Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DPK1

Protein Details
Accession A5DPK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
666-687TNSDKEKRKSFFGFKRKQKSEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
672-687KRKSFFGFKRKQKSEK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG pgu:PGUG_05202  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
CDD cd02257  Peptidase_C19  
cd02663  Peptidase_C19G  
Amino Acid Sequences MTQDHPAPPTSLPYGDGSSKVYGMENFGNTCYCNSILQCLYYSDKFRTKLALHNITQHNRKEVMAGVKNHNFTLKYESLVQKRLREQPKNAAIENGTSERVKPTRKGSLFGLKFNTSTTNSVNTSSTDDSSRKWYITEAKNCDALSAEQKLLIRKNPEFQDLPVMVTRHTSSPLELAEKSDNSQSSSMLLNEKTEKSNTPTSVKEGSITSQSCFIIVGIPQPEVDLVNPINPFNPNPSSDHRKRSALINGPIINLDHSLQLPTQQSDETALLYALKDMFECMIENKSQIGVVSPSHFITKLKEKNYLFRQVNMHQDAHEFYNYLINEIIEVVDKECGPNNNWCNEIFQGMITNETKCISCETITSKEEEFLDLSIDIPPGDAAYSLTHCLNNFSRSETLTHQNKFYCNNCCSLQEATKTIKLKKLPEVLVINFKRFKYDESVDKMVKLFDSISYPFKLRLFNTSAKGQTEDFTLYELYALVIHIGGGPMHGHYVALCKVKAQLWLLFDDETVEVVDDSFVLKFFGNGPGLASAYILFYQKVHMAGLLGFKEEDVYCGEDWLPQRHNSAETVQAKSQPEVWSTHSSESGSTDSIKDLSSSAVFDKNPFKKNYKIENKEDTISRTSSTKEKQPEKKTWVGGLKRRQSKNDVPTDRKASTGSVMSTPSTNSDKEKRKSFFGFKRKQKSEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.27
4 0.25
5 0.24
6 0.23
7 0.22
8 0.21
9 0.18
10 0.2
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.22
17 0.22
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.23
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.24
27 0.28
28 0.3
29 0.33
30 0.34
31 0.39
32 0.4
33 0.4
34 0.44
35 0.41
36 0.46
37 0.52
38 0.54
39 0.49
40 0.57
41 0.64
42 0.65
43 0.7
44 0.65
45 0.6
46 0.53
47 0.51
48 0.43
49 0.4
50 0.42
51 0.41
52 0.43
53 0.46
54 0.51
55 0.52
56 0.51
57 0.49
58 0.4
59 0.35
60 0.37
61 0.3
62 0.27
63 0.32
64 0.39
65 0.41
66 0.48
67 0.51
68 0.49
69 0.55
70 0.63
71 0.66
72 0.67
73 0.68
74 0.71
75 0.75
76 0.73
77 0.66
78 0.61
79 0.51
80 0.45
81 0.43
82 0.34
83 0.28
84 0.23
85 0.23
86 0.26
87 0.3
88 0.32
89 0.33
90 0.38
91 0.46
92 0.48
93 0.5
94 0.5
95 0.56
96 0.54
97 0.53
98 0.52
99 0.43
100 0.42
101 0.39
102 0.38
103 0.29
104 0.29
105 0.27
106 0.26
107 0.25
108 0.27
109 0.27
110 0.24
111 0.26
112 0.25
113 0.24
114 0.23
115 0.23
116 0.23
117 0.28
118 0.29
119 0.25
120 0.23
121 0.26
122 0.32
123 0.4
124 0.48
125 0.48
126 0.48
127 0.52
128 0.51
129 0.47
130 0.39
131 0.32
132 0.27
133 0.24
134 0.21
135 0.2
136 0.22
137 0.26
138 0.28
139 0.31
140 0.33
141 0.32
142 0.39
143 0.4
144 0.44
145 0.41
146 0.38
147 0.42
148 0.35
149 0.35
150 0.31
151 0.28
152 0.22
153 0.23
154 0.23
155 0.16
156 0.19
157 0.17
158 0.14
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.18
163 0.2
164 0.2
165 0.21
166 0.21
167 0.23
168 0.22
169 0.21
170 0.21
171 0.18
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.19
179 0.21
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.32
185 0.32
186 0.32
187 0.32
188 0.34
189 0.36
190 0.33
191 0.3
192 0.24
193 0.22
194 0.25
195 0.24
196 0.2
197 0.2
198 0.19
199 0.18
200 0.17
201 0.15
202 0.1
203 0.1
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.16
221 0.18
222 0.16
223 0.2
224 0.27
225 0.35
226 0.4
227 0.47
228 0.46
229 0.47
230 0.46
231 0.48
