Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DBF4

Protein Details
Accession A5DBF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-47ITSMGPKVRGRRAPNRETREAKRQEDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgu:PGUG_00609  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MSQPRCFMQDLIVSSSPENFSITSMGPKVRGRRAPNRETREAKRQEDLVEDEQISEPTSNLTTPFFGLVDASEIEYFKSAESTLNVTSFESTEERDAFINSVLDEASGKELKLVTNQICSKLMERIILFGGDQQLISIFKSFSNHFVSLAHHKYSSHVLETLLVRIAGLVEKELARSAEDAADQEVTVEHLFITMMQEFYPHINEMITHQYASHVLRLLILILASKKLPSALTANSTLRSKKSKIARKMIEIKDNEDFDRSFETPPSFKDELKKVCKCISENKTMKEMRELSIHKIASPVIQLVIQVEGLVDKERSVWHLVFLPESNSEDPQEEAFVEHLLSDSVGSHFFESIIKNGGARPKYIERLYKLYMKDRIMKLARRSTTGVYIVQALMFKLRPNEVEFILDEVIPELSNLVSIVDNQNIDLGRSVIDASISRSNYRRDDIISQLLSKFAPNFNPKNPSQNDNYDLLENTLLLSSSTLGNTRDDWPTAEERRNALFLEKLLDYDTSFLLAVWTSFLAMPKERFLQMCFHGVFSHVVEHALAVIPASIGESKEVNILRKRLLNVFQGSIVSLACNAYGSHIVDKLWSFTVLMKMYKERFATEMKAESHKVKESTYGRLVWKNWSMELFLRKKYDWSQLIKVQDEEYHNEGAEAETERVKRPIELKMEQLAKKNEKSSLDSTNNDERNKRQRIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.3
4 0.25
5 0.23
6 0.16
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.19
11 0.21
12 0.23
13 0.26
14 0.31
15 0.38
16 0.45
17 0.52
18 0.56
19 0.63
20 0.71
21 0.77
22 0.82
23 0.83
24 0.84
25 0.84
26 0.82
27 0.82
28 0.81
29 0.75
30 0.7
31 0.64
32 0.57
33 0.54
34 0.52
35 0.45
36 0.41
37 0.37
38 0.33
39 0.3
40 0.28
41 0.24
42 0.18
43 0.15
44 0.12
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.15
52 0.13
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.12
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.17
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.15
99 0.18
100 0.24
101 0.21
102 0.29
103 0.31
104 0.32
105 0.34
106 0.34
107 0.32
108 0.31
109 0.3
110 0.26
111 0.24
112 0.23
113 0.22
114 0.21
115 0.19
116 0.16
117 0.17
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.18
130 0.23
131 0.23
132 0.22
133 0.22
134 0.26
135 0.31
136 0.34
137 0.31
138 0.26
139 0.25
140 0.27
141 0.32
142 0.31
143 0.25
144 0.22
145 0.2
146 0.23
147 0.24
148 0.23
149 0.17
150 0.15
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.17
194 0.16
195 0.14
196 0.13
197 0.14
198 0.17
199 0.18
200 0.17
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.16
220 0.2
221 0.21
222 0.22
223 0.24
224 0.24
225 0.25
226 0.28
227 0.27
228 0.3
229 0.39
230 0.46
231 0.53
232 0.62
233 0.63
234 0.66
235 0.74
236 0.72
237 0.7
238 0.62
239 0.56
240 0.5
241 0.47
242 0.39
243 0.31
244 0.26
245 0.19
246 0.22
247 0.2
248 0.16
249 0.17
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.26
254 0.23
255 0.23
256 0.28
257 0.34
258 0.4
259 0.48
260 0.5
261 0.45
262 0.48
263 0.5
264 0.47
265 0.49
266 0.47
267 0.48
268 0.5
269 0.5
270 0.53
271 0.51
272 0.49
