Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DK21

Protein Details
Accession A5DK21    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MAKSSTKAAKPVKKQSKSVKAKAPESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-17KPVKKQSK
116-133VKKSPKKETKAEKKEEKK
181-190KKPAEKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgu:PGUG_03622  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKSSTKAAKPVKKQSKSVKAKAPESSSESESSSDSSSSSSSESSSESSSSDSSSDSESDAEESSDSESEEEKKEVKSDKKSDTSSKDSDSDSSSSSESGSDSDSSDSESEEEKEVKKSPKKETKAEKKEEKKAESSDSSDSSSDSDSDSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSDSDSESAKEETKKPAEKKRKAEPAAEEEAAEEPVAKKSKNEEPATLFVGRLSWNIDDEWLRREFEPIGGVISARVIMERATGKSRGYGLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.84
3 0.85
4 0.86
5 0.85
6 0.83
7 0.8
8 0.8
9 0.78
10 0.72
11 0.66
12 0.62
13 0.58
14 0.51
15 0.45
16 0.39
17 0.33
18 0.28
19 0.25
20 0.2
21 0.16
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.19
62 0.26
63 0.32
64 0.38
65 0.43
66 0.49
67 0.54
68 0.58
69 0.61
70 0.6
71 0.6
72 0.53
73 0.49
74 0.44
75 0.39
76 0.36
77 0.31
78 0.26
79 0.2
80 0.19
81 0.16
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.11
101 0.14
102 0.18
103 0.25
104 0.29
105 0.34
106 0.43
107 0.51
108 0.56
109 0.62
110 0.68
111 0.72
112 0.76
113 0.79
114 0.78
115 0.76
116 0.8
117 0.78
118 0.7
119 0.62
120 0.55
121 0.51
122 0.43
123 0.38
124 0.32
125 0.26
126 0.25
127 0.21
128 0.19
129 0.15
130 0.13
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.12
164 0.15
165 0.17
166 0.23
167 0.3
168 0.38
169 0.44
170 0.54
171 0.62
172 0.68
173 0.73
174 0.76
175 0.8
176 0.76
177 0.74
178 0.7
179 0.66
180 0.63
181 0.55
182 0.44
183 0.35
184 0.32
185 0.26
186 0.2
187 0.13
188 0.08
189 0.13
190 0.16
191 0.15
192 0.16
193 0.21
194 0.3
195 0.38
196 0.41
197 0.4
198 0.43
199 0.46
200 0.49
201 0.44
202 0.35
203 0.26
204 0.24
205 0.2
206 0.16
207 0.15
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.21
215 0.2
216 0.22
217 0.21
218 0.23
219 0.22
220 0.2
221 0.21
222 0.17
223 0.17
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.11
234 0.14
235 0.17
236 0.21
237 0.23
238 0.23
239 0.27