Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7SPI5

Protein Details
Accession A0A4Y7SPI5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-414AMEDEQPKKKKKKDGPGVTARNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
399-405KKKKKKD
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSTPAVKQDPDAATTSQAPATTSVPPMTSAAPTPVSVVAAGTPVQTYPSPAHAQWAAQMVIDPQLQQQAANTGSTTPKPLTAQVTVPTTQQPQASQYYATAYQHYPYYQQYLANYSTQQQQHAAATAAHAHSSTPVTTRTSFSVATTPAPPTPVVAAYTPAAVATAPAAAAQAAQSSNLDTNDIATLNDALGSAGVDLRAEEESLQRQDASSHLQSTSSLYMQNRQYEDRSRKQPIKPAFNTVNLGTTMRTIGTEHKVTRIPEDSINYMALALKARLQDLIEAMIEASRYRKEAQFDRPANFYESLQPGATQGETPMWSIMVRSDVAKQLAVLERIEREDETRIRRERKERLELQTQHAASLAAQADGGAMMGITGTGGAVGVMGMSNGMGAMEDEQPKKKKKKDGPGVTARNLSEDVRKKMSNAVATQAAGLGKYSWMTASASTPAPKKAAAASTPGANANGGAGGGPSAWARPYVPKKPQQAQPATTGTEIEEPKEDPSKITVTMRDAMFVIEKERGHGAGKGAARGWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.23
4 0.21
5 0.19
6 0.18
7 0.2
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.14
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.11
32 0.1
33 0.13
34 0.14
35 0.19
36 0.23
37 0.22
38 0.27
39 0.26
40 0.27
41 0.26
42 0.29
43 0.23
44 0.19
45 0.2
46 0.16
47 0.18
48 0.18
49 0.16
50 0.12
51 0.17
52 0.17
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.17
58 0.17
59 0.14
60 0.18
61 0.19
62 0.21
63 0.18
64 0.2
65 0.21
66 0.24
67 0.27
68 0.26
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.3
73 0.29
74 0.29
75 0.28
76 0.28
77 0.27
78 0.24
79 0.24
80 0.27
81 0.27
82 0.24
83 0.22
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.23
88 0.2
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.23
95 0.21
96 0.23
97 0.23
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.24
102 0.22
103 0.28
104 0.27
105 0.27
106 0.24
107 0.24
108 0.23
109 0.24
110 0.22
111 0.15
112 0.14
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.16
124 0.17
125 0.19
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.2
130 0.22
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.18
136 0.19
137 0.17
138 0.14
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.16
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.17
204 0.17
205 0.12
206 0.14
207 0.13
208 0.19
209 0.22
210 0.25
211 0.25
212 0.25
213 0.28
214 0.34
215 0.41
216 0.43
217 0.47
218 0.5
219 0.56
220 0.57
221 0.62
222 0.61
223 0.64
224 0.58
225 0.58
226 0.54
227 0.49
228 0.47
229 0.39
230 0.33
231 0.23
232 0.22
233 0.15
234 0.12
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.09
240 0.13
241 0.16
242 0.16
243 0.18
244 0.21
245 0.22
246 0.24
247 0.23
248 0.21
249 0.2
250 0.21
251 0.19
252 0.18
253 0.17
254 0.14
255 0.12
256 0.1
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.12
279 0.16
280 0.22
281 0.3
282 0.38
283 0.41
284 0.42
285 0.42
286 0.41
287 0.4
288 0.35
289 0.28
290 0.22
291 0.2
292 0.2
293 0.18
294 0.16
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.13
325 0.12
326 0.16
327 0.2
328 0.24
329 0.31
330 0.37
331 0.42
332 0.49
333 0.55
334 0.6
335 0.64
336 0.68
337 0.68
338 0.68
339 0.72
340 0.69
341 0.66
342 0.64
343 0.55
344 0.45
345 0.38
346 0.31
347 0.21
348 0.22
349 0.17
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.03
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.05
380 0.09
381 0.13
382 0.16
383 0.23
384 0.29
385 0.39
386 0.47
387 0.53
388 0.6
389 0.66
390 0.75
391 0.79
392 0.84
393 0.85
394 0.87
395 0.87
396 0.8
397 0.75
398 0.64
399 0.55
400 0.45
401 0.37
402 0.35
403 0.35
404 0.36
405 0.37
406 0.37
407 0.36
408 0.41
409 0.44
410 0.41
411 0.35
412 0.34
413 0.31
414 0.31
415 0.3
416 0.25
417 0.2
418 0.14
419 0.13
420 0.09
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.06
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.11
429 0.13
430 0.16
431 0.19
432 0.22
433 0.23
434 0.23
435 0.23
436 0.22
437 0.23
438 0.26
439 0.24
440 0.26
441 0.26
442 0.27
443 0.28
444 0.27
445 0.24
446 0.18
447 0.17
448 0.12
449 0.1
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.08
460 0.09
461 0.19
462 0.28
463 0.37
464 0.46
465 0.54
466 0.63
467 0.71
468 0.77
469 0.77
470 0.77
471 0.71
472 0.69
473 0.65
474 0.58
475 0.5
476 0.43
477 0.34
478 0.32
479 0.29
480 0.24
481 0.22
482 0.2
483 0.24
484 0.29
485 0.28
486 0.23
487 0.26
488 0.27
489 0.29
490 0.32
491 0.32
492 0.31
493 0.37
494 0.35
495 0.32
496 0.3
497 0.27
498 0.26
499 0.23
500 0.21
501 0.2
502 0.2
503 0.21
504 0.23
505 0.23
506 0.22
507 0.24
508 0.24
509 0.25
510 0.28
511 0.28