Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5D9V1

Protein Details
Accession A5D9V1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-118VRAAIQSVRRNRKRSLKQTNNASSRKKKLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-116RRNRKRSLKQTNNASSRKKKL
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
KEGG pgu:PGUG_00056  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MMTSSHLGESEDLHRRVGVTHYIRTKLNFFDDTLWKRFSARRLELIDALDLSCRKASEQESEIKRVAETLRLEFNYGPEYIQDFDRLVRAAIQSVRRNRKRSLKQTNNASSRKKKLKTASSVSLSEYHESPSPEQVLSTIATPSYSTDEDMSSLRFVSEIARLHSDSQDDMDGYNRSRRFTSHDKSRAVIDSIIQPKQTKLHPRTLPPLTARNSSFQGNSTYAALLGFIERSKTCADSTVAQGSNLENLGRSAIQCCVSYIFETSLSDTSSASVEYLNTRITSPSFLATLYRDLDPSQASCDDEVAVISLHTLIGGCIKDFGFGQVMMVLSDCLHSAVIQSYPLLTKKPGQTSGNITPVAAGSTTHLDSLATIATNLQDDRKRSSPSTDDDKKNKKAVTLRYMNTVLAFSYPATTSAVPRLIELLDNGRTAFHITHLGDTRVLGLRNMRDGKIINSDSTLEMIFKKDERIELELYIQDSKAVPISELTSTISPNVQNPIVLPPVGKIISQPPDNQAFPFLSKKEGTPPLQPNFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.29
4 0.3
5 0.32
6 0.28
7 0.35
8 0.41
9 0.44
10 0.46
11 0.48
12 0.48
13 0.42
14 0.43
15 0.38
16 0.33
17 0.36
18 0.43
19 0.46
20 0.47
21 0.44
22 0.39
23 0.41
24 0.44
25 0.45
26 0.46
27 0.45
28 0.48
29 0.51
30 0.54
31 0.54
32 0.5
33 0.44
34 0.34
35 0.29
36 0.25
37 0.2
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.14
42 0.19
43 0.22
44 0.25
45 0.3
46 0.37
47 0.41
48 0.46
49 0.47
50 0.42
51 0.38
52 0.35
53 0.31
54 0.29
55 0.26
56 0.25
57 0.3
58 0.3
59 0.32
60 0.29
61 0.3
62 0.26
63 0.23
64 0.2
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.13
71 0.14
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.15
76 0.15
77 0.17
78 0.21
79 0.28
80 0.34
81 0.44
82 0.55
83 0.6
84 0.64
85 0.68
86 0.74
87 0.77
88 0.8
89 0.82
90 0.82
91 0.83
92 0.88
93 0.9
94 0.89
95 0.86
96 0.84
97 0.81
98 0.8
99 0.82
100 0.75
101 0.73
102 0.74
103 0.76
104 0.76
105 0.75
106 0.73
107 0.68
108 0.65
109 0.59
110 0.54
111 0.46
112 0.39
113 0.31
114 0.24
115 0.22
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.19
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.14
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.12
146 0.13
147 0.15
148 0.18
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.21
165 0.22
166 0.27
167 0.35
168 0.42
169 0.46
170 0.53
171 0.53
172 0.53
173 0.55
174 0.5
175 0.42
176 0.34
177 0.24
178 0.24
179 0.26
180 0.27
181 0.25
182 0.23
183 0.23
184 0.26
185 0.3
186 0.32
187 0.33
188 0.41
189 0.44
190 0.48
191 0.55
192 0.54
193 0.53
194 0.47
195 0.49
196 0.43
197 0.43
198 0.39
199 0.35
200 0.34
201 0.3
202 0.28
203 0.22
204 0.22
205 0.18
206 0.18
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.16
226 0.2
227 0.2
228 0.18
229 0.19
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.12
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.16
334 0.21
335 0.26
336 0.31
337 0.31
338 0.33
339 0.4
340 0.44
341 0.44
342 0.38
343 0.33
344 0.27
345 0.26
346 0.23
347 0.15
348 0.1
349 0.06
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.12
365 0.15
366 0.17
367 0.23
368 0.27
369 0.31
370 0.31
371 0.37
372 0.37
373 0.39
374 0.47
375 0.51
376 0.55
377 0.6
378 0.68
379 0.69
380 0.7
381 0.65
382 0.61
383 0.6
384 0.6
385 0.6
386 0.6
387 0.55
388 0.54
389 0.55
390 0.49
391 0.42
392 0.33
393 0.23
394 0.15
395 0.15
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.16
404 0.19
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.16
409 0.16
410 0.16
411 0.16
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.15
418 0.14
419 0.11
420 0.15
421 0.15
422 0.21
423 0.23
424 0.24
425 0.22
426 0.22
427 0.24
428 0.21
429 0.21
430 0.17
431 0.19
432 0.2
433 0.28
434 0.32
435 0.29
436 0.29
437 0.3
438 0.31
439 0.35
440 0.35
441 0.27
442 0.26
443 0.27
444 0.24
445 0.24
446 0.21
447 0.14
448 0.13
449 0.14
450 0.15
451 0.15
452 0.18
453 0.19
454 0.22
455 0.25
456 0.29
457 0.28
458 0.27
459 0.29
460 0.27
461 0.27
462 0.25
463 0.21
464 0.17
465 0.16
466 0.16
467 0.16
468 0.14
469 0.12
470 0.12
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.17
475 0.15
476 0.15
477 0.16
478 0.18
479 0.17
480 0.18
481 0.22
482 0.2
483 0.19
484 0.2
485 0.23
486 0.22
487 0.22
488 0.2
489 0.16
490 0.21
491 0.21
492 0.2
493 0.17
494 0.23
495 0.29
496 0.32
497 0.34
498 0.35
499 0.4
500 0.42
501 0.4
502 0.36
503 0.31
504 0.32
505 0.36
506 0.31
507 0.3
508 0.31
509 0.32
510 0.37
511 0.43
512 0.44
513 0.47
514 0.54
515 0.55
516 0.62
517 0.6