Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DQD9

Protein Details
Accession A5DQD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-66DNNTVKTTKNHIRKPRKNHSPATIEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-353KRKSSKKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG pgu:PGUG_05490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MDSEHQHQPDIDPELNSGSHEASDHGSDDENVFSLSAQKLDNNTVKTTKNHIRKPRKNHSPATIEPSLLKNDEPEGEQMSFEDPQVRRRRLLEEKMDLAMKSKSTRRKRADEDDLERMQDDRIDELKDQMIKAANMDVEKNSQGQIATEKLKLLPEVSSVLSKADLAISILDNNLLEAVRLWLEPLPDASMPAYQIQKELIHALTTLPIKTDHLVASGIGKVLVFYQRSKRTEPLLKQLVDRLIGDWTRPILNKSDSYKDRTIQFHEYNSTKFANKLPSSRVRAKEPKTLYEQSAERRKRAAIPSARTSAYKIAPRVDPNSIRRQKGGTDERFRRINQKLTSMNLKRKSSKKGGPSIEGKNLAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.25
4 0.21
5 0.16
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.18
27 0.25
28 0.31
29 0.3
30 0.33
31 0.35
32 0.39
33 0.39
34 0.46
35 0.48
36 0.53
37 0.59
38 0.66
39 0.73
40 0.79
41 0.86
42 0.89
43 0.9
44 0.89
45 0.87
46 0.85
47 0.82
48 0.76
49 0.74
50 0.64
51 0.54
52 0.47
53 0.42
54 0.36
55 0.29
56 0.24
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.2
70 0.17
71 0.26
72 0.36
73 0.38
74 0.39
75 0.41
76 0.49
77 0.5
78 0.59
79 0.58
80 0.54
81 0.53
82 0.52
83 0.51
84 0.43
85 0.36
86 0.29
87 0.22
88 0.21
89 0.26
90 0.34
91 0.42
92 0.52
93 0.58
94 0.65
95 0.71
96 0.76
97 0.8
98 0.78
99 0.74
100 0.72
101 0.65
102 0.56
103 0.48
104 0.39
105 0.29
106 0.22
107 0.16
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.15
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.2
214 0.28
215 0.31
216 0.35
217 0.37
218 0.41
219 0.48
220 0.49
221 0.51
222 0.5
223 0.48
224 0.46
225 0.47
226 0.41
227 0.34
228 0.3
229 0.22
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.14
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.2
240 0.25
241 0.28
242 0.36
243 0.36
244 0.42
245 0.45
246 0.44
247 0.46
248 0.45
249 0.46
250 0.45
251 0.44
252 0.41
253 0.43
254 0.42
255 0.37
256 0.37
257 0.34
258 0.27
259 0.26
260 0.27
261 0.3
262 0.31
263 0.34
264 0.38
265 0.45
266 0.52
267 0.58
268 0.59
269 0.59
270 0.65
271 0.66
272 0.68
273 0.63
274 0.61
275 0.6
276 0.6
277 0.53
278 0.49
279 0.49
280 0.48
281 0.55
282 0.53
283 0.48
284 0.46
285 0.47
286 0.48
287 0.5
288 0.51
289 0.5
290 0.53
291 0.57
292 0.59
293 0.58
294 0.51
295 0.48
296 0.44
297 0.41
298 0.39
299 0.35
300 0.36
301 0.39
302 0.43
303 0.45
304 0.48
305 0.5
306 0.5
307 0.58
308 0.62
309 0.59
310 0.57
311 0.56
312 0.51
313 0.54
314 0.58
315 0.57
316 0.59
317 0.64
318 0.68
319 0.7
320 0.68
321 0.67
322 0.64
323 0.63
324 0.57
325 0.59
326 0.57
327 0.58
328 0.67
329 0.66
330 0.69
331 0.68
332 0.71
333 0.71
334 0.74
335 0.78
336 0.77
337 0.77
338 0.77
339 0.78
340 0.77
341 0.77
342 0.77
343 0.75
344 0.73