Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7U1X3

Protein Details
Accession A0A4Y7U1X3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-97RTESPAPKPKPIPKPTPRSSYGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDNTQTNQRPQPLGATPQDDADRIRLKRLQKLQALQSQSANSAGASASGSSSPAGTGAAAPSGSVNTSKAVTPARTESPAPKPKPIPKPTPRSSYGAYGAQQPTPPAARPVQRKIVPLDLESWEHQALQDVLKVTLSKEVAEKSGYDIVWLKGLAEDLMSDEATPPKLSIDLIDQLLISRLELDPQAMTDDFDYLPVLVSLPASQTVFEYLVGAWKRLNSTRAALFKKSHPPVEIQNAATRLEKLRELVISYAGLILQEPEMFPQPSGKELGPPELIKPLLSLSALSTPLLSGPDAPNTLAPTDIEQFLQDLARRFEPDNEIDSILGPVVRGLCFHESLFRADGLSGHDAGWRGVVGGLEALTSVKSIATMITRLDDWIPTTATAVTFENVSLLGPLCRLGLFAREWPSIAKTYFAEPDKRSRDDLESSFATLRSTLKSLQSSLFKIFDSLVRASPASREQVLQYFAHVIRLNTRRAGMQVDPDTVASDSYMLNLQNVLLRFCEPFMDANYSKIDRIDPYFYAHSKRIPLDDETRIKATSDEASSWASEHPPKEPPNFLSNIFFLTIAMAHYGYLKTTDTYNSTHKQMDEIKRHLEHIQGDGSWMGTPMQARVEHAINTVKTEESKVRMQQLAFEAGLMDPEVLFRSINFINFLSVWLIRQADPKKTHPNPIAEIPLPKEVPMAFRCLPEYIVEDIVDYLHFATQTSPDKFELAGKTELLVFVLTFLTSTWYIKNPFLKSKINDVLFLSIWGYGREKYGVLGNMLNTHPLALKHLMPALMHFYIEVEQTGASSQFYDKFNARRNIAYVLKVVWNNPTHREALKAETKNVDKFVRFVNLMINDVTYLMDESLGELAQIHDIQTEMDDRETWERQTQEHRREREGTLRSLERHASSYTTLGRSTVELLKLFTAETKAPFMMPEIVDRLAAMLDYNLQALVGPRCSNLKVREPEKLKFDPKLLLNYILQVFINLSDQDEFVQAVAGDGRSYSKELFERAMGTAMRKNIKTQTELDVLRAFVEKVEDAKASMQEEEDLGEVPDEFLDPLMFTVMKDPVMLPSSKTIIDRATIKSHLLSDSKDPFNRAPLTIEDVIEQPDMKLKITTFLQERRHKAAALAEDSENAMNVDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.45
4 0.39
5 0.41
6 0.41
7 0.36
8 0.32
9 0.33
10 0.35
11 0.32
12 0.39
13 0.4
14 0.44
15 0.53
16 0.6
17 0.62
18 0.63
19 0.69
20 0.71
21 0.73
22 0.73
23 0.66
24 0.61
25 0.53
26 0.45
27 0.39
28 0.3
29 0.22
30 0.17
31 0.14
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.21
59 0.21
60 0.25
61 0.29
62 0.32
63 0.34
64 0.37
65 0.4
66 0.46
67 0.54
68 0.54
69 0.57
70 0.61
71 0.67
72 0.75
73 0.77
74 0.78
75 0.78
76 0.84
77 0.84
78 0.83
79 0.78
80 0.73
81 0.67
82 0.63
83 0.57
84 0.52
85 0.45
86 0.44
87 0.43
88 0.39
89 0.37
90 0.31
91 0.31
92 0.29
93 0.29
94 0.25
95 0.29
96 0.35
97 0.43
98 0.5
99 0.55
100 0.57
101 0.59
102 0.59
103 0.61
104 0.55
105 0.48
106 0.44
107 0.37
108 0.36
109 0.34
110 0.33
111 0.25
112 0.23
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.19
124 0.18
125 0.16
126 0.18
127 0.2
128 0.2
129 0.21
130 0.2
131 0.19
132 0.24
133 0.22
134 0.21
135 0.22
136 0.21
137 0.22
138 0.21
139 0.17
140 0.13
141 0.14
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.15
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.09
173 0.1
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.1
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.2
205 0.23
206 0.25
207 0.21
208 0.25
209 0.31
210 0.38
211 0.41
212 0.41
213 0.41
214 0.46
215 0.53
216 0.54
217 0.52
218 0.45
219 0.44
220 0.47
221 0.52
222 0.49
223 0.41
224 0.4
225 0.38
226 0.38
227 0.35
228 0.3
229 0.24
230 0.22
231 0.22
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.17
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.15
253 0.15
254 0.17
255 0.2
256 0.18
257 0.2
258 0.21
259 0.25
260 0.24
261 0.24
262 0.24
263 0.25
264 0.25
265 0.19
266 0.19
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.25
306 0.25
307 0.25
308 0.24
309 0.23
310 0.21
311 0.2
312 0.17
313 0.13
314 0.1
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.09
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.16
325 0.16
326 0.19
327 0.2
328 0.17
