Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7SJJ7

Protein Details
Accession A0A4Y7SJJ7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-123APESIRRERKPTKKVKKERGEPETPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-116RRERKPTKKVKKER
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11.833, cyto 6, cyto_nucl 5.333, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MTASGPFAMGPAMAGNAGSRRSTPRSNFAPSIAPSTSGSSTLGAGLSKTAPPSLRRDLDLKGKGKEVKAEEDEEVYSDQDDGVEIIDLDNVRTMDWMAPESIRRERKPTKKVKKERGEPETPGDVDAANALDLSESEEEEEEPELEDVIEDFATQVNLDSDDASLREERLYLFQFPTPFPAFLSPPKPPQAAAEDVEMADATAEGVKKVSFGPDVKPPAAATPATSRTASTAPPESAETERLDGLIGRLEVYRSGAVKIRMGDGIVFDVNPATQPSFLQQAVYIDRNEKRLTVLGEVNKQFVASPDVDILLQALEDADSAVAELPIEGEDALIKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.09
4 0.12
5 0.12
6 0.14
7 0.2
8 0.26
9 0.35
10 0.39
11 0.45
12 0.5
13 0.56
14 0.56
15 0.53
16 0.53
17 0.46
18 0.47
19 0.39
20 0.34
21 0.28
22 0.3
23 0.28
24 0.22
25 0.22
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.14
37 0.16
38 0.19
39 0.26
40 0.33
41 0.35
42 0.36
43 0.38
44 0.4
45 0.47
46 0.52
47 0.5
48 0.44
49 0.47
50 0.49
51 0.47
52 0.49
53 0.43
54 0.42
55 0.4
56 0.41
57 0.35
58 0.33
59 0.31
60 0.26
61 0.23
62 0.16
63 0.13
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.16
88 0.24
89 0.29
90 0.3
91 0.38
92 0.47
93 0.56
94 0.65
95 0.72
96 0.75
97 0.79
98 0.88
99 0.9
100 0.91
101 0.91
102 0.9
103 0.87
104 0.82
105 0.73
106 0.68
107 0.6
108 0.5
109 0.41
110 0.31
111 0.22
112 0.16
113 0.14
114 0.09
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.19
170 0.23
171 0.2
172 0.23
173 0.26
174 0.26
175 0.24
176 0.24
177 0.25
178 0.23
179 0.22
180 0.19
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.13
185 0.09
186 0.06
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.14
200 0.21
201 0.25
202 0.24
203 0.25
204 0.24
205 0.22
206 0.23
207 0.2
208 0.15
209 0.16
210 0.19
211 0.21
212 0.21
213 0.19
214 0.19
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.21
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.13
240 0.11
241 0.12
242 0.16
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.13
251 0.14
252 0.12
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.17
268 0.21
269 0.23
270 0.23
271 0.24
272 0.27
273 0.31
274 0.31
275 0.28
276 0.26
277 0.28
278 0.29
279 0.27
280 0.31
281 0.33
282 0.4
283 0.41
284 0.4
285 0.35
286 0.33
287 0.29
288 0.24
289 0.23
290 0.15
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.05