FuNGI

A0A4Y7U0K2

Protein Details

Accession

A0A4Y7U0K2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
152-174	VLAKAKQKRLKTAPETRPPRNGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13.5, cyto_mito 11.5, cyto 8.5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSNGAPGAIVGSVFERKTGSNVKQAGTPKTPSGSTGFPSVQHRSKSAFARNREDSLRKNLGTSRLNAPPVPASAASSSSRQAATSHLTAPLSAPIRPPVPENPTALGTGDSEVLRDRISRENEVRIAGMSPEEIEEERRQILDRFGVGIADVLAKAKQKRLKTAPETRPPRNGISSPLPPPVDIEESRKALQNLPEVPISPEDPAPSRARSPPLPALVSGAGSRPSSRASTRRLRFAELEPKDVYVYESHPPSPKRVLALPPPTEDDKDAVSLGTWHGVMKVPAHLAITDPPSEQQGGGQKKSEVEDPMDVKQESMSKGEEPEEGTPEYIRRRFFPDVPANDPNLAWISPSSNNAVDTTPPSLRFDLRGDPIPPALSSKLPTSLGLHHHAEGSHAGYTLDDIFLLTRSTVPAQRTIMYGILMGVARNLSKMLKGSVVPYMEELKGREEELRKRVVAAGAEAINERGSVGLRAIALVRECTVAWDEELIALGLDGIWLESEAADSIRSLSLEYLLPSFSDMLNQMRAAYPHETLGQVLEILQRLALENRHNAQQIAEADKLLPGIIQYFLLIPHSRLEESYFPNASAISLLISLAKTSREIAQMLAKSFADDLLRFIAVLPESSPFPTPLATMLAARTLDFYATLGTYGLYTGVASAAMGQISRLSEHACQAENEPHSLSSAWARLAEVWILCGVDPHATTPPHDITWSRIAAWAWQGELLRLLERIDTAGQSNWPVRGYVWSALAAWLDGCKVNGIRGGVTERAAMQQAIEKLFQEEGRGFTVVSLVLDALAAALRSNDPLSHRRAKAIASYADVLRNVIRLWLSLIPSGVEGPPEAPPFKLPFDRISTVAATLLSNSIWTSAQGDSPAGCRYFTVYLRHNSAFLAQYLDLSRLLPAMTRELWLGQAFSLLLRFLPGDEDAALKVIDQIFRTLSQEVEQRPGDNVAILKPFMVDAVLSKANETEIDEDEEVPSNVQLDPRTRLAPLVITPSSISTMTTSTLLSPFAGQKSQRHFSGLPLKQDWMLTAMDHLLHSGESPVFRHLPSDWDFSEVDVTRSSLAFALRSRDLLNRFNLGKYAIDKNEAILGCMKVFMLEHGLEKEAVTSSEEVFRDKVVESLMERLLGPFQHDSSATPEPPSADLEMVATRFLATGTPFYQFYTDFVGLYDAISFSHPPFGLLLLPPISMQYAIDYRKLFWCDYPQILRTISVSPNQVLTSDLREYLYPVESESQVIGALLSALLKNGATGFLCWVATHHIASNIWSDIRDEGVDGAYNKERGVKLLKAVVDRGDNEMIRAVVKYWQDRRGGSARLPPDCFCADEEVLRHREKWIEGAVGASYAERLAGLLATN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.15
4	0.21
5	0.3
6	0.32
7	0.37
8	0.41
9	0.41
10	0.46
11	0.51
12	0.53
13	0.5
14	0.5
15	0.44
16	0.44
17	0.43
18	0.39
19	0.38
20	0.34
21	0.3
22	0.32
23	0.3
24	0.3
25	0.36
26	0.41
27	0.44
28	0.43
29	0.44
30	0.42
31	0.48
32	0.52
33	0.57
34	0.57
35	0.58
36	0.64
37	0.66
38	0.67
39	0.68
40	0.67
41	0.62
42	0.63
43	0.64
44	0.55
45	0.54
46	0.53
47	0.55
48	0.52
49	0.5
50	0.48
51	0.46
52	0.49
53	0.45
54	0.43
55	0.37
56	0.34
57	0.34
58	0.27
59	0.23
60	0.21
61	0.25
62	0.24
63	0.23
64	0.23
65	0.22
66	0.22
67	0.2
68	0.19
69	0.19
70	0.23
71	0.24
72	0.24
73	0.24
74	0.24
75	0.24
76	0.24
77	0.27
78	0.23
79	0.21
80	0.22
81	0.23
82	0.25
83	0.26
84	0.29
85	0.3
86	0.35
87	0.38
88	0.39
89	0.38
90	0.37
91	0.37
92	0.33
93	0.27
94	0.2
95	0.17
96	0.16
97	0.13
98	0.12
99	0.13
100	0.13
101	0.13
102	0.14
103	0.16
104	0.22
105	0.27
106	0.34
107	0.37
108	0.43
109	0.45
110	0.45
111	0.42
112	0.34
113	0.3
114	0.23
115	0.19
116	0.13
117	0.11
118	0.1
119	0.11
120	0.11
121	0.15
122	0.16
123	0.18
124	0.19
125	0.2
126	0.21
127	0.21
128	0.24
129	0.23
130	0.22
131	0.21
132	0.2
133	0.19
134	0.17
135	0.15
136	0.12
