FuNGI

A0A4Y7TEW0

Protein Details

Accession

A0A4Y7TEW0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-60	VEEEKSPSKSKKEKEKERREKSQQQANERLKA	Hydrophilic
89-111	WKVYHIGKFKKRMNKENIPSRAY	Hydrophilic
415-438	TTSTQPPPSPSRHRNRRGGAPPAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-49	PSKSKKEKEKERREK
249-322	DKKKPLAPPPPAISNHSSKPGDISAPLSKKAKKKAAEAAQKAAATAKNGPEAKAGTASQPAALAPKPPKKSKSG
380-387	PKERGKDK
489-515	RGRGGARGGRGGGRARGGRGGPPPRGG

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MVKYVGSGSNSRSSTPPSAEAGGREMVDVEEEKSPSKSKKEKEKERREKSQQQANERLKAVVRRLPPNLPEDVFWQTVQKWVTEETVSWKVYHIGKFKKRMNKENIPSRAYIAFKDEDLLIRFSGEFDGHLFKDKAGNESYAIVEYAPYQKVPSEKRKQDSKHNTIEKDEDYISFMKALNAPTGEPVTLEALIAATRPPEPPKTTPLLEALKAEKLAQKDKEAILRNHAHYKDQANIAAIATNPNRKDDKKKPLAPPPPAISNHSSKPGDISAPLSKKAKKKAAEAAQKAAATAKNGPEAKAGTASQPAALAPKPPKKSKSGATAPPVILAAKPAPAAPAPAAAAETPPADAAPSRRPRALIGRHLGLALGDIGASARSPKERGKDKPSTEAKPEAKAGATAASESSQAPAAKDTTSTQPPPSPSRHRNRRGGAPPATPTAATKAPVVAQRSTSGGVPAAPIILQKPTVPPAAPVPGVIIPPVVPSVDRGRGGARGGRGGGRARGGRGGPPPRGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.38
3	0.38
4	0.33
5	0.36
6	0.35
7	0.34
8	0.32
9	0.28
10	0.24
11	0.21
12	0.18
13	0.14
14	0.15
15	0.15
16	0.13
17	0.15
18	0.16
19	0.17
20	0.2
21	0.26
22	0.29
23	0.38
24	0.45
25	0.5
26	0.61
27	0.7
28	0.79
29	0.84
30	0.9
31	0.92
32	0.93
33	0.95
34	0.94
35	0.93
36	0.91
37	0.9
38	0.86
39	0.84
40	0.85
41	0.81
42	0.77
43	0.68
44	0.61
45	0.55
46	0.54
47	0.5
48	0.46
49	0.46
50	0.46
51	0.49
52	0.53
53	0.52
54	0.5
55	0.49
56	0.44
57	0.38
58	0.35
59	0.35
60	0.3
61	0.27
62	0.26
63	0.21
64	0.25
65	0.25
66	0.22
67	0.18
68	0.18
69	0.2
70	0.19
71	0.19
72	0.21
73	0.27
74	0.27
75	0.25
76	0.24
77	0.27
78	0.31
79	0.36
80	0.38
81	0.42
82	0.49
83	0.58
84	0.66
85	0.71
86	0.74
87	0.78
88	0.8
89	0.8
90	0.82
91	0.83
92	0.82
93	0.76
94	0.68
95	0.61
96	0.55
97	0.46
98	0.37
99	0.31
100	0.25
101	0.21
102	0.22
103	0.19
104	0.18
105	0.19
106	0.19
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.13
111	0.14
112	0.11
113	0.09
114	0.09
115	0.13
116	0.12
117	0.18
118	0.17
119	0.17
120	0.22
121	0.22
122	0.24
123	0.22
124	0.23
125	0.19
126	0.2
127	0.2
128	0.15
129	0.14
130	0.11
131	0.09
132	0.09
133	0.12
134	0.12
135	0.11
136	0.11
137	0.13
138	0.19
139	0.27
140	0.36
141	0.43
142	0.5
143	0.57
144	0.66
145	0.69
146	0.74
147	0.77
148	0.75
149	0.74
150	0.74
151	0.69
152	0.63
153	0.62
154	0.52
155	0.44
156	0.36
157	0.26
158	0.21
159	0.2
160	0.17
161	0.15
162	0.14
163	0.12
164	0.14
165	0.14
166	0.13
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.12
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.08
176	0.08
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.05
182	0.04
183	0.05
184	0.07
185	0.1
186	0.14
187	0.19
188	0.21
189	0.26
190	0.3
191	0.3
192	0.3
193	0.33
194	0.31
195	0.28
196	0.27
197	0.24
198	0.2
199	0.2
200	0.19
201	0.17
202	0.17
203	0.22
204	0.21
205	0.22
206	0.23
207	0.25
208	0.3
209	0.33
210	0.31
211	0.33
212	0.36
213	0.36
214	0.41
215	0.4
216	0.34
217	0.32
218	0.33
219	0.3
220	0.26
221	0.25
222	0.18
223	0.18
224	0.16
225	0.14
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.15
230	0.15
231	0.17
232	0.21
233	0.22
234	0.31
235	0.37
236	0.46
237	0.52
238	0.6
239	0.64
240	0.71
241	0.76
242	0.72
243	0.68
244	0.6
245	0.56
246	0.49
247	0.45
248	0.39
249	0.34
250	0.3
251	0.31
252	0.29
253	0.23
254	0.23
255	0.21
256	0.18
257	0.15
258	0.17
259	0.17
260	0.18
261	0.21
262	0.23
263	0.28
264	0.32
265	0.4
266	0.44
267	0.42
268	0.45
269	0.52
270	0.58
271	0.62
272	0.6
273	0.55
274	0.51
275	0.47
276	0.42
277	0.35
278	0.26
279	0.18
280	0.18
281	0.15
282	0.18
283	0.19
284	0.19
285	0.19
286	0.19
287	0.18
288	0.18
289	0.17
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.13
299	0.18
300	0.26
301	0.31
302	0.37
303	0.4
304	0.43
305	0.49
306	0.5
307	0.53
308	0.53
309	0.54
310	0.53
311	0.55
312	0.5
313	0.45
314	0.39
315	0.3
316	0.22
317	0.17
318	0.13
319	0.08
320	0.09
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.08
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.09
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.07
339	0.1
340	0.19
341	0.26
342	0.29
343	0.3
344	0.31
345	0.34
346	0.42
347	0.47
348	0.46
349	0.43
350	0.43
351	0.42
352	0.41
353	0.37
354	0.28
355	0.2
356	0.12
357	0.07
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.06
365	0.08
366	0.11
367	0.16
368	0.24
369	0.33
370	0.41
371	0.49
372	0.58
373	0.6
374	0.67
375	0.7
376	0.67
377	0.64
378	0.66
379	0.59
380	0.53
381	0.51
382	0.42
383	0.35
384	0.3
385	0.26
386	0.19
387	0.16
388	0.12
389	0.11
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.12
395	0.12
396	0.12
397	0.14
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.17
402	0.2
403	0.26
404	0.28
405	0.29
406	0.33
407	0.37
408	0.41
409	0.47
410	0.51
411	0.55
412	0.64
413	0.71
414	0.76
415	0.81
416	0.82
417	0.84
418	0.82
419	0.81
420	0.76
421	0.71
422	0.65
423	0.59
424	0.54
425	0.43
426	0.37
427	0.32
428	0.28
429	0.23
430	0.21
431	0.18
432	0.21
433	0.25
434	0.28
435	0.25
436	0.25
437	0.25
438	0.27
439	0.26
440	0.23
441	0.2
442	0.17
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.1
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.12
452	0.12
453	0.15
454	0.18
455	0.21
456	0.21
457	0.22
458	0.25
459	0.29
460	0.28
461	0.25
462	0.25
463	0.23
464	0.23
465	0.21
466	0.17
467	0.12
468	0.13
469	0.14
470	0.11
471	0.09
472	0.12
473	0.18
474	0.24
475	0.24
476	0.24
477	0.26
478	0.28
479	0.32
480	0.33
481	0.29
482	0.27
483	0.29
484	0.3
485	0.32
486	0.33
487	0.33
488	0.35
489	0.35
490	0.34
491	0.37
492	0.36
493	0.38
494	0.43
495	0.48

A0A4Y7TEW0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer