Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DHD7

Protein Details
Accession A5DHD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
431-453VVKKYLQQQRYKKEQRENSKSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042403  Spt21/Ams2  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pgu:PGUG_02688  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
Amino Acid Sequences MEPTYQRMQVKVLYSFNDNPTVFLSRSRQQHSVKVVQIPSGENEDQICTLGAFDLRSCVNQITKSSPENFNLQAEDYAVYYKDITEQPDEPFVGNGVLSSLMGSAKSHVVPGRVCQNLSASFLFGDKNSSSLTLEIRLKLHTIEKSQENAQLAKRENSFAEMSSSKRTKKSNHPPPSSSNVPAAKATRTKSLPIFYHPHNQQIHNIINADKSNAPSRYDSKSVQDRFKSAPFMQAKILDDPNTLRKRKRGGDEPQRAMRTRSMLANTNGFNTTPGTTSPIQEEMYSDETDDTEYNDRTNAIEEGDEEEEEEEEAFDERSDHSPYTPQQPPYKPSNDQFESLPDFESLGKKTHTIPHSKLPHNHGLVCINENCSTVNSITWRYFEQKNHPPSLALLTAERFDKSLYNGMFGPLCNACYLFLRTKGFMRPPAVVKKYLQQQRYKKEQRENSKSRSDSISSAKGESSSSPFPRFVTPSHTPSMINQVIQNNRNKGKPVNNSNYDLNEFMNQLNAFGGPLTDIDPLPQDQGITPPMIATKSNTRVINLYDDEEDKENQPPSEDQDASQNSEFERLIKKSFSSDKQSSPNSQWIDTLFAQPTPKDGDKPTPIDGPKMRTFTIRSSPHKAGNMPIISLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.43
3 0.43
4 0.46
5 0.41
6 0.36
7 0.36
8 0.38
9 0.32
10 0.32
11 0.35
12 0.34
13 0.42
14 0.47
15 0.52
16 0.52
17 0.59
18 0.61
19 0.64
20 0.62
21 0.62
22 0.57
23 0.52
24 0.5
25 0.44
26 0.38
27 0.37
28 0.32
29 0.25
30 0.25
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.18
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.15
45 0.17
46 0.19
47 0.22
48 0.25
49 0.28
50 0.32
51 0.36
52 0.4
53 0.42
54 0.4
55 0.42
56 0.41
57 0.37
58 0.34
59 0.31
60 0.26
61 0.22
62 0.2
63 0.16
64 0.14
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.14
70 0.15
71 0.18
72 0.21
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.29
77 0.25
78 0.23
79 0.2
80 0.16
81 0.13
82 0.11
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.22
99 0.29
100 0.28
101 0.28
102 0.27
103 0.29
104 0.27
105 0.3
106 0.26
107 0.19
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.13
112 0.16
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.17
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.26
128 0.24
129 0.24
130 0.27
131 0.3
132 0.32
133 0.34
134 0.36
135 0.33
136 0.33
137 0.33
138 0.34
139 0.34
140 0.35
141 0.34
142 0.32
143 0.3
144 0.3
145 0.28
146 0.22
147 0.23
148 0.2
149 0.21
150 0.27
151 0.32
152 0.32
153 0.36
154 0.41
155 0.44
156 0.53
157 0.63
158 0.65
159 0.71
160 0.75
161 0.74
162 0.75
163 0.75
164 0.68
165 0.59
166 0.55
167 0.46
168 0.4
169 0.39
170 0.35
171 0.32
172 0.32
173 0.32
174 0.32
175 0.31
176 0.33
177 0.34
178 0.38
179 0.35
180 0.36
181 0.39
182 0.35
183 0.43
184 0.41
185 0.45
186 0.43
187 0.42
188 0.41
189 0.41
190 0.4
191 0.32
192 0.32
193 0.25
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.17
198 0.17
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.24
203 0.27
204 0.3
205 0.33
206 0.32
207 0.33
208 0.41
209 0.44
210 0.47
211 0.46
212 0.44
213 0.44
214 0.45
215 0.44
216 0.35
217 0.38
218 0.33
219 0.33
220 0.31
221 0.31
222 0.3
223 0.28
224 0.29
225 0.21
226 0.2
227 0.2
228 0.28
229 0.32
230 0.34
231 0.33
232 0.37
233 0.43
234 0.49
235 0.54
236 0.54
237 0.57
238 0.64
239 0.71
240 0.72
241 0.72
242 0.69
