Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7T5V0

Protein Details
Accession A0A4Y7T5V0    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-82DEAAGKKRKRTTKIKDPNAPKRPPSBasic
250-271APAPKRTKRASSAQPKSKKHKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-79GKKRKRTTKIKDPNAPKR
172-172R
253-271PKRTKRASSAQPKSKKHKA
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MTKIDPREFEERRGKLVSGLFACAKQLQETARVVEDFAQLINGLDGGKRKELVFDTDDEAAGKKRKRTTKIKDPNAPKRPPSSYILFQNEIRNELRKQFPEINNSQLLSLISEKWKSLPEAEKERYNERNRSAKARYSVQKQAYDARSPEEVEAANRALAESVALKKANRGRSKKEVAPAVIVPVPPKAKSEEPESDEEHEVEVAESDEESEEEGTPAAVAKPSSKHTKPVTDSSEEESASEDDDEEEEAPAPKRTKRASSAQPKSKKHKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.43
3 0.43
4 0.41
5 0.32
6 0.34
7 0.3
8 0.27
9 0.29
10 0.26
11 0.24
12 0.19
13 0.2
14 0.18
15 0.22
16 0.24
17 0.24
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.16
24 0.14
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.1
33 0.13
34 0.14
35 0.16
36 0.16
37 0.19
38 0.21
39 0.25
40 0.23
41 0.23
42 0.24
43 0.24
44 0.24
45 0.2
46 0.19
47 0.19
48 0.23
49 0.25
50 0.28
51 0.35
52 0.43
53 0.52
54 0.62
55 0.68
56 0.73
57 0.8
58 0.84
59 0.85
60 0.87
61 0.9
62 0.88
63 0.84
64 0.77
65 0.73
66 0.67
67 0.61
68 0.55
69 0.5
70 0.45
71 0.48
72 0.49
73 0.44
74 0.42
75 0.44
76 0.4
77 0.37
78 0.34
79 0.29
80 0.26
81 0.28
82 0.32
83 0.28
84 0.32
85 0.37
86 0.4
87 0.43
88 0.44
89 0.43
90 0.39
91 0.38
92 0.33
93 0.25
94 0.21
95 0.15
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.16
105 0.2
106 0.24
107 0.31
108 0.34
109 0.38
110 0.39
111 0.43
112 0.48
113 0.47
114 0.47
115 0.44
116 0.5
117 0.47
118 0.51
119 0.49
120 0.45
121 0.43
122 0.45
123 0.45
124 0.42
125 0.48
126 0.46
127 0.45
128 0.42
129 0.45
130 0.41
131 0.38
132 0.33
133 0.27
134 0.24
135 0.22
136 0.21
137 0.15
138 0.13
139 0.1
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.15
154 0.21
155 0.3
156 0.37
157 0.42
158 0.47
159 0.55
160 0.62
161 0.61
162 0.61
163 0.58
164 0.5
165 0.47
166 0.4
167 0.34
168 0.29
169 0.25
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.2
177 0.23
178 0.29
179 0.32
180 0.34
181 0.38
182 0.39
183 0.38
184 0.36
185 0.34
186 0.27
187 0.2
188 0.16
189 0.13
190 0.1
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.1
209 0.13
210 0.19
211 0.28
212 0.3
213 0.37
214 0.42
215 0.5
216 0.53
217 0.58
218 0.59
219 0.55
220 0.55
221 0.52
222 0.5
223 0.41
224 0.35
225 0.29
226 0.24
227 0.2
228 0.18
229 0.13
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.12
237 0.14
238 0.19
239 0.22
240 0.25
241 0.32
242 0.38
243 0.45
244 0.49
245 0.57
246 0.62
247 0.7
248 0.77
249 0.79
250 0.83
251 0.85