FuNGI

A0A4Y7SVL5

Protein Details

Accession

A0A4Y7SVL5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
704-724	DVQILLDSTKRKRRKKMKKHK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
713-724	KRKRRKKMKKHK

Subcellular Location(s)

nucl 7.5, cyto_nucl 7.5, plas 7, cyto 6.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028606 Clp1 IPR045116 Clp1/Grc3 IPR010655 Clp1_C IPR038238 Clp1_C_sf IPR032324 Clp1_N IPR038239 Clp1_N_sf IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005849 C:mRNA cleavage factor complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing
Pfam	View protein in Pfam PF06807 Clp1 PF16573 CLP1_N PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MSEGNSPPQRPREWTLEPETEYRFELDPDTTLAIKLIKGRAEIFGAELIEGKIYLFTQECKAALYTWHGCTIEMSQPSTEYVSEETPMSAYGNVHIALEQMRVRALSKIRGSPLPPGQDNVDPKLTEPPRVLILGPENAGKTTVAKILANYTVRAGQGWSPLLANVDPSEGAWAVPGSLSVTAVKSSIPTFSPATPLGFSATSAPVVISSHAHKPLVYWYGHNDTKRNPLLMDRLIRNLGENVNDRFDMYPESKAAGVIVDTPASFASNSSPPEHRQKLIKACVDAFRINVILVVGHEKLNVEMQRAYGSYISVVKIPKSGGVVELDHSYRERVQKYQLHTYMYGFAAQPPAGVTAGTLGGEAPPDLVLSPSSTRIKFGELSIYRIGTETMAPSSALPVGAARVMSEMQPVPVNPGAPGSALINAVVAVLAPHSADENERYDEELLDLPVTSFVYMWSRRTSTMSSAFRRLVTAPSSRRAYSVFSSKSGGGRYFNSAKSKAPAVVAAKAKSDTASSSKDASSSTSTASPDGTSPNDPSASRTVADTPGVVEPPSSPRTAVASPGADQQLADSVDDLAAYAAPHPTPSSSDFKLHQFFSLHRPLLLLNNPPSMFTPGPSFQAILSGPKPAQAQEKVPISVFDDYPTEAHLDADAIAARQLGRALAMSRLGSATAWETTLKHLGLDPAKEPERVELQGQMDKDWEDVQILLDSTKRKRRKKMKKHK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.6
3	0.6
4	0.58
5	0.57
6	0.55
7	0.48
8	0.42
9	0.38
10	0.31
11	0.25
12	0.24
13	0.21
14	0.18
15	0.18
16	0.2
17	0.17
18	0.17
19	0.17
20	0.15
21	0.16
22	0.2
23	0.22
24	0.22
25	0.24
26	0.25
27	0.26
28	0.27
29	0.26
30	0.22
31	0.2
32	0.18
33	0.15
34	0.15
35	0.13
36	0.11
37	0.11
38	0.09
39	0.07
40	0.07
41	0.09
42	0.1
43	0.12
44	0.15
45	0.18
46	0.18
47	0.19
48	0.2
49	0.19
50	0.19
51	0.25
52	0.26
53	0.25
54	0.3
55	0.29
56	0.28
57	0.29
58	0.3
59	0.29
60	0.27
61	0.26
62	0.22
63	0.22
64	0.24
65	0.24
66	0.2
67	0.15
68	0.15
69	0.14
70	0.15
71	0.15
72	0.14
73	0.12
74	0.13
75	0.12
76	0.11
77	0.1
78	0.1
79	0.12
80	0.12
81	0.12
82	0.11
83	0.11
84	0.11
85	0.14
86	0.14
87	0.12
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.19
92	0.21
93	0.26
94	0.3
95	0.34
96	0.37
97	0.41
98	0.42
99	0.45
100	0.48
101	0.47
102	0.43
103	0.4
104	0.4
105	0.42
106	0.44
107	0.4
108	0.37
109	0.3
110	0.3
111	0.38
112	0.36
113	0.34
114	0.32
115	0.3
116	0.28
117	0.29
118	0.28
119	0.21
120	0.24
121	0.22
122	0.21
123	0.21
124	0.19
125	0.18
126	0.19
127	0.16
128	0.13
129	0.12
130	0.14
131	0.14
132	0.14
133	0.15
134	0.17
135	0.23
136	0.23
137	0.21
138	0.2
139	0.2
140	0.2
141	0.19
142	0.17
143	0.14
144	0.17
145	0.17
146	0.16
147	0.14
148	0.15
149	0.16
150	0.14
151	0.13
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.12
177	0.14
178	0.15
179	0.18
180	0.18
181	0.19
182	0.18
183	0.17
184	0.16
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.13
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.08
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.1
197	0.15
198	0.17
199	0.18
200	0.17
201	0.18
202	0.22
203	0.25
204	0.23
205	0.19
206	0.22
207	0.29
208	0.33
209	0.34
210	0.32
211	0.3
212	0.38
213	0.4
214	0.36
215	0.29
216	0.29
217	0.32
218	0.35
219	0.38
220	0.3
221	0.31
222	0.31
223	0.3
224	0.28
225	0.24
226	0.2
227	0.18
228	0.2
229	0.19
230	0.2
231	0.2
232	0.19
233	0.17
234	0.17
235	0.17
236	0.15
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.09
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.08
255	0.11
256	0.13
257	0.15
258	0.18
259	0.21
260	0.3
261	0.33
262	0.33
263	0.35
264	0.4
