Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DJB7

Protein Details
Accession A5DJB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-78AALSTDKKWKKEKIDKKIRNLKVKIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-75DKKWKKEKIDKKIRNLKV
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.666, nucl 12, mito 11, cyto_mito 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG pgu:PGUG_03368  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MFKYTPRNMNGIFAIDKPSGVTSSKFLLDLQDLFTKSHVFEQHLQEFRDGRRAALSTDKKWKKEKIDKKIRNLKVKIGHGGTLDPLASGILVVGVGSGTKQLSHYLGECDKTYETKALLGISTTTGDSEGDILSKNKVDHITKKDVEKTCEKFVGNIKQMPPIFSALKMNGKPLYEYAREGIPLPMPIKTRDVKVNSLTVLDDTMSTDHEFNKLETDLNPEEQNKLFHNETLLKTPLYFSDQYNEANEKTTETAPPRVLEDGEQLPEKLPMIHFVTSVSSGTYIRSLIGDIGRALESSAYMVELRRTQQSDWKIGKNVFRWEDFAENDDRVWGPVLKAVLEQGHEVDVAKELEATREKMAPLIQEEKERLAKHGLEESSEQVQKKRKESETEEHKENGSNSEKIDPEQKLDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.25
3 0.24
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.16
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.21
17 0.22
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.25
22 0.23
23 0.21
24 0.26
25 0.26
26 0.25
27 0.31
28 0.39
29 0.47
30 0.5
31 0.51
32 0.48
33 0.49
34 0.45
35 0.48
36 0.4
37 0.32
38 0.31
39 0.31
40 0.29
41 0.36
42 0.4
43 0.38
44 0.49
45 0.55
46 0.57
47 0.64
48 0.7
49 0.7
50 0.75
51 0.78
52 0.79
53 0.83
54 0.86
55 0.89
56 0.92
57 0.9
58 0.89
59 0.82
60 0.79
61 0.76
62 0.72
63 0.69
64 0.6
65 0.53
66 0.44
67 0.41
68 0.33
69 0.26
70 0.2
71 0.13
72 0.11
73 0.08
74 0.07
75 0.05
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.02
81 0.02
82 0.02
83 0.03
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.08
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.16
93 0.19
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.2
98 0.21
99 0.21
100 0.18
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.18
125 0.21
126 0.28
127 0.34
128 0.42
129 0.43
130 0.48
131 0.53
132 0.52
133 0.53
134 0.53
135 0.51
136 0.47
137 0.48
138 0.43
139 0.39
140 0.42
141 0.46
142 0.42
143 0.42
144 0.38
145 0.4
146 0.4
147 0.38
148 0.32
149 0.27
150 0.23
151 0.2
152 0.21
153 0.17
154 0.23
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.21
159 0.21
160 0.2
161 0.23
162 0.19
163 0.19
164 0.18
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.16
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.25
179 0.27
180 0.28
181 0.28
182 0.29
183 0.25
184 0.24
185 0.22
186 0.15
187 0.12
188 0.09
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.18
207 0.16
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.15
212 0.18
213 0.17
214 0.15
215 0.17
216 0.2
217 0.21
218 0.23
219 0.23
220 0.19
221 0.18
222 0.19
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.13
227 0.15
228 0.17
229 0.17
230 0.19
231 0.2
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.17
239 0.17
240 0.21
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.18
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.11
256 0.09
257 0.11
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.09
290 0.11
291 0.13
292 0.18
293 0.2
294 0.21
295 0.28
296 0.33
297 0.4
298 0.43
299 0.46
300 0.46
301 0.48
302 0.53
303 0.5
304 0.54
305 0.48
306 0.44
307 0.42
308 0.39
309 0.4
310 0.34
311 0.32
312 0.27
313 0.24
314 0.22
315 0.21
316 0.18
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.11
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.15
340 0.18
341 0.2
342 0.2
343 0.22
344 0.22
345 0.23
346 0.24
347 0.22
348 0.24
349 0.28
350 0.28
351 0.32
352 0.34
353 0.37
354 0.41
355 0.39
356 0.37
357 0.36
358 0.35
359 0.33
360 0.38
361 0.34
362 0.31
363 0.32
364 0.33
365 0.34
366 0.37
367 0.35
368 0.34
369 0.42
370 0.46
371 0.52
372 0.57
373 0.57
374 0.62
375 0.69
376 0.74
377 0.76
378 0.76
379 0.73
380 0.67
381 0.61
382 0.56
383 0.49
384 0.46
385 0.4
386 0.35
387 0.32
388 0.36
389 0.36
390 0.34
391 0.4
392 0.35