Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7TXT7

Protein Details
Accession A0A4Y7TXT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-224IDFVLTKKKGRPNRNDKTRRTKTAMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-218KKKGRPNRNDKTR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 4.333, cyto 4, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MTLCPAPSPRHADPMLQPSYFTSSLYTEPLRQDILQLVAAFQEAYATNDSKSPFATFKHVWRSQRWHLLHLRVFDNRTRENFLIVTCRLLLEKTEQEESLLTRLTALLSLYTFYATQPLNTTPPLWYLKHVPIPIDQFRDLHDLENELASSELENMKSVVSYVLRYFHESDVFVVLPDSKLCPQNPRSLPRETYVDQRRIDFVLTKKKGRPNRNDKTRRTKTAMANLESWLEITETLVERSPAVAGGSVSTPVAADRTNEYKSLKAQFLDAIDSQDSKGLPTVVNANQLVLQRLQEVRELVPEEDISSDSPTNAGISRVERAIEDLGKGRNRGILNLLEGSGKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.52
3 0.43
4 0.41
5 0.35
6 0.4
7 0.36
8 0.29
9 0.22
10 0.2
11 0.21
12 0.25
13 0.26
14 0.23
15 0.25
16 0.27
17 0.27
18 0.25
19 0.25
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.15
27 0.13
28 0.09
29 0.09
30 0.07
31 0.09
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.16
36 0.18
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.27
43 0.27
44 0.34
45 0.43
46 0.48
47 0.5
48 0.56
49 0.62
50 0.63
51 0.7
52 0.64
53 0.62
54 0.62
55 0.66
56 0.62
57 0.58
58 0.53
59 0.47
60 0.48
61 0.44
62 0.44
63 0.4
64 0.39
65 0.41
66 0.37
67 0.35
68 0.33
69 0.3
70 0.3
71 0.25
72 0.24
73 0.17
74 0.17
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.18
80 0.19
81 0.21
82 0.2
83 0.2
84 0.21
85 0.21
86 0.17
87 0.14
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.12
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.13
110 0.17
111 0.21
112 0.19
113 0.19
114 0.22
115 0.26
116 0.3
117 0.3
118 0.27
119 0.26
120 0.32
121 0.33
122 0.33
123 0.29
124 0.24
125 0.25
126 0.28
127 0.25
128 0.2
129 0.17
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.12
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.1
151 0.11
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.1
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.11
168 0.12
169 0.19
170 0.21
171 0.3
172 0.35
173 0.4
174 0.41
175 0.43
176 0.44
177 0.4
178 0.42
179 0.34
180 0.38
181 0.4
182 0.42
183 0.39
184 0.38
185 0.37
186 0.32
187 0.32
188 0.27
189 0.25
190 0.29
191 0.32
192 0.36
193 0.4
194 0.48
195 0.56
196 0.61
197 0.67
198 0.67
199 0.74
200 0.81
201 0.85
202 0.87
203 0.89
204 0.88
205 0.84
206 0.8
207 0.77
208 0.72
209 0.72
210 0.69
211 0.61
212 0.54
213 0.47
214 0.41
215 0.33
216 0.26
217 0.17
218 0.1
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.11
244 0.15
245 0.17
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.27
250 0.31
251 0.3
252 0.26
253 0.26
254 0.26
255 0.25
256 0.27
257 0.22
258 0.2
259 0.18
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.12
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.18
270 0.17
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.23
275 0.24
276 0.25
277 0.2
278 0.19
279 0.17
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.2
284 0.18
285 0.22
286 0.24
287 0.21
288 0.21
289 0.2
290 0.18
291 0.17
292 0.17
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.14
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.19
309 0.22
310 0.21
311 0.21
312 0.22
313 0.28
314 0.32
315 0.32
316 0.31
317 0.32
318 0.32
319 0.32
320 0.32
321 0.29
322 0.28
323 0.29
324 0.29