137	0.1
138	0.09
139	0.07
140	0.09
141	0.14
142	0.17
143	0.24
144	0.3
145	0.34
146	0.44
147	0.52
148	0.61
149	0.66
150	0.74
151	0.77
152	0.81
153	0.85
154	0.81
155	0.81
156	0.75
157	0.7
158	0.66
159	0.57
160	0.53
161	0.52
162	0.52
163	0.47
164	0.49
165	0.45
166	0.38
167	0.38
168	0.36
169	0.34
170	0.3
171	0.32
172	0.32
173	0.35
174	0.36
175	0.38
176	0.36
177	0.35
178	0.38
179	0.39
180	0.36
181	0.35
182	0.35
183	0.31
184	0.32
185	0.3
186	0.26
187	0.21
188	0.19
189	0.18
190	0.19
191	0.23
192	0.25
193	0.25
194	0.28
195	0.31
196	0.36
197	0.36
198	0.41
199	0.43
200	0.44
201	0.43
202	0.39
203	0.38
204	0.33
205	0.31
206	0.24
207	0.19
208	0.16
209	0.15
210	0.16
211	0.14
212	0.16
213	0.18
214	0.24
215	0.29
216	0.34
217	0.44
218	0.48
219	0.57
220	0.57
221	0.58
222	0.56
223	0.57
224	0.6
225	0.52
226	0.52
227	0.43
228	0.41
229	0.37
230	0.33
231	0.27
232	0.18
233	0.18
234	0.18
235	0.2
236	0.23
237	0.29
238	0.3
239	0.34
240	0.38
241	0.37
242	0.35
243	0.38
244	0.41
245	0.44
246	0.52
247	0.5
248	0.47
249	0.49
250	0.48
251	0.44
252	0.39
253	0.31
254	0.23
255	0.21
256	0.18
257	0.14
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.11
267	0.11
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.14
272	0.13
273	0.13
274	0.15
275	0.17
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.16
280	0.17
281	0.15
282	0.15
283	0.21
284	0.26
285	0.28
286	0.29
287	0.29
288	0.3
289	0.32
290	0.32
291	0.26
292	0.23
293	0.26
294	0.26
295	0.28
296	0.3
297	0.28
298	0.25
299	0.24
300	0.25
301	0.21
302	0.2
303	0.2
304	0.16
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.18
309	0.18
310	0.19
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.19
315	0.24
316	0.26
317	0.26
318	0.25
319	0.31
320	0.36
321	0.37
322	0.44
323	0.46
324	0.47
325	0.53
326	0.54
327	0.49
328	0.45
329	0.42
330	0.33
331	0.26
332	0.21
333	0.14
334	0.11
335	0.12
336	0.13
337	0.15
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.17
342	0.17
343	0.15
344	0.16
345	0.18
346	0.18
347	0.18
348	0.2
349	0.21
350	0.21
351	0.23
352	0.23
353	0.24
354	0.25
355	0.29
356	0.27
357	0.27
358	0.27
359	0.25
360	0.22
361	0.19
362	0.18
363	0.15
364	0.15
365	0.16
366	0.18
367	0.18
368	0.18
369	0.18
370	0.21
371	0.23
372	0.27
373	0.27
374	0.24
375	0.24
376	0.23
377	0.22
378	0.19
379	0.16
380	0.12
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.07
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.07
395	0.09
396	0.13
397	0.14
398	0.18
399	0.19
400	0.2
401	0.2
402	0.21
403	0.19
404	0.15
405	0.14
406	0.1
407	0.1
408	0.09
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.06
416	0.07
417	0.08
418	0.09
419	0.11
420	0.11
421	0.13
422	0.16
423	0.16
424	0.15
425	0.16
426	0.17
427	0.16
428	0.17
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.16
433	0.19
434	0.21
435	0.27
436	0.31
