FuNGI

A0A4Y7TNR2

Protein Details

Accession

A0A4Y7TNR2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-29	DLSLLFHPKKKPIQKQNSVNGNHA	Hydrophilic
183-206	DKGKGPAGKKRFQKKTRQVFPVPE	Basic
583-609	TNPNLNGGQPKPKKKKVNKVVPTAELE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
179-199	AGGKDKGKGPAGKKRFQKKTR
592-598	PKPKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPKHDLSLLFHPKKKPIQKQNSVNGNHAPTQAASVQVRDASPHKSRPTPPAAGATPTTSQATVDDEDIFQLPNTQYSEFRILSSALQGWKYDVMKFDSRKNVDINRWQQPIKLNRKDLRMNDTGATTTAVPQAVGPMLGPDGKPVIGVDGKVVMVDVEGKPIHPDSHHLAGPGANGAAGGKDKGKGPAGKKRFQKKTRQVFPVPEHQRQLRKEERYPWVMEDSSSAKEEYWVGHLEEVSKADTHGFFMPAANDAFKFVPAHRWYKFQKKIKHDLPTDTANVDALYTQSQKKDPQVWLASFNGGKGASSATAAMFKGEPEVKQESQSLGPGGRRLKTVDSGGGHLFGDDDDEDGASRRRREKELGGEGDIDEQVYEEEFADDDEQMQVDGEDEDTKESEERMKRDFQRANKTNDGAIEGDDDLFEDKPKTQKALEKMIKSREGNNAYESDEDKNPYASSEEEEEEEPEPVHTGPAIQQQPQQIDPKAQPLKSTPNKPPMSGSRATSPAASNLGGHSLLAQRATSPKMNKPSLPGLSNGSRGNSPAGSRANSPTPSRATSPLANPPQSPVSNKRKADDSPASPTNPNLNGGQPKPKKKKVNKVVPTAELEALLINWLKSTPNGTTRECIQHFNPYLISKEKKDEFSGMVKRIAILKDGVLALRPGLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.75
3	0.75
4	0.75
5	0.79
6	0.83
7	0.89
8	0.91
9	0.9
10	0.83
11	0.77
12	0.73
13	0.66
14	0.59
15	0.5
16	0.41
17	0.31
18	0.31
19	0.28
20	0.26
21	0.23
22	0.2
23	0.21
24	0.22
25	0.21
26	0.21
27	0.23
28	0.25
29	0.31
30	0.38
31	0.42
32	0.48
33	0.53
34	0.59
35	0.64
36	0.62
37	0.58
38	0.58
39	0.54
40	0.49
41	0.46
42	0.41
43	0.34
44	0.31
45	0.29
46	0.21
47	0.2
48	0.17
49	0.19
50	0.17
51	0.16
52	0.16
53	0.14
54	0.15
55	0.16
56	0.15
57	0.11
58	0.15
59	0.14
60	0.16
61	0.18
62	0.19
63	0.19
64	0.23
65	0.3
66	0.26
67	0.26
68	0.24
69	0.23
70	0.22
71	0.24
72	0.23
73	0.19
74	0.2
75	0.19
76	0.19
77	0.24
78	0.24
79	0.23
80	0.23
81	0.26
82	0.33
83	0.35
84	0.42
85	0.46
86	0.48
87	0.5
88	0.52
89	0.54
90	0.54
91	0.61
92	0.61
93	0.6
94	0.62
95	0.59
96	0.56
97	0.58
98	0.6
99	0.61
100	0.62
101	0.63
102	0.63
103	0.7
104	0.75
105	0.71
106	0.69
107	0.61
108	0.55
109	0.47
110	0.43
111	0.36
112	0.28
113	0.25
114	0.17
115	0.15
116	0.15
117	0.13
118	0.12
119	0.11
120	0.12
121	0.1
122	0.1
123	0.08
124	0.06
125	0.07
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.07
142	0.06
143	0.09
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.11
148	0.13
149	0.14
150	0.15
151	0.13
152	0.17
153	0.19
154	0.24
155	0.24
156	0.23
157	0.22
158	0.22
159	0.22
160	0.18
161	0.13
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.1
171	0.13
172	0.18
173	0.24
174	0.29
175	0.39
176	0.45
177	0.51
178	0.59
179	0.67
180	0.72
181	0.75
182	0.8
183	0.8
184	0.84
185	0.86
186	0.86
187	0.81
188	0.78
189	0.74
190	0.74
191	0.7
192	0.64
193	0.59
194	0.57
195	0.59
196	0.53
197	0.57
198	0.55
199	0.55
200	0.55
201	0.59
202	0.6
203	0.57
204	0.56
205	0.5
206	0.45
207	0.38
208	0.32
209	0.27
210	0.23
211	0.2
212	0.19
213	0.17
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.09
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.11
238	0.11
239	0.09
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.09
246	0.17
247	0.21
248	0.26
249	0.26
250	0.33
251	0.37
252	0.47
253	0.56
254	0.56
255	0.61
256	0.63
257	0.72
258	0.73
259	0.76
260	0.69
261	0.64
262	0.6
263	0.54
264	0.47
265	0.37
266	0.3
267	0.21
268	0.17
269	0.13
270	0.09
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.1
