Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7SQS9

Protein Details
Accession A0A4Y7SQS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-117RVTVSHPKKAEKTKKWVPIPAEHydrophilic
130-150SKDGRDRSSTRKNPNRGPPSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
559-594RRGGTGPRMPRPFDGDRERDRGDGRGPRRGTGARSG
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 8, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences METAKAPIVNVWSVRKEQLAARATSSTAASSASSFPSTVSSSSSTKVPSTTSFVAATKAQQSASSPSKVPPMTDEESWPDVTASLSIGKEVNGKERVTVSHPKKAEKTKKWVPIPAEELQAAADAHKATSKDGRDRSSTRKNPNRGPPSQAASTSQSRVQSRSGSVQSSPRNAGRRRLPAERDSNGYGADLLRPHRPSSSARSSKSSSPHLLPGHNLPPMPHPSLPHPPHLAFPPYPGLVPPGLSPVLTPSGGEGGVDYVTYPFAHPLFSSSRSLPINGMDSIRAAAAVQFGSIPAPTNSSTITASQPPSTTETIGQEAAGRQMVIGVAPEEMDAVVRGVKSVAISGSVSSSGPRTILQQPQQATPNGKWEFGTASGAPAPASAEGEVVAQVARLLDVVAEDGTPSMAKLSPLSMSLSASPKAGQVPLASAGAASELPGRPPGLGLSQAQRPPGLTAKRPLVSGSGAHSNSPPLTGPIRVRSSSGTDEDFEVKDYGFGFGQGGARTGDPAREGIIAREWEMLRDKQKGMVAAAHSTAPGVVPSQPHSQYHHAPGGRDERRGGTGPRMPRPFDGDRERDRGDGRGPRRGTGARSGPSTGGGGPQNRNRRSNLPQTGLSPSPGPHVPPPFSNHPHAPPLHIPPFMPVPFMHGGALPLGVIPPGVDGMPSPTYYGGMRPGFMPQPPTGAVSFLPPLPPPPPLPPQLLPLAGSSPPSAASPTASTSTGAAVVAPPVPAPLTAVPFPLDPTRYYLLGQLEYYLSPQNMAKDFFLKKKMDSRGWIPISLIASFNRVKKLTLDANLVKEVLYLSSMVQVRDEWVRMGGWERFVLPDAEESVAPEFDQGVNLNHPPYPMLNGVYVGVPTPPVMFGLGAPSPPAESRSKAAPNGVVSNGDSVSGTEDEEDDVVFVYKSEVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.33
4 0.33
5 0.38
6 0.38
7 0.36
8 0.36
9 0.35
10 0.34
11 0.33
12 0.3
13 0.21
14 0.15
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.18
27 0.2
28 0.21
29 0.23
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.25
34 0.24
35 0.24
36 0.29
37 0.3
38 0.3
39 0.3
40 0.29
41 0.3
42 0.28
43 0.29
44 0.26
45 0.25
46 0.22
47 0.21
48 0.23
49 0.28
50 0.32
51 0.32
52 0.3
53 0.3
54 0.38
55 0.37
56 0.36
57 0.32
58 0.34
59 0.34
60 0.34
61 0.36
62 0.33
63 0.36
64 0.35
65 0.32
66 0.24
67 0.2
68 0.19
69 0.16
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.18
77 0.19
78 0.25
79 0.26
80 0.26
81 0.28
82 0.3
83 0.31
84 0.33
85 0.42
86 0.4
87 0.44
88 0.48
89 0.52
90 0.58
91 0.66
92 0.71
93 0.7
94 0.74
95 0.75
96 0.82
97 0.82
98 0.8
99 0.74
100 0.71
101 0.67
102 0.61
103 0.54
104 0.44
105 0.38
106 0.31
107 0.28
108 0.19
109 0.14
110 0.12
111 0.09
112 0.09
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.21
117 0.26
118 0.33
119 0.39
120 0.43
121 0.48
122 0.53
123 0.6
124 0.64
125 0.67
126 0.7
127 0.73
128 0.77
129 0.8
130 0.85
131 0.85
132 0.78
133 0.77
134 0.72
135 0.68
136 0.62
137 0.55
138 0.48
139 0.44
140 0.44
141 0.38
142 0.35
143 0.36
144 0.35
145 0.35
146 0.35
147 0.33
148 0.32
149 0.37
150 0.37
151 0.33
152 0.34
153 0.39
154 0.41
155 0.42
156 0.44
157 0.42
158 0.47
159 0.48
160 0.54
161 0.55
162 0.6
163 0.6