437	0.34
438	0.32
439	0.32
440	0.33
441	0.3
442	0.25
443	0.19
444	0.17
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.12
449	0.1
450	0.09
451	0.08
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.04
476	0.04
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.02
481	0.02
482	0.02
483	0.02
484	0.02
485	0.02
486	0.03
487	0.03
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.05
496	0.07
497	0.07
498	0.08
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.06
505	0.07
506	0.08
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.11
513	0.13
514	0.13
515	0.12
516	0.12
517	0.13
518	0.13
519	0.12
520	0.12
521	0.09
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.06
530	0.08
531	0.1
532	0.11
533	0.14
534	0.16
535	0.19
536	0.19
537	0.19
538	0.18
539	0.2
540	0.19
541	0.2
542	0.18
543	0.15
544	0.15
545	0.15
546	0.14
547	0.1
548	0.08
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.07
557	0.08
558	0.08
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.13
564	0.14
565	0.17
566	0.21
567	0.2
568	0.18
569	0.18
570	0.18
571	0.15
572	0.12
573	0.08
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.06
584	0.09
585	0.1
586	0.1
587	0.11
588	0.15
589	0.17
590	0.17
591	0.17
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.13
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.07
609	0.08
610	0.09
611	0.08
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.09
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.07
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.05
651	0.06
652	0.07
653	0.09
654	0.1
655	0.1
656	0.11
657	0.12
658	0.16
659	0.16
660	0.16
661	0.14
662	0.13
663	0.13
664	0.13
665	0.11
666	0.08
667	0.09
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.06
675	0.06
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.09
685	0.09
686	0.1
687	0.14
688	0.14
689	0.14
690	0.14
691	0.14
692	0.14
693	0.19
694	0.18
695	0.15
696	0.16
697	0.16
698	0.16
699	0.18
700	0.14
701	0.1
702	0.11
703	0.1
704	0.09
705	0.1
706	0.09
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.06
711	0.06
712	0.07
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.09
719	0.1
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.09
724	0.11
725	0.13
726	0.12
727	0.12
728	0.11
729	0.11
730	0.11
731	0.11
732	0.09
733	0.06
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.04
738	0.05
739	0.05
740	0.06
741	0.08
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.11
746	0.11
747	0.11
748	0.11
749	0.09
750	0.1
751	0.1
752	0.09
753	0.07
754	0.09
755	0.11
756	0.12
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.12
761	0.12
762	0.11
763	0.1
764	0.1
765	0.11
766	0.11
767	0.1
768	0.09
769	0.1
770	0.08
771	0.07
772	0.06
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.03
777	0.03
778	0.03
779	0.03