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.13
392 0.17
393 0.17
394 0.18
395 0.18
396 0.2
397 0.2
398 0.19
399 0.17
400 0.13
401 0.15
402 0.2
403 0.22
404 0.26
405 0.25
406 0.34
407 0.38
408 0.39
409 0.39
410 0.36
411 0.37
412 0.36
413 0.36
414 0.31
415 0.26
416 0.26
417 0.25
418 0.22
419 0.19
420 0.14
421 0.14
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.2
429 0.22
430 0.23
431 0.24
432 0.23
433 0.19
434 0.19
435 0.18
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.14
440 0.14
441 0.15
442 0.14
443 0.15
444 0.16
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.14
449 0.16
450 0.19
451 0.17
452 0.15
453 0.16
454 0.16
455 0.19
456 0.19
457 0.16
458 0.21
459 0.25
460 0.26
461 0.24
462 0.24
463 0.21
464 0.21
465 0.24
466 0.17
467 0.19
468 0.19
469 0.19
470 0.18
471 0.18
472 0.17
473 0.14
474 0.13
475 0.08
476 0.07
477 0.05
478 0.05
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.08
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.1
495 0.16
496 0.15
497 0.16
498 0.18
499 0.18
500 0.18
501 0.17
502 0.16
503 0.11
504 0.14
505 0.15
506 0.14
507 0.16
508 0.19
509 0.2
510 0.22
511 0.22
512 0.21
513 0.22
514 0.22
515 0.2
516 0.2
517 0.22
518 0.23
519 0.29
520 0.3
521 0.29
522 0.29
523 0.28
524 0.26
525 0.23
526 0.19
527 0.15
528 0.13
529 0.11
530 0.11
531 0.12
532 0.11
533 0.12
534 0.11
535 0.1
536 0.12
537 0.12
538 0.13
539 0.18
540 0.21
541 0.23
542 0.25
543 0.26
544 0.27
545 0.28
546 0.27
547 0.23
548 0.2
549 0.19
550 0.17
551 0.14
552 0.1
553 0.08
554 0.07
555 0.05
556 0.06
557 0.04
558 0.04
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.12
569 0.17
570 0.19
571 0.21
572 0.22
573 0.21
574 0.23
575 0.29
576 0.34
577 0.36
578 0.37
579 0.39
580 0.38
581 0.4
582 0.37
583 0.33
584 0.26
585 0.21
586 0.19
587 0.14
588 0.14
589 0.12
590 0.12
591 0.08
592 0.07
593 0.06
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.11
601 0.12
602 0.11
603 0.13
604 0.16
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.12
609 0.11
610 0.13
611 0.14
612 0.14
613 0.18
614 0.19
615 0.23
616 0.25
617 0.24
618 0.26
619 0.25
620 0.24
621 0.2
622 0.18
623 0.14
624 0.11
625 0.11
626 0.08
627 0.06
628 0.03
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.08
635 0.09
636 0.09
637 0.11
638 0.1
639 0.11
640 0.11
641 0.12
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.09
646 0.1
647 0.09
648 0.16
649 0.19
650 0.25
651 0.29
652 0.34
653 0.43
654 0.45
655 0.52
656 0.5
657 0.52
658 0.47
659 0.46
660 0.45
661 0.36
662 0.35
663 0.3
664 0.28
665 0.24
666 0.21
667 0.19
668 0.15
669 0.18
670 0.17
671 0.21
672 0.18
673 0.19
674 0.2
675 0.2
676 0.2
677 0.16
678 0.18
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.11
683 0.1
684 0.1
685 0.09
686 0.06
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.1
693 0.16
694 0.18
695 0.2
696 0.2
697 0.2
698 0.2
699 0.24
700 0.22
701 0.19
702 0.19
703 0.17
704 0.17
705 0.16
706 0.16
707 0.12
708 0.1
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.04
714 0.04
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.09
719 0.12
720 0.15
721 0.18
722 0.25
723 0.26
724 0.31
725 0.36
726 0.41
727 0.4
728 0.46
729 0.5
730 0.45
731 0.43
732 0.38
733 0.35
734 0.28
735 0.26
736 0.18
737 0.12
738 0.11
739 0.11
740 0.11
741 0.09
742 0.1
743 0.11
744 0.11
745 0.1
746 0.13
747 0.13
748 0.13
749 0.14
750 0.13
751 0.16
752 0.16
753 0.16