243 0.63
244 0.56
245 0.48
246 0.4
247 0.32
248 0.29
249 0.25
250 0.26
251 0.27
252 0.28
253 0.26
254 0.25
255 0.23
256 0.2
257 0.18
258 0.14
259 0.13
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.15
272 0.14
273 0.12
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.06
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.13
310 0.15
311 0.21
312 0.25
313 0.27
314 0.32
315 0.35
316 0.39
317 0.42
318 0.46
319 0.42
320 0.41
321 0.45
322 0.4
323 0.39
324 0.35
325 0.32
326 0.3
327 0.27
328 0.24
329 0.15
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.2
339 0.24
340 0.28
341 0.29
342 0.37
343 0.45
344 0.48
345 0.51
346 0.51
347 0.54
348 0.5
349 0.48
350 0.4
351 0.34
352 0.3
353 0.28
354 0.23
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.15
359 0.13
360 0.14
361 0.11
362 0.12
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.16
368 0.18
369 0.23
370 0.26
371 0.33
372 0.39
373 0.44
374 0.46
375 0.44
376 0.4
377 0.36
378 0.36
379 0.28
380 0.2
381 0.15
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.13
386 0.1
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.16
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.17
395 0.17
396 0.16
397 0.17
398 0.11
399 0.11
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.11
404 0.14
405 0.14
406 0.18
407 0.2
408 0.21
409 0.24
410 0.29
411 0.3
412 0.32
413 0.33
414 0.32
415 0.36
416 0.44
417 0.44
418 0.41
419 0.39
420 0.4
421 0.46
422 0.49
423 0.5
424 0.51
425 0.57
426 0.63
427 0.73
428 0.76
429 0.75
430 0.78
431 0.8
432 0.82
433 0.83
434 0.83
435 0.79
436 0.79
437 0.72
438 0.65
439 0.6
440 0.51
441 0.45
442 0.42
443 0.42
444 0.34
445 0.34
446 0.31
447 0.27
448 0.25
449 0.23
450 0.22
451 0.22
452 0.24
453 0.26
454 0.27
455 0.28
456 0.31
457 0.31
458 0.28
459 0.3
460 0.31
461 0.33
462 0.35
463 0.34
464 0.31
465 0.3
466 0.38
467 0.31
468 0.26
469 0.25
470 0.29
471 0.35
472 0.4
473 0.45
474 0.44
475 0.46
476 0.48
477 0.47
478 0.48
479 0.5
480 0.54
481 0.58
482 0.6
483 0.62
484 0.63
485 0.63
486 0.6
487 0.53
488 0.44
489 0.35
490 0.27
491 0.23
492 0.18
493 0.2
494 0.16
495 0.14
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.13
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.13
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.11
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.22
523 0.27
524 0.33
525 0.34
526 0.34
527 0.35
528 0.37
529 0.4
530 0.33
531 0.29
532 0.25
533 0.26
534 0.27
535 0.27
536 0.27
537 0.22
538 0.25
539 0.25
540 0.23
541 0.24
542 0.23
543 0.27
544 0.33
545 0.32
546 0.27
547 0.34
548 0.36
549 0.38
550 0.38
551 0.33
552 0.26
553 0.29
554 0.28
555 0.23
556 0.27
557 0.25
558 0.27
559 0.28
560 0.29
561 0.33
562 0.41
563 0.45
564 0.47
565 0.5
566 0.53
567 0.6
568 0.64
569 0.63
570 0.6
571 0.61
572 0.55
573 0.51
574 0.45
575 0.38
576 0.39
577 0.34
578 0.34
579 0.27
580 0.26
581 0.28
582 0.26
583 0.28
584 0.29
585 0.3
586 0.29
587 0.32
588 0.39
589 0.44
590 0.49
591 0.49
592 0.5
593 0.49
594 0.53
595 0.54
596 0.53
597 0.52
598 0.52
599 0.49
600 0.46
601 0.49
602 0.48
603 0.52
604 0.54
605 0.54
606 0.58
607 0.63
608 0.65
609 0.66
610 0.61
611 0.56
612 0.56
613 0.51