780	0.02
781	0.03
782	0.03
783	0.04
784	0.05
785	0.06
786	0.09
787	0.13
788	0.2
789	0.28
790	0.28
791	0.3
792	0.31
793	0.31
794	0.31
795	0.32
796	0.27
797	0.21
798	0.22
799	0.21
800	0.21
801	0.2
802	0.17
803	0.12
804	0.11
805	0.09
806	0.09
807	0.08
808	0.07
809	0.09
810	0.11
811	0.11
812	0.11
813	0.11
814	0.1
815	0.1
816	0.11
817	0.09
818	0.07
819	0.06
820	0.06
821	0.09
822	0.1
823	0.11
824	0.1
825	0.12
826	0.14
827	0.17
828	0.19
829	0.18
830	0.2
831	0.25
832	0.27
833	0.26
834	0.26
835	0.23
836	0.21
837	0.19
838	0.16
839	0.1
840	0.09
841	0.08
842	0.06
843	0.06
844	0.05
845	0.06
846	0.05
847	0.06
848	0.07
849	0.08
850	0.08
851	0.09
852	0.09
853	0.08
854	0.1
855	0.12
856	0.11
857	0.1
858	0.1
859	0.12
860	0.15
861	0.18
862	0.21
863	0.24
864	0.27
865	0.32
866	0.33
867	0.3
868	0.27
869	0.26
870	0.22
871	0.18
872	0.17
873	0.12
874	0.13
875	0.13
876	0.14
877	0.12
878	0.11
879	0.1
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.08
884	0.1
885	0.1
886	0.11
887	0.11
888	0.11
889	0.13
890	0.12
891	0.11
892	0.08
893	0.08
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.06
903	0.06
904	0.07
905	0.07
906	0.08
907	0.07
908	0.08
909	0.08
910	0.06
911	0.08
912	0.09
913	0.1
914	0.1
915	0.11
916	0.11
917	0.13
918	0.15
919	0.13
920	0.12
921	0.13
922	0.17
923	0.18
924	0.22
925	0.21
926	0.2
927	0.21
928	0.22
929	0.19
930	0.16
931	0.15
932	0.12
933	0.13
934	0.12
935	0.11
936	0.1
937	0.1
938	0.08
939	0.08
940	0.05
941	0.05
942	0.09
943	0.11
944	0.11
945	0.11
946	0.12
947	0.12
948	0.12
949	0.13
950	0.11
951	0.1
952	0.14
953	0.14
954	0.14
955	0.15
956	0.16
957	0.14
958	0.12
959	0.1
960	0.08
961	0.08
962	0.1
963	0.11
964	0.13
965	0.17
966	0.19
967	0.21
968	0.2
969	0.2
970	0.19
971	0.19
972	0.17
973	0.2
974	0.17
975	0.16
976	0.16
977	0.17
978	0.17
979	0.15
980	0.14
981	0.09
982	0.1
983	0.1
984	0.11
985	0.1
986	0.1
987	0.1
988	0.1
989	0.09
990	0.1
991	0.12
992	0.13
993	0.17
994	0.18
995	0.24
996	0.31
997	0.35
998	0.34
999	0.36
1000	0.35
1001	0.38
1002	0.47
1003	0.45
1004	0.44
1005	0.41
1006	0.42
1007	0.38
1008	0.38
1009	0.31
1010	0.22
1011	0.18
1012	0.12
1013	0.11
1014	0.1
1015	0.1
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.07
1019	0.06
1020	0.07
1021	0.08
1022	0.08
1023	0.08
1024	0.1
1025	0.13
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.16
1029	0.15
1030	0.19
1031	0.22
1032	0.26
1033	0.23
1034	0.25
1035	0.25
1036	0.23
1037	0.28
1038	0.23
1039	0.21
1040	0.16
1041	0.16
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.14
1045	0.1
1046	0.11
1047	0.12
1048	0.12
1049	0.17
1050	0.17
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.23
1054	0.27
1055	0.3
1056	0.31
1057	0.32
1058	0.33
1059	0.32
1060	0.31
1061	0.27
1062	0.25
1063	0.24
1064	0.28
1065	0.24
1066	0.26
1067	0.25
1068	0.25
1069	0.29
1070	0.27
1071	0.24
