Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7TTR1

Protein Details
Accession A0A4Y7TTR1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-47MSPSSPKPVSKRKADATKNGHPQKKLKKSEVPKKQTDSKGKGRDREFHydrophilic
253-280AHQPYSSTPSPKKPKKKVAPVQDQPDEGHydrophilic
305-327EREEPESAPKPSKKKRKSKKEKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-43KPVSKRKADATKNGHPQKKLKKSEVPKKQTDSKGKGR
264-269KKPKKK
310-327ESAPKPSKKKRKSKKEKA
Subcellular Location(s) nucl 22, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSPSSPKPVSKRKADATKNGHPQKKLKKSEVPKKQTDSKGKGRDREFQVVSADMTVSVAPVYAGNPRAGVEELLDSLVMRYISALQGVVLSHSNLKFTSERGTVKYDCPFIVCDIRFDATIWNPRTGMKLQGRINLSSPDHISLLVHRTFNVSIPRHHIPSDVWEFEYGPAENDPQFGGNHEEEAEGGDGSEENPEGTSEETDSGSGRWVNRSTGECLGGSSAVVEFTVIGLTVANEMLSLLGSIQNDPFSPAHQPYSSTPSPKKPKKKVAPVQDQPDEGEQDDVDSEDEDAFQLLKRKAEAAEEREEPESAPKPSKKKRKSKKEKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.8
4 0.82
5 0.83
6 0.84
7 0.81
8 0.76
9 0.78
10 0.79
11 0.81
12 0.8
13 0.78
14 0.79
15 0.83
16 0.88
17 0.89
18 0.87
19 0.85
20 0.83
21 0.84
22 0.84
23 0.83
24 0.81
25 0.8
26 0.82
27 0.8
28 0.81
29 0.76
30 0.76
31 0.73
32 0.73
33 0.64
34 0.56
35 0.51
36 0.44
37 0.39
38 0.3
39 0.23
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.06
45 0.05
46 0.04
47 0.05
48 0.06
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.2
86 0.2
87 0.23
88 0.24
89 0.29
90 0.28
91 0.31
92 0.33
93 0.3
94 0.25
95 0.24
96 0.23
97 0.2
98 0.25
99 0.22
100 0.19
101 0.19
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.18
106 0.15
107 0.23
108 0.24
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.26
113 0.25
114 0.29
115 0.26
116 0.31
117 0.33
118 0.38
119 0.39
120 0.37
121 0.37
122 0.33
123 0.29
124 0.23
125 0.22
126 0.17
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.1
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.14
136 0.14
137 0.17
138 0.22
139 0.2
140 0.19
141 0.25
142 0.27
143 0.26
144 0.26
145 0.25
146 0.18
147 0.22
148 0.25
149 0.2
150 0.18
151 0.17
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.12
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.14
197 0.15
198 0.18
199 0.2
200 0.22
201 0.22
202 0.23
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.16
239 0.17
240 0.21
241 0.2
242 0.23
243 0.23
244 0.31
245 0.33
246 0.36
247 0.39
248 0.45
249 0.56
250 0.63
251 0.71
252 0.73
253 0.81
254 0.84
255 0.91
256 0.9
257 0.9
258 0.91
259 0.89
260 0.88
261 0.81
262 0.72
263 0.62
264 0.56
265 0.46
266 0.36
267 0.28
268 0.19
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.23
286 0.23
287 0.31
288 0.37
289 0.35
290 0.4
291 0.4
292 0.42
293 0.41
294 0.41
295 0.33
296 0.32
297 0.31
298 0.29
299 0.36
300 0.4
301 0.49
302 0.59
303 0.7
304 0.74
305 0.8
306 0.87
307 0.9