Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DBE0

Protein Details
Accession A5DBE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-378LAANSPKKTTRNHHKPSKPRARAPHDDIGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-371KLKPKPSLAANSPKKTTRNHHKPSKPRARA
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 4, cyto 3, golg 3, plas 1, extr 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_00595  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPGFNPNAPSFSPSTSSSSTIELRVSGDNLTPDSLVQRVNLAIATHLANLNPSLTILSQIRPDPQSSDLIAVFLASSYIVASRAVALFNSLPSPLPWSVEASLINHNIEPSMPFYFPYPYPFFYPPPDPSIKPVPSFITNLVAGNKSDVSLITITDDEGAEIQVNPCRLFVGNIPFSSTWPSLKNFLVASVFAAEPHASLDIFRVEIPMQTSSSTDEMSSRGSSRGFAIVTTGNQETSELLIKLTNDTVFEGRSLTVRYDRFPDYNNYVVQNLFRNKHHRSPNMLGNLGYERNTIHHRLYYGSHTSPYSMQPPSQSQSHSSSQLSTQPSTVDSLSDTPTPPKLKPKPSLAANSPKKTTRNHHKPSKPRARAPHDDIGEEQRARELVDSFRSLGLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.33
4 0.3
5 0.32
6 0.31
7 0.29
8 0.27
9 0.22
10 0.22
11 0.21
12 0.2
13 0.18
14 0.18
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.16
19 0.14
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.12
43 0.13
44 0.14
45 0.17
46 0.19
47 0.24
48 0.24
49 0.26
50 0.24
51 0.25
52 0.27
53 0.24
54 0.25
55 0.2
56 0.19
57 0.17
58 0.14
59 0.12
60 0.08
61 0.07
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.15
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.19
88 0.17
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.17
93 0.16
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.13
102 0.16
103 0.16
104 0.21
105 0.22
106 0.21
107 0.26
108 0.29
109 0.29
110 0.3
111 0.35
112 0.31
113 0.34
114 0.36
115 0.32
116 0.34
117 0.4
118 0.39
119 0.35
120 0.35
121 0.31
122 0.3
123 0.31
124 0.27
125 0.22
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.17
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.17
159 0.19
160 0.18
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.24
165 0.22
166 0.16
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.21
247 0.24
248 0.24
249 0.25
250 0.29
251 0.28
252 0.31
253 0.31
254 0.28
255 0.26
256 0.25
257 0.24
258 0.26
259 0.26
260 0.26
261 0.29
262 0.36
263 0.4
264 0.48
265 0.56
266 0.54
267 0.57
268 0.6
269 0.63
270 0.62
271 0.57
272 0.49
273 0.42
274 0.39
275 0.32
276 0.27
277 0.19
278 0.14
279 0.15
280 0.19
281 0.2
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.22
286 0.24
287 0.27
288 0.29
289 0.27
290 0.27
291 0.25
292 0.26
293 0.26
294 0.27
295 0.26
296 0.23
297 0.23
298 0.25
299 0.29
300 0.31
301 0.32
302 0.31
303 0.3
304 0.34
305 0.36
306 0.36
307 0.33
308 0.31
309 0.3
310 0.34
311 0.34
312 0.29
313 0.26
314 0.23
315 0.23
316 0.23
317 0.21
318 0.15
319 0.13
320 0.15
321 0.16
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.25
326 0.28
327 0.3
328 0.38
329 0.45
330 0.52
331 0.59
332 0.65
333 0.66
334 0.7
335 0.76
336 0.73
337 0.75
338 0.75
339 0.74
340 0.7
341 0.68
342 0.65
343 0.64
344 0.67
345 0.67
346 0.69
347 0.72
348 0.78
349 0.83
350 0.88
351 0.92
352 0.93
353 0.91
354 0.9
355 0.9
356 0.89
357 0.88
358 0.86
359 0.84
360 0.75
361 0.67
362 0.61
363 0.57
364 0.55
365 0.46
366 0.38
367 0.31
368 0.29
369 0.27
370 0.26
371 0.22
372 0.2
373 0.25
374 0.28
375 0.26