1072	0.2
1073	0.19
1074	0.16
1075	0.16
1076	0.15
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.09
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.12
1083	0.13
1084	0.14
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.14
1088	0.11
1089	0.11
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.11
1093	0.16
1094	0.17
1095	0.18
1096	0.17
1097	0.17
1098	0.17
1099	0.16
1100	0.16
1101	0.12
1102	0.13
1103	0.13
1104	0.16
1105	0.17
1106	0.16
1107	0.15
1108	0.15
1109	0.16
1110	0.14
1111	0.16
1112	0.14
1113	0.14
1114	0.15
1115	0.16
1116	0.16
1117	0.2
1118	0.26
1119	0.23
1120	0.22
1121	0.23
1122	0.22
1123	0.23
1124	0.24
1125	0.19
1126	0.14
1127	0.13
1128	0.14
1129	0.15
1130	0.13
1131	0.12
1132	0.1
1133	0.08
1134	0.08
1135	0.08
1136	0.08
1137	0.07
1138	0.1
1139	0.12
1140	0.14
1141	0.14
1142	0.15
1143	0.17
1144	0.16
1145	0.16
1146	0.2
1147	0.19
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.18
1151	0.16
1152	0.16
1153	0.15
1154	0.07
1155	0.07
1156	0.09
1157	0.1
1158	0.09
1159	0.15
1160	0.14
1161	0.14
1162	0.15
1163	0.15
1164	0.16
1165	0.15
1166	0.18
1167	0.13
1168	0.13
1169	0.13
1170	0.13
1171	0.13
1172	0.11
1173	0.1
1174	0.1
1175	0.15
1176	0.17
1177	0.22
1178	0.22
1179	0.24
1180	0.3
1181	0.33
1182	0.3
1183	0.28
1184	0.34
1185	0.35
1186	0.41
1187	0.45
1188	0.4
1189	0.41
1190	0.4
1191	0.38
1192	0.32
1193	0.31
1194	0.27
1195	0.26
1196	0.27
1197	0.24
1198	0.26
1199	0.25
1200	0.23
1201	0.21
1202	0.19
1203	0.2
1204	0.19
1205	0.19
1206	0.18
1207	0.18
1208	0.19
1209	0.2
1210	0.2
1211	0.15
1212	0.15
1213	0.17
1214	0.17
1215	0.18
1216	0.16
1217	0.14
1218	0.12
1219	0.11
1220	0.09
1221	0.06
1222	0.06
1223	0.05
1224	0.05
1225	0.05
1226	0.05
1227	0.06
1228	0.06
1229	0.06
1230	0.06
1231	0.08
1232	0.08
1233	0.09
1234	0.11
1235	0.12
1236	0.12
1237	0.12
1238	0.13
1239	0.17
1240	0.18
1241	0.19
1242	0.18
1243	0.2
1244	0.2
1245	0.22
1246	0.24
1247	0.2
1248	0.19
1249	0.18
1250	0.18
1251	0.15
1252	0.17
1253	0.15
1254	0.13
1255	0.11
1256	0.12
1257	0.14
1258	0.14
1259	0.18
1260	0.2
1261	0.2
1262	0.2
1263	0.25
1264	0.24
1265	0.26
1266	0.31
1267	0.3
1268	0.31
1269	0.36
1270	0.4
1271	0.37
1272	0.39
1273	0.39
1274	0.37
1275	0.35
1276	0.35
1277	0.35
1278	0.31
1279	0.29
1280	0.28
1281	0.25
1282	0.21
1283	0.2
1284	0.16
1285	0.16
1286	0.22
1287	0.3
1288	0.35
1289	0.41
1290	0.45
1291	0.46
1292	0.52
1293	0.53
1294	0.52
1295	0.48
1296	0.5
1297	0.5
1298	0.52
1299	0.55
1300	0.49
1301	0.47
1302	0.44
1303	0.41
1304	0.34
1305	0.33
1306	0.28
1307	0.28
1308	0.3
1309	0.32
1310	0.36
1311	0.37
1312	0.36
1313	0.33
1314	0.36
1315	0.34
1316	0.36
1317	0.33
1318	0.3
1319	0.28
1320	0.29
1321	0.26
1322	0.22
1323	0.2
1324	0.15
1325	0.11
1326	0.08
1327	0.07
1328	0.06
1329	0.05
1330	0.05

A0A4Y7U0K2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer