Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DNJ5

Protein Details
Accession A5DNJ5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-38SASNAANKLKPRSKPKPLAGDPPTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 9, nucl 5, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034352  Rim4_RRM1  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_04846  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12453  RRM1_RIM4_like  
Amino Acid Sequences MSSPKPLVSSVSVLSASNAANKLKPRSKPKPLAGDPPTSTTEKENQDPQSSEDSERGRPSACVFVASLCSTTADDDLCVSVTNLFEKWGKITRVKVLRDTRNRPYAFVQYTNDKDAAAAIKEAQGAFLDSRKIRCEPAKVNRTLFLSSPRPIANDDITKSLGEFGPIERLVSSMYFTNPEKSPSPFSKGWYCQFVYRDDAITAFASLSESDKYSIEWAQNIDTLKAAQLGDSIKPKFDRCAIFIGQLSSDTTEKELRERFKPHGEIESLSIINNRDFNTFAFLRYTTERSAAKAVEAENHSLFKRRTMHVQFREFGSTKKFNYSANGVALAPPPIRFGRKLATVRERTPANHSQRDGGRNFERGQGDGRGPERVNEHRRLDRRSDGGHRANESRYEGRYEGRSEADRNPGRGHENQRWNRAPREYGSYAPPYSSEPYAQVTPNKYGPLSPEAQRFNRRLNGSYPNDMDSRNPAPTTPFYYYVPDTSYYGGYPYYSPGMYSQDEQKGKEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.18
4 0.19
5 0.22
6 0.2
7 0.24
8 0.3
9 0.39
10 0.44
11 0.52
12 0.58
13 0.65
14 0.74
15 0.8
16 0.84
17 0.85
18 0.83
19 0.85
20 0.8
21 0.78
22 0.69
23 0.63
24 0.58
25 0.49
26 0.44
27 0.38
28 0.41
29 0.38
30 0.4
31 0.43
32 0.44
33 0.48
34 0.48
35 0.47
36 0.47
37 0.44
38 0.41
39 0.39
40 0.38
41 0.37
42 0.38
43 0.36
44 0.3
45 0.28
46 0.29
47 0.3
48 0.27
49 0.24
50 0.21
51 0.21
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.14
56 0.15
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.17
75 0.23
76 0.27
77 0.3
78 0.34
79 0.41
80 0.48
81 0.5
82 0.56
83 0.58
84 0.64
85 0.7
86 0.73
87 0.73
88 0.74
89 0.71
90 0.65
91 0.6
92 0.58
93 0.52
94 0.49
95 0.44
96 0.42
97 0.44
98 0.44
99 0.4
100 0.31
101 0.27
102 0.24
103 0.23
104 0.16
105 0.13
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.22
119 0.23
120 0.26
121 0.3
122 0.36
123 0.41
124 0.49
125 0.57
126 0.58
127 0.58
128 0.57
129 0.55
130 0.49
131 0.41
132 0.37
133 0.33
134 0.3
135 0.31
136 0.28
137 0.26
138 0.26
139 0.28
140 0.25
141 0.25
142 0.25
143 0.24
144 0.24
145 0.23
146 0.21
147 0.2
148 0.15
149 0.12
150 0.11
151 0.09
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.07
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.16
165 0.16
166 0.19
167 0.2
168 0.22
169 0.27
170 0.27
171 0.34
172 0.31
173 0.34
174 0.39
175 0.42
176 0.42
177 0.41
178 0.39
179 0.36
180 0.36
181 0.35
182 0.31
183 0.27
184 0.26
185 0.2
186 0.19
187 0.16
188 0.15
189 0.13
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.14
207 0.14
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.22
225 0.22
226 0.19
227 0.24
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.22
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.14
242 0.18
243 0.2
244 0.25
245 0.28
246 0.3
247 0.34
248 0.37
249 0.34
250 0.34
251 0.32
252 0.28
253 0.26
254 0.25
255 0.19
256 0.16
257 0.16
258 0.13
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.19
273 0.15
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.2
278 0.18
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.18
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.21
289 0.21
290 0.21
291 0.25
292 0.24
293 0.33
294 0.39
295 0.49
296 0.52
297 0.57
298 0.53
299 0.5
300 0.55
301 0.46
302 0.39
303 0.37
304 0.33
305 0.29
306 0.32
307 0.31
308 0.26
309 0.29
310 0.31
311 0.27
312 0.23
313 0.23
314 0.19
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.14
319 0.11
320 0.13
321 0.13
322 0.15
323 0.15
324 0.17
325 0.2
326 0.28
327 0.31
328 0.36
329 0.44
330 0.47
331 0.48
332 0.51
333 0.49
334 0.42
335 0.46
336 0.47
337 0.46
338 0.47
339 0.45
340 0.46
341 0.5
342 0.54
343 0.48
344 0.46
345 0.41
346 0.39
347 0.39
348 0.39
349 0.35
350 0.29
351 0.31
352 0.28
353 0.26
354 0.26
355 0.26
356 0.25
357 0.24
358 0.25
359 0.27
360 0.33
361 0.39
362 0.42
363 0.47
364 0.51
365 0.57
366 0.61
367 0.61
368 0.58
369 0.56
370 0.55
371 0.56
372 0.57
373 0.58
374 0.56
375 0.54
376 0.51
377 0.48
378 0.46
379 0.43
380 0.38
381 0.33
382 0.33
383 0.3
384 0.3
385 0.32
386 0.31
387 0.29
388 0.29
389 0.3
390 0.29
391 0.32
392 0.39
393 0.39
394 0.39
395 0.38
396 0.38
397 0.4
398 0.44
399 0.48
400 0.47
401 0.55
402 0.59
403 0.67
404 0.71
405 0.72
406 0.71
407 0.68
408 0.63
409 0.55
410 0.57
411 0.5
412 0.45
413 0.46
414 0.44
415 0.39
416 0.35
417 0.33
418 0.28
419 0.28
420 0.27
421 0.23
422 0.19
423 0.23
424 0.25
425 0.28
426 0.3
427 0.3
428 0.33
429 0.35
430 0.35
431 0.31
432 0.29
433 0.3
434 0.3
435 0.31
436 0.31
437 0.36
438 0.41
439 0.48
440 0.55
441 0.54
442 0.56
443 0.59
444 0.58
445 0.53
446 0.52
447 0.55
448 0.53
449 0.57
450 0.52
451 0.47
452 0.45
453 0.42
454 0.39
455 0.35
456 0.34
457 0.3
458 0.29
459 0.26
460 0.29
461 0.33
462 0.38
463 0.36
464 0.35
465 0.33
466 0.38
467 0.4
468 0.37
469 0.35
470 0.3
471 0.26
472 0.25
473 0.25
474 0.2
475 0.18
476 0.17
477 0.15
478 0.14
479 0.16
480 0.17
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.22
485 0.23
486 0.25
487 0.3
488 0.36
489 0.4