Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DEF8

Protein Details
Accession A5DEF8    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37TTGSSGSSRGRNNKNRGRGGSSHydrophilic
526-552SLQQQYKIRRESKKSKKQQHQDELMEEHydrophilic
615-634QGKGIRRYIRVSKYKRTFKYHydrophilic
667-687DGNATKDRIRQRNKSGHNAYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-13RRG
19-51SSGSSRGRNNKNRGRGGSSSTSRRAANGGKRAG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034082  R3H_G-patch  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pgu:PGUG_01659  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS51061  R3H  
CDD cd02646  R3H_G-patch  
Amino Acid Sequences MARGNRRNGSRRGSGTTGSSGSSRGRNNKNRGRGGSSSTSRRAANGGKRAGAGKFNAPELMDLDFGAIDDVNMGTGSMRSLSKRPGRNTMMQEAFLTSKHTDRFVGEPLRKRPIEFIKAKEVYDPRAILEKVINKDEANDADEATDITVSLRETTIAEQNEDNVNLDHDENEKENEKEDVEDQKPVEKDEESKDNLEGLREAIENDEKVKSAKIDDETLEQPTIEMEDSDNEDDSQSDSEGFFIDTSAQPTNSPPAYVPPNDIGPNIDYDPVLTIGNVQLHTSGAGNDITASVRSSTHHDELDSLDEFSDSESDEDAYADYIRQLNEQDSSEELSSSDSENESASTDANVSSTNSPQIVEYGFLSEDYEFDVSQISVTNVRFGIKNQFYSRCLELTGSVDDYMWVDEDDLIDFVTSKGVKEHRLESFLSYITNGMINKTENDEEEEQEVYVSSDSESDREIYGGTAPEIEEDDDGIADLVAFSKSSTKFRDTIDTSAVGTTGKGSRKQLDLERFAQYELDDDIIDSLQQQYKIRRESKKSKKQQHQDELMEEGLNKYNLLLKYPYTLHIKDIKDEFESFLHNPARDDLSFPPLDPHGNKTLTKMAKCYNCKSATQGKGIRRYIRVSKYKRTFKYLPDYGHINAILRQRPVFNRVDQKRPKEEYIATDGNATKDRIRQRNKSGHNAYIPEGHIVGGMAPEIDHTNVGRQLLEKLGWVKGEGLGAHGNKGISEPLVATVKKSKTGLGQTRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.53
3 0.49
4 0.43
5 0.35
6 0.3
7 0.26
8 0.26
9 0.3
10 0.34
11 0.39
12 0.49
13 0.58
14 0.68
15 0.75
16 0.81
17 0.84
18 0.82
19 0.8
20 0.73
21 0.71
22 0.7
23 0.67
24 0.65
25 0.61
26 0.59
27 0.52
28 0.49
29 0.47
30 0.46
31 0.48
32 0.49
33 0.49
34 0.47
35 0.48
36 0.5
37 0.46
38 0.42
39 0.36
40 0.34
41 0.32
42 0.31
43 0.31
44 0.28
45 0.27
46 0.23
47 0.22
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.07
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.08
65 0.1
66 0.12
67 0.16
68 0.26
69 0.34
70 0.42
71 0.47
72 0.55
73 0.59
74 0.65
75 0.68
76 0.68
77 0.63
78 0.56
79 0.51
80 0.44
81 0.38
82 0.3
83 0.28
84 0.2
85 0.21
86 0.22
87 0.23
88 0.22
89 0.23
90 0.26
91 0.29
92 0.37
93 0.4
94 0.47
95 0.51
96 0.59
97 0.57
98 0.55
99 0.56
100 0.56
101 0.59
102 0.56
103 0.55
104 0.57
105 0.59
106 0.58
107 0.57
108 0.5
109 0.45
110 0.44
111 0.39
112 0.3
113 0.35
114 0.34
115 0.29
116 0.31
117 0.33
118 0.32
119 0.35
120 0.35
121 0.27
122 0.29
123 0.31
124 0.27
125 0.23
126 0.19
127 0.16
128 0.14
129 0.15
130 0.13
131 0.1
132 0.08
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.11
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.18
146 0.2
147 0.22
148 0.21
149 0.2
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.17
159 0.19
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.18
164 0.17
165 0.19
166 0.24
167 0.22
168 0.26
169 0.25
170 0.29
171 0.29
172 0.29
173 0.28
174 0.21
175 0.24
176 0.25
177 0.32
178 0.29
179 0.3
180 0.29
181 0.29
182 0.28
183 0.25
184 0.2
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.17
200 0.17
201 0.19
202 0.2
203 0.23
204 0.23
205 0.25
206 0.23
207 0.18
208 0.16
209 0.13
210 0.13
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.17
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.16
243 0.2
244 0.2
245 0.22
246 0.19
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.19
251 0.15
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.12
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.18
288 0.19
289 0.21
290 0.17
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.05
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.19
371 0.18
372 0.22
373 0.24
374 0.27
375 0.28
376 0.3
377 0.31
378 0.22
379 0.21
380 0.17
381 0.15
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.09
405 0.11
406 0.15
407 0.17
408 0.21
409 0.21
410 0.24
411 0.24
412 0.23
413 0.22
414 0.19
415 0.17
416 0.13
417 0.11
418 0.09
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.12
426 0.12
427 0.11
428 0.15
429 0.16
430 0.15
431 0.16
432 0.16
433 0.13
434 0.12
435 0.12
436 0.08
437 0.07
438 0.06
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.04
470 0.09
471 0.11
472 0.15
473 0.19
474 0.21
475 0.24
476 0.26
477 0.34
478 0.32
479 0.33
480 0.32
481 0.29
482 0.27
483 0.24
484 0.22
485 0.14
486 0.11
487 0.1
488 0.12
489 0.14
490 0.17
491 0.2
492 0.24
493 0.26
494 0.31
495 0.36
496 0.39
497 0.42
498 0.41
499 0.42
500 0.4
501 0.37
502 0.33
503 0.26
504 0.19
505 0.14
506 0.12
507 0.08
508 0.07
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.08
514 0.1
515 0.12
516 0.15
517 0.21
518 0.28
519 0.36
520 0.44
521 0.5
522 0.57
523 0.66
524 0.75
525 0.8
526 0.84
527 0.86
528 0.89
529 0.9
530 0.92
531 0.91
532 0.88
533 0.81
534 0.72
535 0.64
536 0.54
537 0.45
538 0.34
539 0.25
540 0.19
541 0.15
542 0.12
543 0.1
544 0.15
545 0.15
546 0.17
547 0.17
548 0.15
549 0.19
550 0.21
551 0.25
552 0.25
553 0.26
554 0.28
555 0.34
556 0.35
557 0.35
558 0.37
559 0.35
560 0.31
561 0.32
562 0.29
563 0.22
564 0.25
565 0.21
566 0.25
567 0.27
568 0.24
569 0.24
570 0.25
571 0.28
572 0.24
573 0.26
574 0.21
575 0.24
576 0.24
577 0.23
578 0.23
579 0.2
580 0.25
581 0.23
582 0.26
583 0.26
584 0.3
585 0.3
586 0.31
587 0.38
588 0.4
589 0.4
590 0.4
591 0.41
592 0.47
593 0.53
594 0.54
595 0.55
596 0.52
597 0.52
598 0.54
599 0.56
600 0.52
601 0.55
602 0.57
603 0.56
604 0.62
605 0.67
606 0.66
607 0.61
608 0.61
609 0.61
610 0.64
611 0.67
612 0.65
613 0.7
614 0.74
615 0.8
616 0.78
617 0.78
618 0.74
619 0.72
620 0.74
621 0.71
622 0.64
623 0.58
624 0.58
625 0.5
626 0.48
627 0.41
628 0.31
629 0.29
630 0.32
631 0.32
632 0.3
633 0.3
634 0.31
635 0.34
636 0.39
637 0.39
638 0.4
639 0.47
640 0.51
641 0.6
642 0.64
643 0.69
644 0.73
645 0.75
646 0.71
647 0.67
648 0.65
649 0.59
650 0.59
651 0.53
652 0.44
653 0.42
654 0.4
655 0.36
656 0.35
657 0.31
658 0.26
659 0.3
660 0.39
661 0.44
662 0.52
663 0.59
664 0.66
665 0.75
666 0.8
667 0.83
668 0.8
669 0.78
670 0.75
671 0.69
672 0.61
673 0.56
674 0.49
675 0.4
676 0.34
677 0.26
678 0.19
679 0.16
680 0.14
681 0.08
682 0.07
683 0.06
684 0.05
685 0.06
686 0.08
687 0.08
688 0.09
689 0.1
690 0.14
691 0.17
692 0.18
693 0.17
694 0.17
695 0.19
696 0.21
697 0.21
698 0.2
699 0.21
700 0.23
701 0.22
702 0.22
703 0.21
704 0.19
705 0.21
706 0.17
707 0.17
708 0.21
709 0.21
710 0.22
711 0.23
712 0.21
713 0.18
714 0.2
715 0.18
716 0.12
717 0.12
718 0.11
719 0.14
720 0.2
721 0.2
722 0.22
723 0.29
724 0.31
725 0.36
726 0.36
727 0.35
728 0.37
729 0.48