Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1HTV8

Protein Details
Accession A0A4Z1HTV8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-33SQNERFSHSHHERHHRRIVNBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 13, mito 5, nucl 4, cyto 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MINITGVYSATALSQNERFSHSHHERHHRRIVNHDDSIDELASLANAEIILFEGMKATVLANQLRLQNPQRNSRNLDKNSSSHHKTAGSPNGSYADTLPKELVTAVRIMAESNPQQASIPQFPTSLISISGTNDTIVMAQALLYPDGLHGWAPSVLPLLYSAQKPAQHTNIKRESSTFWMRSIKHNGQSPFAPTGYQVWRNVMDYGAAGDGLTDDTAAFNSAISDGGRCCIDCGSSKIYPATVFFPPGAYLVSSPIIQYYNSEILGDRTGLPMIIAASSFVGLGVITSAVYIGTTEGWCLNTNNFLRSIKNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.22
4 0.26
5 0.26
6 0.26
7 0.36
8 0.4
9 0.45
10 0.51
11 0.61
12 0.66
13 0.74
14 0.8
15 0.78
16 0.73
17 0.75
18 0.76
19 0.73
20 0.67
21 0.59
22 0.5
23 0.44
24 0.43
25 0.33
26 0.22
27 0.14
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.06
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.08
46 0.11
47 0.13
48 0.14
49 0.18
50 0.22
51 0.24
52 0.29
53 0.33
54 0.37
55 0.42
56 0.5
57 0.53
58 0.55
59 0.6
60 0.63
61 0.67
62 0.63
63 0.66
64 0.6
65 0.56
66 0.58
67 0.6
68 0.55
69 0.47
70 0.46
71 0.4
72 0.4
73 0.45
74 0.46
75 0.4
76 0.35
77 0.35
78 0.34
79 0.32
80 0.29
81 0.22
82 0.2
83 0.17
84 0.18
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.11
98 0.11
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.18
112 0.14
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.04
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.19
153 0.25
154 0.3
155 0.33
156 0.4
157 0.46
158 0.45
159 0.43
160 0.41
161 0.36
162 0.35
163 0.4
164 0.32
165 0.28
166 0.32
167 0.33
168 0.38
169 0.44
170 0.43
171 0.41
172 0.45
173 0.43
174 0.4
175 0.4
176 0.37
177 0.31
178 0.26
179 0.21
180 0.15
181 0.19
182 0.21
183 0.24
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.23
188 0.23
189 0.19
190 0.14
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.15
221 0.2
222 0.2
223 0.22
224 0.22
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.16
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.16
288 0.22
289 0.25
290 0.26
291 0.29
292 0.29