232 0.49
233 0.48
234 0.46
235 0.45
236 0.42
237 0.39
238 0.38
239 0.33
240 0.25
241 0.18
242 0.14
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.14
286 0.22
287 0.27
288 0.28
289 0.36
290 0.36
291 0.44
292 0.49
293 0.55
294 0.46
295 0.44
296 0.46
297 0.42
298 0.49
299 0.44
300 0.39
301 0.29
302 0.29
303 0.27
304 0.23
305 0.2
306 0.12
307 0.09
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.09
324 0.1
325 0.17
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.2
332 0.19
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.1
348 0.14
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.19
353 0.19
354 0.19
355 0.18
356 0.14
357 0.09
358 0.1
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.2
384 0.2
385 0.26
386 0.31
387 0.32
388 0.32
389 0.32
390 0.34
391 0.36
392 0.37
393 0.35
394 0.3
395 0.32
396 0.3
397 0.3
398 0.3
399 0.29
400 0.28
401 0.23
402 0.25
403 0.25
404 0.28
405 0.31
406 0.3
407 0.32
408 0.33
409 0.35
410 0.38
411 0.43
412 0.39
413 0.41
414 0.43
415 0.39
416 0.45
417 0.42
418 0.39
419 0.36
420 0.35
421 0.32
422 0.29
423 0.3
424 0.27
425 0.3
426 0.33
427 0.36
428 0.41
429 0.38
430 0.39
431 0.37
432 0.3
433 0.26
434 0.19
435 0.13
436 0.09
437 0.12
438 0.13
439 0.15
440 0.16
441 0.17
442 0.18
443 0.2
444 0.22
445 0.19
446 0.24
447 0.26
448 0.3
449 0.32
450 0.35
451 0.36
452 0.33
453 0.34
454 0.29
455 0.24
456 0.21
457 0.19
458 0.14
459 0.13
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.08
481 0.12
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.17
486 0.19
487 0.23
488 0.22
489 0.22
490 0.21
491 0.23
492 0.23
493 0.21
494 0.19
495 0.16
496 0.14
497 0.11
498 0.09
499 0.08
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.08
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.13
518 0.12
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.11
532 0.15
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.11
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.1
541 0.12
542 0.11
543 0.13
544 0.13
545 0.15
546 0.18
547 0.23
548 0.25
549 0.24
550 0.27
551 0.28
552 0.29
553 0.28
554 0.27
555 0.31
556 0.32
557 0.35
558 0.34
559 0.38
560 0.38
561 0.37
562 0.39
563 0.33
564 0.3
565 0.28
566 0.31
567 0.33
568 0.33
569 0.35
570 0.31
571 0.29
572 0.28
573 0.28
574 0.24
575 0.19
576 0.17
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.15
581 0.13
582 0.11
583 0.12
584 0.12
585 0.13
586 0.14
587 0.17
588 0.18
589 0.21
590 0.31
591 0.36
592 0.43
593 0.47
594 0.5
595 0.54
596 0.63
597 0.7
598 0.71
599 0.72
600 0.73
601 0.77
602 0.76
603 0.72
604 0.66
605 0.6
606 0.53
607 0.46
608 0.39
609 0.32
610 0.31
611 0.34
612 0.36
613 0.4
614 0.45
615 0.54
616 0.63
617 0.7
618 0.77
619 0.76
620 0.79
621 0.76
622 0.74
623 0.74
624 0.73
625 0.73
626 0.74
627 0.76
628 0.77
629 0.79
630 0.77
631 0.76
632 0.77
633 0.77
634 0.78
635 0.78
636 0.75
637 0.77
638 0.79
639 0.7
640 0.62
641 0.54
642 0.45
643 0.39
644 0.36
645 0.3
646 0.25
647 0.26
648 0.26
649 0.25
650 0.24
651 0.24
652 0.24
653 0.24
654 0.28
655 0.36
656 0.45
657 0.52
658 0.61
659 0.6
660 0.65
661 0.71
662 0.75
663 0.76
664 0.77
665 0.8
666 0.81
667 0.88