Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7SWC6

Protein Details
Accession A0A4Y7SWC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
580-610DDPAQSQPRRRPPPPAPPKRRKPPAIPILGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
587-603PRRRPPPPAPPKRRKPP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MPPLIPQNAPSLAMEDHLGIVYVIETAQQFWSELEDILKDINEEQPTLDKLDSTLRRFLNLCATYHEQYLQSPLQLEHAINMILDSELFQFHSERMCDIVVDDARKTTDPHLLFIHFNTLYFHGHRRVEAFRNHKRWQPITPILMDHILVEIDPDVEDTFFGGAGSRNSIVFHGNVPVPIEVKLRSLAVKLLYEVCKVQKLSAQDLRIFDDDFIDYLFDLVEQTRYMQDETFNYSVVKLIVGLNEQFMVAGLNDTNSKQPEEPNNRVVRVLMRRLGMSQTFGENMIFMLNRARHTAEDLCMQLLILKLLYVLFTTKGMSEYFYTNDLCVLVDVFVRELADLGDEHESLRHTYLRVLHPLLTKTQLRDVPYKRGQIMVQLESLIGNSRIHDVNPTTKRLVERCLSGDWCIQLKATQRSPTLSGTTGSPTTSEFSIHSPPSTFTPPSIAHSVDSSILKLKNMKFSKSVENLGYRPDHSNAPPIPRSPLDQAQTRHSNGSTTSLTSLPSTKVRPPVPQRKSSNSVSETPAARVHSASTSSSSRSSSQTSLVAEPVERVVNFLSVKASRPTHASTSSLPNHRVDDPAQSQPRRRPPPPAPPKRRKPPAIPILGSNKVTMHTIRSSEPSPLSRVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.14
3 0.13
4 0.11
5 0.11
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.14
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.16
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.2
33 0.22
34 0.24
35 0.22
36 0.17
37 0.17
38 0.26
39 0.32
40 0.32
41 0.38
42 0.35
43 0.39
44 0.4
45 0.41
46 0.41
47 0.37
48 0.34
49 0.33
50 0.39
51 0.37
52 0.38
53 0.38
54 0.28
55 0.26
56 0.31
57 0.26
58 0.21
59 0.21
60 0.2
61 0.21
62 0.22
63 0.21
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.19
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.2
92 0.21
93 0.23
94 0.19
95 0.24
96 0.23
97 0.25
98 0.27
99 0.28
100 0.28
101 0.27
102 0.31
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.22
109 0.26
110 0.26
111 0.27
112 0.28
113 0.3
114 0.34
115 0.38
116 0.44
117 0.49
118 0.53
119 0.6
120 0.63
121 0.65
122 0.67
123 0.64
124 0.62
125 0.61
126 0.58
127 0.54
128 0.52
129 0.47
130 0.4
131 0.37
132 0.31
133 0.22
134 0.15
135 0.11
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.14
167 0.15
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.18
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.19
183 0.21
184 0.21
185 0.21
186 0.19
187 0.21
188 0.27
189 0.3
190 0.32
191 0.31
192 0.31
193 0.34
194 0.32
195 0.29
196 0.22
197 0.18
198 0.15
199 0.12
200 0.11
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.12
217 0.17
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.11
246 0.16
247 0.25
248 0.32
249 0.36
250 0.42
251 0.44
252 0.44
253 0.43
254 0.4
255 0.36
256 0.33
257 0.32
258 0.27
259 0.24
260 0.24
261 0.25
262 0.26
263 0.21
264 0.18
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.16
282 0.17
283 0.15
284 0.16
285 0.15
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.1
290 0.09
291 0.07
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.11
339 0.16
340 0.18
341 0.21
342 0.22
343 0.24
344 0.25
345 0.26
346 0.25
347 0.24
348 0.23
349 0.21
350 0.25
351 0.25
352 0.25
353 0.33
354 0.34
355 0.39
356 0.43
357 0.45
358 0.4
359 0.4
360 0.37
361 0.35
362 0.36
363 0.28
364 0.23
365 0.19
366 0.19
367 0.16
368 0.16
369 0.11
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.12
377 0.13
378 0.22
379 0.25
380 0.28
381 0.26
382 0.28
383 0.32
384 0.31
385 0.34
386 0.27
387 0.26
388 0.25
389 0.27
390 0.26
391 0.25
392 0.25
393 0.21
394 0.2
395 0.18
396 0.15
397 0.15
398 0.2
399 0.25
400 0.28
401 0.31
402 0.31
403 0.33
404 0.36
405 0.35
406 0.31
407 0.26
408 0.22
409 0.18
410 0.19
411 0.18
412 0.15
413 0.13
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.1
419 0.13
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.17
424 0.18
425 0.21
426 0.24
427 0.21
428 0.17
429 0.21
430 0.22
431 0.24
432 0.26
433 0.23
434 0.19
435 0.19
436 0.2
437 0.18
438 0.17
439 0.14
440 0.16
441 0.16
442 0.17
443 0.22
444 0.24
445 0.31
446 0.34
447 0.36
448 0.35
449 0.38
450 0.46
451 0.44
452 0.46
453 0.4
454 0.41
455 0.39
456 0.39
457 0.38
458 0.31
459 0.3
460 0.28
461 0.27
462 0.24
463 0.32
464 0.31
465 0.35
466 0.36
467 0.34
468 0.37
469 0.34
470 0.37
471 0.35
472 0.39
473 0.35
474 0.39
475 0.41
476 0.44
477 0.49
478 0.46
479 0.43
480 0.37
481 0.35
482 0.29
483 0.32
484 0.25
485 0.2
486 0.2
487 0.18
488 0.19
489 0.19
490 0.2
491 0.17
492 0.2
493 0.23
494 0.26
495 0.33
496 0.35
497 0.44
498 0.52
499 0.61
500 0.64
501 0.7
502 0.72
503 0.73
504 0.76
505 0.71
506 0.7
507 0.63
508 0.59
509 0.53
510 0.52
511 0.45
512 0.41
513 0.39
514 0.32
515 0.28
516 0.25
517 0.22
518 0.19
519 0.2
520 0.19
521 0.2
522 0.2
523 0.22
524 0.24
525 0.25
526 0.24
527 0.26
528 0.28
529 0.26
530 0.27
531 0.28
532 0.28
533 0.27
534 0.26
535 0.24
536 0.2
537 0.19
538 0.18
539 0.17
540 0.14
541 0.14
542 0.14
543 0.17
544 0.17
545 0.16
546 0.19
547 0.17
548 0.21
549 0.26
550 0.27
551 0.25
552 0.29
553 0.33
554 0.33
555 0.35
556 0.35
557 0.33
558 0.4
559 0.46
560 0.49
561 0.47
562 0.45
563 0.45
564 0.44
565 0.43
566 0.36
567 0.37
568 0.35
569 0.42
570 0.49
571 0.51
572 0.57
573 0.63
574 0.72
575 0.73
576 0.72
577 0.72
578 0.72
579 0.78
580 0.82
581 0.84
582 0.84
583 0.86
584 0.93
585 0.94
586 0.95
587 0.92
588 0.9
589 0.9
590 0.89
591 0.88
592 0.79
593 0.75
594 0.73
595 0.7
596 0.61
597 0.51
598 0.42
599 0.33
600 0.34
601 0.28
602 0.25
603 0.23
604 0.25
605 0.27
606 0.32
607 0.32
608 0.35
609 0.39
610 0.37