273 0.46
274 0.42
275 0.32
276 0.35
277 0.34
278 0.3
279 0.35
280 0.34
281 0.27
282 0.26
283 0.25
284 0.18
285 0.17
286 0.13
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.18
348 0.19
349 0.24
350 0.27
351 0.29
352 0.27
353 0.32
354 0.34
355 0.35
356 0.34
357 0.35
358 0.38
359 0.36
360 0.4
361 0.36
362 0.41
363 0.4
364 0.43
365 0.44
366 0.46
367 0.44
368 0.4
369 0.41
370 0.35
371 0.34
372 0.31
373 0.25
374 0.17
375 0.17
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.13
387 0.15
388 0.14
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.04
400 0.03
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.09
422 0.14
423 0.14
424 0.16
425 0.19
426 0.23
427 0.25
428 0.27
429 0.25
430 0.23
431 0.25
432 0.27
433 0.3
434 0.27
435 0.26
436 0.24
437 0.23
438 0.2
439 0.18
440 0.16
441 0.12
442 0.18
443 0.23
444 0.27
445 0.31
446 0.37
447 0.38
448 0.45
449 0.46
450 0.43
451 0.41
452 0.42
453 0.41
454 0.37
455 0.38
456 0.29
457 0.27
458 0.24
459 0.19
460 0.14
461 0.1
462 0.08
463 0.07
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.12
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.17
477 0.19
478 0.24
479 0.28
480 0.31
481 0.31
482 0.32
483 0.33
484 0.33
485 0.3
486 0.25
487 0.21
488 0.16
489 0.18
490 0.15
491 0.14
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.08
508 0.1
509 0.13
510 0.15
511 0.17
512 0.2
513 0.21
514 0.21
515 0.21
516 0.24
517 0.23
518 0.28
519 0.26
520 0.24
521 0.22
522 0.23
523 0.23
524 0.18
525 0.18
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.13
544 0.16
545 0.21
546 0.25
547 0.28
548 0.3
549 0.34
550 0.37
551 0.38
552 0.41
553 0.41
554 0.4
555 0.39
556 0.36
557 0.32
558 0.29
559 0.24
560 0.19
561 0.12
562 0.09
563 0.07
564 0.06
565 0.07
566 0.06
567 0.08
568 0.11
569 0.12
570 0.13
571 0.14
572 0.15
573 0.16
574 0.17
575 0.17
576 0.16
577 0.14
578 0.13
579 0.14
580 0.2
581 0.21
582 0.23
583 0.23
584 0.28
585 0.3
586 0.35
587 0.34
588 0.3
589 0.3
590 0.32
591 0.34
592 0.32
593 0.35
594 0.33
595 0.37
596 0.38
597 0.4
598 0.4
599 0.41
600 0.39
601 0.34
602 0.39
603 0.38
604 0.42
605 0.43
606 0.44
607 0.43
608 0.47
609 0.48
610 0.46
611 0.5
612 0.44
613 0.42
614 0.38
615 0.35
616 0.35
617 0.43
618 0.41
619 0.4
620 0.42
621 0.41
622 0.45
623 0.47
624 0.52
625 0.5
626 0.51
627 0.54
628 0.55
629 0.61
630 0.58
631 0.54
632 0.47
633 0.44
634 0.41
635 0.38
636 0.35
637 0.31
638 0.28
639 0.26
640 0.24
641 0.19
642 0.18
643 0.16
644 0.14
645 0.18
646 0.2
647 0.23
648 0.25
649 0.26
650 0.28
651 0.29
652 0.36
653 0.39
654 0.41
655 0.43
656 0.48
657 0.56
658 0.55
659 0.59
660 0.61
661 0.6
662 0.63
663 0.62
664 0.59
665 0.55
666 0.58
667 0.55
668 0.56
669 0.54
670 0.52
671 0.54
672 0.58
673 0.6
674 0.58
675 0.58
676 0.57
677 0.61