275	0.12
276	0.14
277	0.17
278	0.2
279	0.26
280	0.26
281	0.3
282	0.33
283	0.32
284	0.33
285	0.31
286	0.3
287	0.24
288	0.22
289	0.16
290	0.12
291	0.11
292	0.08
293	0.08
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.12
307	0.17
308	0.16
309	0.18
310	0.19
311	0.18
312	0.17
313	0.18
314	0.15
315	0.11
316	0.12
317	0.14
318	0.16
319	0.15
320	0.16
321	0.16
322	0.17
323	0.18
324	0.18
325	0.18
326	0.16
327	0.17
328	0.16
329	0.16
330	0.14
331	0.12
332	0.11
333	0.07
334	0.07
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.09
342	0.1
343	0.14
344	0.2
345	0.23
346	0.27
347	0.31
348	0.36
349	0.41
350	0.47
351	0.46
352	0.41
353	0.38
354	0.35
355	0.32
356	0.26
357	0.17
358	0.08
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.06
384	0.07
385	0.13
386	0.17
387	0.19
388	0.22
389	0.29
390	0.33
391	0.42
392	0.47
393	0.48
394	0.56
395	0.59
396	0.63
397	0.6
398	0.58
399	0.5
400	0.44
401	0.39
402	0.28
403	0.22
404	0.16
405	0.11
406	0.1
407	0.09
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.13
415	0.15
416	0.17
417	0.19
418	0.24
419	0.29
420	0.39
421	0.44
422	0.46
423	0.5
424	0.54
425	0.57
426	0.53
427	0.52
428	0.5
429	0.48
430	0.43
431	0.4
432	0.35
433	0.3
434	0.3
435	0.27
436	0.22
437	0.19
438	0.2
439	0.18
440	0.18
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.12
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.15
450	0.16
451	0.15
452	0.15
453	0.13
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.08
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.17
462	0.19
463	0.2
464	0.23
465	0.27
466	0.29
467	0.32
468	0.34
469	0.27
470	0.3
471	0.29
472	0.36
473	0.38
474	0.36
475	0.35
476	0.34
477	0.43
478	0.47
479	0.54
480	0.52
481	0.56
482	0.58
483	0.56
484	0.58
485	0.55
486	0.53
487	0.49
488	0.43
489	0.38
490	0.39
491	0.39
492	0.34
493	0.28
494	0.24
495	0.22
496	0.2
497	0.15
498	0.13
499	0.14
500	0.12
501	0.11
502	0.11
503	0.11
504	0.12
505	0.12
506	0.11
507	0.11
508	0.14
509	0.18
510	0.23
511	0.25
512	0.32
513	0.4
514	0.44
515	0.44
516	0.46
517	0.51
518	0.5
519	0.47
520	0.42
521	0.38
522	0.38
523	0.41
524	0.36
525	0.3
526	0.25
527	0.25
528	0.26
529	0.22
530	0.19
531	0.21
532	0.23
533	0.23
534	0.26
535	0.29
536	0.32
537	0.35
538	0.36
539	0.36
540	0.36
541	0.38
542	0.38
543	0.38
544	0.36
545	0.37
546	0.39
547	0.44
548	0.47
549	0.46
550	0.43
551	0.43
552	0.45
553	0.43
554	0.44
555	0.44
556	0.47
557	0.54
558	0.56
559	0.55
560	0.54
561	0.54
562	0.57
563	0.57
564	0.52
565	0.5
566	0.53
567	0.53
568	0.49
569	0.49
570	0.46
571	0.39
572	0.36
573	0.29
574	0.31
575	0.35
576	0.38
577	0.46
578	0.48
579	0.57
580	0.65
581	0.73
582	0.78
583	0.81
584	0.89
585	0.89
586	0.92
587	0.9
588	0.9
589	0.87
590	0.82
591	0.76
592	0.68
593	0.58
594	0.47
595	0.37
596	0.27
597	0.2
598	0.17
599	0.12
600	0.08
601	0.08
602	0.08
603	0.09
604	0.1
605	0.14
606	0.17
607	0.24
608	0.3
609	0.33
610	0.36
611	0.41
612	0.49
613	0.48
614	0.48
615	0.43
616	0.48
617	0.47
618	0.46
619	0.44
620	0.36
621	0.39
622	0.41
623	0.44
624	0.38
625	0.45
626	0.48
627	0.48
628	0.5
629	0.5
630	0.46
631	0.5
632	0.54
633	0.49
634	0.47
635	0.42
636	0.4
637	0.42
638	0.38
639	0.31
640	0.25
641	0.21
642	0.22
643	0.22
644	0.21
645	0.17
646	0.17

A0A4Y7TNR2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer