0.31
796 0.3
797 0.31
798 0.32
799 0.28
800 0.25
801 0.24
802 0.23
803 0.22
804 0.19
805 0.17
806 0.14
807 0.12
808 0.11
809 0.09
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.07
815 0.06
816 0.06
817 0.08
818 0.08
819 0.1
820 0.1
821 0.11
822 0.13
823 0.14
824 0.19
825 0.22
826 0.28
827 0.34
828 0.43
829 0.51
830 0.54
831 0.56
832 0.56
833 0.56
834 0.57
835 0.56
836 0.53
837 0.5
838 0.47
839 0.48
840 0.45
841 0.43
842 0.37
843 0.37
844 0.32
845 0.28
846 0.3
847 0.27
848 0.26
849 0.26
850 0.24
851 0.17
852 0.17
853 0.15
854 0.12
855 0.12
856 0.11
857 0.09
858 0.09
859 0.11
860 0.1
861 0.11
862 0.13
863 0.13
864 0.13
865 0.14
866 0.16
867 0.16
868 0.16
869 0.16
870 0.22
871 0.23
872 0.29
873 0.29
874 0.28
875 0.27
876 0.27
877 0.27
878 0.2
879 0.23
880 0.2
881 0.21
882 0.22
883 0.21
884 0.23
885 0.3
886 0.29
887 0.3
888 0.32
889 0.33
890 0.39
891 0.4
892 0.42
893 0.39
894 0.38
895 0.33
896 0.38
897 0.34
898 0.27
899 0.32
900 0.3
901 0.3
902 0.34
903 0.39
904 0.32
905 0.33
906 0.4
907 0.38
908 0.41
909 0.39
910 0.37
911 0.32
912 0.31
913 0.29
914 0.21
915 0.16
916 0.13
917 0.1
918 0.07
919 0.06
920 0.06
921 0.06
922 0.06
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.06
927 0.07
928 0.07
929 0.06
930 0.08
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.08
936 0.1
937 0.1
938 0.08
939 0.08
940 0.1
941 0.11
942 0.12
943 0.15
944 0.17
945 0.22
946 0.26
947 0.29
948 0.32
949 0.32
950 0.34
951 0.33
952 0.3
953 0.32
954 0.31
955 0.3
956 0.3
957 0.31
958 0.33
959 0.33
960 0.34
961 0.29
962 0.34
963 0.37
964 0.33
965 0.35
966 0.34
967 0.4
968 0.44
969 0.46
970 0.43
971 0.41
972 0.41
973 0.39
974 0.37
975 0.31
976 0.32
977 0.33
978 0.28
979 0.32
980 0.37
981 0.4
982 0.42
983 0.49
984 0.49
985 0.57
986 0.67
987 0.7
988 0.75
989 0.8
990 0.85
991 0.87
992 0.9
993 0.87
994 0.84
995 0.83
996 0.78
997 0.74