Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DGR7

Protein Details
Accession A5DGR7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-296VEKSKMIKNIQKKRNTQDEDDEMRRFYKQRKVTSTRAEAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_02468  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAKKNQAGGTESLFGVHDSDSEHPMSGSDVENEVSDAASDDENDFDSEEEELQIQETRKKLGIVDNFAKTEDKDDNDDDDDDDSDQESVSVPDGIQNHKLKKLTAEQLEKETKKIKKTGVCYLSRIPPYMKPSTLRTILSKFGKVDRLFLKPEDAATYNKRVKYGGNKKKNYTEGWVEFVKKREAKICASTMNGNKIGGRKTSYYYDDIMNIKYLPKFKWHDLTQQIAKENEVRSAKLALELSQQQKMNKSFINNVEKSKMIKNIQKKRNTQDEDDEMRRFYKQRKVTSTRAEAKDDLKVKSKPDDKLTNVLSKVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.14
4 0.1
5 0.1
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.12
21 0.1
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.12
41 0.13
42 0.17
43 0.18
44 0.2
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.27
49 0.32
50 0.36
51 0.4
52 0.41
53 0.4
54 0.4
55 0.4
56 0.32
57 0.29
58 0.25
59 0.21
60 0.22
61 0.23
62 0.25
63 0.26
64 0.26
65 0.23
66 0.2
67 0.18
68 0.15
69 0.13
70 0.11
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.2
83 0.25
84 0.27
85 0.32
86 0.33
87 0.3
88 0.33
89 0.38
90 0.38
91 0.41
92 0.44
93 0.41
94 0.47
95 0.55
96 0.51
97 0.46
98 0.47
99 0.43
100 0.42
101 0.45
102 0.44
103 0.42
104 0.47
105 0.53
106 0.54
107 0.52
108 0.51
109 0.5
110 0.5
111 0.45
112 0.42
113 0.34
114 0.3
115 0.34
116 0.33
117 0.31
118 0.27
119 0.3
120 0.33
121 0.34
122 0.31
123 0.29
124 0.28
125 0.32
126 0.31
127 0.29
128 0.25
129 0.25
130 0.31
131 0.28
132 0.31
133 0.28
134 0.29
135 0.28
136 0.28
137 0.27
138 0.2
139 0.2
140 0.18
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.24
145 0.25
146 0.26
147 0.26
148 0.24
149 0.25
150 0.33
151 0.42
152 0.45
153 0.52
154 0.56
155 0.59
156 0.64
157 0.66
158 0.57
159 0.5
160 0.46
161 0.38
162 0.37
163 0.35
164 0.32
165 0.3
166 0.3
167 0.32
168 0.27
169 0.27
170 0.28
171 0.3
172 0.31
173 0.33
174 0.33
175 0.28
176 0.29
177 0.32
178 0.3
179 0.31
180 0.28
181 0.24
182 0.23
183 0.24
184 0.25
185 0.21
186 0.21
187 0.18
188 0.21
189 0.24
190 0.26
191 0.25
192 0.25
193 0.24
194 0.25
195 0.24
196 0.22
197 0.19
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.2
202 0.17
203 0.23
204 0.27
205 0.3
206 0.38
207 0.39
208 0.45
209 0.47
210 0.53
211 0.5
212 0.49
213 0.49
214 0.4
215 0.39
216 0.35
217 0.31
218 0.31
219 0.27
220 0.24
221 0.22
222 0.24
223 0.22
224 0.21
225 0.21
226 0.15
227 0.18
228 0.24
229 0.25
230 0.29
231 0.31
232 0.3
233 0.36
234 0.38
235 0.37
236 0.34
237 0.35
238 0.36
239 0.43
240 0.51
241 0.47
242 0.48
243 0.47
244 0.46
245 0.45
246 0.43
247 0.43
248 0.4
249 0.44
250 0.52
251 0.59
252 0.66
253 0.73
254 0.76
255 0.77
256 0.81
257 0.79
258 0.74
259 0.72
260 0.72
261 0.7
262 0.67
263 0.6
264 0.51
265 0.46
266 0.44
267 0.4
268 0.38
269 0.4
270 0.43
271 0.51
272 0.6
273 0.66
274 0.72
275 0.77
276 0.8
277 0.81
278 0.76
279 0.72
280 0.65
281 0.6
282 0.6
283 0.55
284 0.49
285 0.46
286 0.45
287 0.44
288 0.51
289 0.55
290 0.53
291 0.57
292 0.63
293 0.6
294 0.65
295 0.67
296 0.64