Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7SWT9

Protein Details
Accession A0A4Y7SWT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43GPPAKKAKTNNSQQNGRQPHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-76GKKAKKGGP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MNARPIISYDDITLPYDAQPTEVGPPAKKAKTNNSQQNGRQPHAHWDDPTASFSGKAQQGSGSGPNSGKKAKKGGPSAITAAGGGSGKSGSGSGKGKTPASFSVNMSRELTHDEIWDDSALVEAWDAAMEEYEAYNGPGKGWKGDPLVKSALWYNTPPKPNTSTTQQDEDPEDDVGEVYLEGDEGYYEEGVAENSGPVEAELYHRAQLESTPANYDIASGPAASLSTVSQDEAFSRALNAMYWGGYWTAIYHCHRGQVGPTAAASARDQEKVDAMAEAGDAEEEEGEPGRDEDASSDNMNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.21
10 0.23
11 0.21
12 0.28
13 0.35
14 0.39
15 0.42
16 0.45
17 0.5
18 0.57
19 0.66
20 0.7
21 0.71
22 0.75
23 0.76
24 0.8
25 0.77
26 0.7
27 0.64
28 0.56
29 0.57
30 0.55
31 0.53
32 0.43
33 0.41
34 0.42
35 0.38
36 0.38
37 0.3
38 0.23
39 0.2
40 0.2
41 0.22
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.21
48 0.25
49 0.19
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.24
54 0.29
55 0.3
56 0.3
57 0.38
58 0.41
59 0.48
60 0.51
61 0.56
62 0.53
63 0.52
64 0.51
65 0.44
66 0.37
67 0.29
68 0.22
69 0.16
70 0.12
71 0.09
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.09
79 0.12
80 0.12
81 0.17
82 0.19
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.23
87 0.25
88 0.27
89 0.25
90 0.31
91 0.31
92 0.32
93 0.3
94 0.27
95 0.23
96 0.25
97 0.25
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.14
130 0.16
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.15
140 0.16
141 0.17
142 0.21
143 0.25
144 0.25
145 0.26
146 0.29
147 0.3
148 0.32
149 0.34
150 0.35
151 0.34
152 0.37
153 0.35
154 0.32
155 0.31
156 0.29
157 0.24
158 0.17
159 0.14
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.14
237 0.17
238 0.22
239 0.22
240 0.26
241 0.27
242 0.27
243 0.28
244 0.31
245 0.3
246 0.26
247 0.25
248 0.24
249 0.23
250 0.24
251 0.22
252 0.18
253 0.19
254 0.2
255 0.21
256 0.2
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.16
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.13
281 0.15