754 0.12
755 0.12
756 0.11
757 0.1
758 0.13
759 0.12
760 0.13
761 0.13
762 0.15
763 0.15
764 0.14
765 0.15
766 0.16
767 0.14
768 0.13
769 0.12
770 0.11
771 0.11
772 0.11
773 0.1
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.07
782 0.11
783 0.13
784 0.15
785 0.19
786 0.25
787 0.33
788 0.39
789 0.4
790 0.37
791 0.38
792 0.42
793 0.41
794 0.36
795 0.29
796 0.25
797 0.27
798 0.26
799 0.24
800 0.24
801 0.26
802 0.26
803 0.29
804 0.3
805 0.29
806 0.28
807 0.32
808 0.27
809 0.3
810 0.36
811 0.34
812 0.35
813 0.38
814 0.41
815 0.4
816 0.42
817 0.39
818 0.31
819 0.3
820 0.3
821 0.29
822 0.26
823 0.24
824 0.25
825 0.23
826 0.24
827 0.22
828 0.19
829 0.14
830 0.14
831 0.14
832 0.08
833 0.07
834 0.05
835 0.05
836 0.05
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.05
841 0.05
842 0.05
843 0.06
844 0.07
845 0.06
846 0.06
847 0.06
848 0.06
849 0.07
850 0.09
851 0.08
852 0.09
853 0.09
854 0.11
855 0.16
856 0.18
857 0.19
858 0.22
859 0.23
860 0.25
861 0.35
862 0.43
863 0.48
864 0.55
865 0.58
866 0.59
867 0.62
868 0.62
869 0.61
870 0.56
871 0.5
872 0.48
873 0.48
874 0.44
875 0.43
876 0.43
877 0.35
878 0.33
879 0.3
880 0.25
881 0.22
882 0.24
883 0.24
884 0.23
885 0.21
886 0.19
887 0.19
888 0.18
889 0.2
890 0.2
891 0.19
892 0.18
893 0.18
894 0.18
895 0.18
896 0.17
897 0.15
898 0.14
899 0.13
900 0.14
901 0.16
902 0.16
903 0.16
904 0.16
905 0.16
906 0.18
907 0.17
908 0.18
909 0.18
910 0.18
911 0.17
912 0.17
913 0.15
914 0.1
915 0.1
916 0.07
917 0.05
918 0.06
919 0.06
920 0.07
921 0.06
922 0.06
923 0.06
924 0.09
925 0.11
926 0.13
927 0.13
928 0.14
929 0.17
930 0.19
931 0.26
932 0.29
933 0.36
934 0.42
935 0.45
936 0.54
937 0.57
938 0.6
939 0.6
940 0.63
941 0.59
942 0.54
943 0.53
944 0.5
945 0.48
946 0.5
947 0.45
948 0.41
949 0.36
950 0.36
951 0.34
952 0.28
953 0.25
954 0.18
955 0.16
956 0.12
957 0.14
958 0.1
959 0.11
960 0.1
961 0.11
962 0.11
963 0.12
964 0.11
965 0.08
966 0.09
967 0.08
968 0.07
969 0.08
970 0.08
971 0.07
972 0.07
973 0.09
974 0.1
975 0.12
976 0.12
977 0.15
978 0.18
979 0.2
980 0.22
981 0.22
982 0.22
983 0.21
984 0.25
985 0.21
986 0.22
987 0.25
988 0.28
989 0.33
990 0.32
991 0.35
992 0.39
993 0.42
994 0.43
995 0.42
996 0.42
997 0.43
998 0.43
999 0.42
1000 0.37
1001 0.32
1002 0.3
1003 0.28
1004 0.21
1005 0.14
1006 0.16
1007 0.14
1008 0.13
1009 0.16
1010 0.15
1011 0.15
1012 0.18
1013 0.2
1014 0.19
1015 0.18
1016 0.17
1017 0.15
1018 0.15
1019 0.15
1020 0.13
1021 0.11
1022 0.09
1023 0.09
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.07
1028 0.07
1029 0.06
1030 0.06
1031 0.06
1032 0.06
1033 0.08
1034 0.08
1035 0.08
1036 0.11
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.13
1040 0.13
1041 0.15
1042 0.19
1043 0.19
1044 0.18
1045 0.2
1046 0.23
1047 0.24
1048 0.25
1049 0.23
1050 0.22
1051 0.25
1052 0.28
1053 0.28
1054 0.31
1055 0.31
1056 0.32
1057 0.32
1058 0.32
1059 0.33
1060 0.31
1061 0.29
1062 0.31
1063 0.38
1064 0.43
1065 0.44
1066 0.46
1067 0.43
1068 0.48
1069 0.49
1070 0.42
1071 0.38
1072 0.33
1073 0.38
1074 0.35
1075 0.34
1076 0.28
1077 0.26
1078 0.27
1079 0.24
1080 0.21
1081 0.14
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.19
1085 0.2
1086 0.18
1087 0.23
1088 0.25
1089 0.32
1090 0.33
1091 0.4
1092 0.49
1093 0.56
1094 0.62
1095 0.63
1096 0.65
1097 0.58
1098 0.54
1099 0.52
1100 0.5
1101 0.45
1102 0.43
1103 0.36
1104 0.34
1105 0.34
1106 0.32
1107 0.25