164 0.65
165 0.65
166 0.65
167 0.69
168 0.64
169 0.6
170 0.53
171 0.48
172 0.39
173 0.33
174 0.25
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.2
180 0.21
181 0.23
182 0.23
183 0.26
184 0.28
185 0.34
186 0.43
187 0.45
188 0.46
189 0.51
190 0.53
191 0.55
192 0.56
193 0.54
194 0.48
195 0.43
196 0.47
197 0.44
198 0.43
199 0.4
200 0.4
201 0.37
202 0.35
203 0.32
204 0.26
205 0.28
206 0.32
207 0.33
208 0.29
209 0.27
210 0.31
211 0.41
212 0.42
213 0.43
214 0.42
215 0.39
216 0.4
217 0.41
218 0.41
219 0.3
220 0.3
221 0.29
222 0.24
223 0.24
224 0.21
225 0.2
226 0.15
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.14
256 0.17
257 0.2
258 0.19
259 0.24
260 0.24
261 0.25
262 0.22
263 0.2
264 0.2
265 0.18
266 0.18
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.06
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.21
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.17
303 0.16
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.09
309 0.06
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.11
343 0.15
344 0.22
345 0.26
346 0.3
347 0.31
348 0.34
349 0.37
350 0.35
351 0.34
352 0.28
353 0.33
354 0.29
355 0.28
356 0.25
357 0.23
358 0.21
359 0.19
360 0.21
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.06
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.15
435 0.16
436 0.17
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.2
441 0.21
442 0.18
443 0.21
444 0.25
445 0.26
446 0.26
447 0.25
448 0.2
449 0.18
450 0.17
451 0.15
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.15
457 0.14
458 0.14
459 0.12
460 0.08
461 0.09
462 0.11
463 0.13
464 0.17
465 0.2
466 0.2
467 0.21
468 0.21
469 0.23
470 0.23
471 0.23
472 0.18
473 0.16
474 0.17
475 0.18
476 0.16
477 0.14
478 0.12
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.08
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.12
502 0.11
503 0.12
504 0.15
505 0.14
506 0.14
507 0.17
508 0.2
509 0.2
510 0.23
511 0.23
512 0.22
513 0.24
514 0.23
515 0.21
516 0.21
517 0.18
518 0.16
519 0.16
520 0.13
521 0.12
522 0.1
523 0.09
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.06
528 0.07
529 0.11
530 0.16
531 0.17
532 0.19
533 0.23
534 0.27
535 0.29
536 0.32
537 0.34
538 0.31
539 0.3
540 0.33
541 0.38
542 0.36
543 0.34
544 0.31
545 0.27
546 0.29
547 0.3
548 0.27
549 0.24
550 0.27
551 0.31
552 0.38
553 0.39
554 0.38
555 0.37
556 0.43
557 0.39
558 0.41
559 0.43
560 0.42
561 0.44
562 0.48
563 0.48
564 0.43
565 0.41
566 0.36
567 0.34
568 0.36
569 0.34
570 0.37
571 0.37
572 0.36
573 0.39
574 0.39
575 0.36
576 0.35
577 0.38
578 0.32
579 0.33
580 0.33
581 0.29
582 0.27
583 0.25
584 0.18
585 0.15
586 0.16
587 0.18
588 0.22
589 0.29
590 0.37
591 0.41
592 0.44
593 0.44
594 0.48
595 0.51
596 0.56
597 0.56
598 0.51