265	0.45
266	0.5
267	0.49
268	0.42
269	0.41
270	0.43
271	0.41
272	0.35
273	0.27
274	0.2
275	0.17
276	0.15
277	0.13
278	0.09
279	0.06
280	0.06
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.12
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.1
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.1
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.12
318	0.17
319	0.17
320	0.18
321	0.25
322	0.29
323	0.34
324	0.42
325	0.41
326	0.38
327	0.37
328	0.36
329	0.31
330	0.27
331	0.23
332	0.14
333	0.12
334	0.11
335	0.1
336	0.09
337	0.07
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.04
356	0.05
357	0.06
358	0.1
359	0.13
360	0.13
361	0.14
362	0.15
363	0.16
364	0.16
365	0.16
366	0.21
367	0.19
368	0.23
369	0.22
370	0.22
371	0.2
372	0.19
373	0.19
374	0.1
375	0.1
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.09
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.04
414	0.04
415	0.02
416	0.02
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.04
422	0.05
423	0.07
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.13
428	0.13
429	0.12
430	0.13
431	0.12
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.05
439	0.04
440	0.05
441	0.1
442	0.11
443	0.13
444	0.16
445	0.17
446	0.18
447	0.21
448	0.22
449	0.22
450	0.3
451	0.35
452	0.35
453	0.38
454	0.39
455	0.36
456	0.36
457	0.32
458	0.26
459	0.23
460	0.27
461	0.26
462	0.31
463	0.34
464	0.33
465	0.33
466	0.31
467	0.31
468	0.27
469	0.32
470	0.28
471	0.26
472	0.28
473	0.29
474	0.3
475	0.28
476	0.26
477	0.2
478	0.2
479	0.24
480	0.26
481	0.29
482	0.32
483	0.31
484	0.31
485	0.32
486	0.32
487	0.27
488	0.24
489	0.24
490	0.21
491	0.26
492	0.29
493	0.27
494	0.26
495	0.25
496	0.25
497	0.21
498	0.19
499	0.15
500	0.15
501	0.18
502	0.18
503	0.2
504	0.2
505	0.2
506	0.2
507	0.2
508	0.2
509	0.17
510	0.17
511	0.17
512	0.18
513	0.17
514	0.18
515	0.16
516	0.13
517	0.15
518	0.15
519	0.15
520	0.16
521	0.18
522	0.19
523	0.19
524	0.21
525	0.22
526	0.21
527	0.2
528	0.19
529	0.19
530	0.19
531	0.2
532	0.16
533	0.14
534	0.14
535	0.15
536	0.13
537	0.11
538	0.1
539	0.16
540	0.18
541	0.17
542	0.15
543	0.16
544	0.2
545	0.21
546	0.22
547	0.2
548	0.2
549	0.2
550	0.25
551	0.24
552	0.2
553	0.19
554	0.16
555	0.17
556	0.16
557	0.14
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.09
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.09
572	0.11
573	0.16
574	0.21
575	0.23
576	0.27
577	0.29
578	0.35
579	0.38
580	0.36
581	0.35
582	0.31
583	0.31
584	0.35
585	0.41
586	0.35
587	0.31
588	0.31
589	0.29
590	0.33
591	0.35
592	0.34
593	0.28
594	0.34
595	0.34
596	0.34
597	0.35
598	0.34
599	0.3
600	0.25
601	0.27
602	0.23
603	0.26
604	0.26
605	0.24
606	0.18
607	0.22
608	0.21
609	0.2
610	0.19
611	0.2
612	0.19
613	0.22
614	0.24
615	0.22
616	0.29
617	0.28
618	0.32
619	0.35
620	0.4
621	0.38
622	0.37
623	0.36
624	0.31
625	0.31
626	0.27
627	0.21
628	0.18
629	0.18
630	0.18
631	0.18
632	0.16
633	0.12
634	0.12
635	0.11
636	0.1
637	0.09
638	0.1
639	0.09
640	0.08
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.09
646	0.08
647	0.08
648	0.09
649	0.1
650	0.12
651	0.14
652	0.14
653	0.14
654	0.14
655	0.14
656	0.12
657	0.13
658	0.13
659	0.11
660	0.12
661	0.12
662	0.13
663	0.16
664	0.21
665	0.2
666	0.18
667	0.19
668	0.25
669	0.28
670	0.31
671	0.29
672	0.33
673	0.35
674	0.36
675	0.35
676	0.33
677	0.33
678	0.32
679	0.32
680	0.29
681	0.31
682	0.34
683	0.34
684	0.3
685	0.27
686	0.25
687	0.25
688	0.2
689	0.16
690	0.13
691	0.13
692	0.13
693	0.14
694	0.13
695	0.13
696	0.16
697	0.21
698	0.29
699	0.39
700	0.48
701	0.55
702	0.66
703	0.76
704	0.84

A0A4Y7SVL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer