Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5E6F0

Protein Details
Accession A5E6F0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-335DAEGNIIRRKRKYKKRAVEYDENGNVIKKKYKKRKTAATAEGDKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-307RRKRKYKKRA
317-335IKKKYKKRKTAATAEGDKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG lel:LELG_05189  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MFICSLSTQFFVFRDDDDLYYLFLNFRVYMYIYRYIQIYSSGRKGATPEFISHIIAFLHIYLDTYFYIQRSTTISTLYIMTESSQPKQSSKLSQPTQTSQTNDASPETPLPPVIYPKRKRKGLFTKDIENLLFAMGDAPYTQESTINAIEDILIDYVTMLASKMVHRASSQGRRNRIKLNDLAFVLRHDPLKLSRMLYILEQSHRIEKAKKMFNDDDDAQDASGKKVKRKGGGLFDDESDGDDDEEDDGGDGENGEGGVGGERGVHYNEEDGEDGEGGSKEESLLGEPVLDAEGNIIRRKRKYKKRAVEYDENGNVIKKKYKKRKTAATAEGDKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.2
6 0.18
7 0.18
8 0.17
9 0.13
10 0.12
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.15
17 0.19
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.26
22 0.24
23 0.23
24 0.26
25 0.26
26 0.24
27 0.28
28 0.3
29 0.29
30 0.3
31 0.32
32 0.3
33 0.33
34 0.3
35 0.28
36 0.3
37 0.31
38 0.32
39 0.28
40 0.25
41 0.18
42 0.15
43 0.13
44 0.09
45 0.08
46 0.06
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.16
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.09
67 0.1
68 0.14
69 0.16
70 0.18
71 0.24
72 0.25
73 0.25
74 0.3
75 0.33
76 0.35
77 0.41
78 0.48
79 0.46
80 0.51
81 0.54
82 0.54
83 0.56
84 0.52
85 0.47
86 0.41
87 0.39
88 0.34
89 0.31
90 0.28
91 0.23
92 0.2
93 0.19
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.12
99 0.19
100 0.26
101 0.34
102 0.42
103 0.52
104 0.6
105 0.66
106 0.67
107 0.71
108 0.74
109 0.73
110 0.75
111 0.69
112 0.68
113 0.63
114 0.63
115 0.53
116 0.41
117 0.32
118 0.21
119 0.16
120 0.09
121 0.07
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.09
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.05
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.12
155 0.19
156 0.27
157 0.34
158 0.38
159 0.46
160 0.5
161 0.53
162 0.57
163 0.54
164 0.5
165 0.47
166 0.45
167 0.39
168 0.35
169 0.33
170 0.26
171 0.23
172 0.2
173 0.16
174 0.13
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.15
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.17
189 0.16
190 0.18
191 0.19
192 0.21
193 0.21
194 0.25
195 0.32
196 0.37
197 0.38
198 0.43
199 0.44
200 0.44
201 0.47
202 0.43
203 0.37
204 0.31
205 0.29
206 0.21
207 0.21
208 0.19
209 0.14
210 0.18
211 0.17
212 0.2
213 0.27
214 0.32
215 0.35
216 0.41
217 0.45
218 0.5
219 0.53
220 0.53
221 0.47
222 0.43
223 0.39
224 0.33
225 0.27
226 0.19
227 0.13
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.05
279 0.06
280 0.1
281 0.12
282 0.17
283 0.21
284 0.27
285 0.36
286 0.47
287 0.56
288 0.64
289 0.72
290 0.79
291 0.86
292 0.91
293 0.93
294 0.92
295 0.92
296 0.86
297 0.85
298 0.76
299 0.66
300 0.56
301 0.49
302 0.43
303 0.36
304 0.4
305 0.39
306 0.47
307 0.57
308 0.66
309 0.74
310 0.8
311 0.88
312 0.9
313 0.91
314 0.9
315 0.88