599 0.49
600 0.48
601 0.49
602 0.43
603 0.37
604 0.28
605 0.21
606 0.2
607 0.19
608 0.19
609 0.19
610 0.23
611 0.24
612 0.25
613 0.3
614 0.35
615 0.38
616 0.41
617 0.4
618 0.39
619 0.43
620 0.41
621 0.39
622 0.35
623 0.39
624 0.38
625 0.35
626 0.31
627 0.28
628 0.33
629 0.29
630 0.26
631 0.19
632 0.2
633 0.21
634 0.21
635 0.19
636 0.14
637 0.14
638 0.13
639 0.13
640 0.07
641 0.05
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.03
646 0.03
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.08
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.12
658 0.13
659 0.16
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.19
664 0.2
665 0.21
666 0.23
667 0.17
668 0.19
669 0.2
670 0.21
671 0.18
672 0.17
673 0.16
674 0.15
675 0.16
676 0.13
677 0.13
678 0.11
679 0.14
680 0.14
681 0.17
682 0.17
683 0.22
684 0.26
685 0.29
686 0.34
687 0.33
688 0.35
689 0.36
690 0.34
691 0.29
692 0.24
693 0.23
694 0.18
695 0.18
696 0.15
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.11
701 0.09
702 0.11
703 0.11
704 0.13
705 0.15
706 0.15
707 0.15
708 0.14
709 0.14
710 0.13
711 0.11
712 0.09
713 0.07
714 0.07
715 0.08
716 0.07
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.1
723 0.13
724 0.14
725 0.15
726 0.15
727 0.15
728 0.18
729 0.19
730 0.19
731 0.16
732 0.21
733 0.23
734 0.22
735 0.23
736 0.25
737 0.24
738 0.24
739 0.23
740 0.19
741 0.17
742 0.17
743 0.18
744 0.16
745 0.13
746 0.13
747 0.14
748 0.18
749 0.19
750 0.21
751 0.21
752 0.25
753 0.3
754 0.34
755 0.4
756 0.38
757 0.4
758 0.46
759 0.53
760 0.52
761 0.54
762 0.53
763 0.56
764 0.56
765 0.53
766 0.45
767 0.4
768 0.36
769 0.31
770 0.27
771 0.17
772 0.19
773 0.22
774 0.25
775 0.27
776 0.26
777 0.27
778 0.27
779 0.34
780 0.35
781 0.36
782 0.41
783 0.39
784 0.42
785 0.42
786 0.4
787 0.33
788 0.27
789 0.23
790 0.15
791 0.11
792 0.08
793 0.07
794 0.13
795 0.15
796 0.15
797 0.15
798 0.15
799 0.17
800 0.2
801 0.21
802 0.15
803 0.15
804 0.15
805 0.15
806 0.2
807 0.2
808 0.19
809 0.19
810 0.19
811 0.19
812 0.2
813 0.2
814 0.16
815 0.16
816 0.15
817 0.16
818 0.15
819 0.15
820 0.15
821 0.15
822 0.14
823 0.12
824 0.11
825 0.1
826 0.12
827 0.12
828 0.12
829 0.16
830 0.18
831 0.19
832 0.19
833 0.19
834 0.19
835 0.19
836 0.2
837 0.19
838 0.19
839 0.18
840 0.18
841 0.19
842 0.18
843 0.17
844 0.13
845 0.11
846 0.09
847 0.09
848 0.09
849 0.08
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.08
854 0.13
855 0.14
856 0.13
857 0.13
858 0.13
859 0.14
860 0.15
861 0.19
862 0.18
863 0.2
864 0.23
865 0.3
866 0.36
867 0.37
868 0.4
869 0.41
870 0.41
871 0.42
872 0.4
873 0.35
874 0.3
875 0.3
876 0.25
877 0.21
878 0.17
879 0.13
880 0.15
881 0.13
882 0.13
883 0.11
884 0.11
885 0.12
886 0.12
887 0.11
888 0.08
889 0.08
890 0.09
891 0.08
892 0.07