Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1HF88

Protein Details
Accession A0A4Z1HF88    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-55AFPPHKRQRMSPNPPSQPGSHydrophilic
499-519VLDKPPTKKEMKKKAEAKTSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-478LRRRKARES
502-513KPPTKKEMKKKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQQQQPPYPMPQRPFSPPQPVNSPSTQTQQQFAFPPHKRQRMSPNPPSQPGSPYVTSPYAASGQNSASPSPHFSTVQIPQGAYTTPYSNGSNAQPSPLNLPQTPMALPPHAQPSPLSFPNQVQHHHQGNMASAHFNNFNLQMPQQHHPGGVMGPPSRPVDKNKVDGLDPLDVLGGTGVDLAEEEQYTFQQYSSSFNAQGSRSHPGNISAGHSFTQFPPGNEGSFYGSGPANQPGEAPNAKSQEDFEKKAADKAWHDAARDLAVSRQRELNNPFLNVGHVHKRMEKIAHDNGLGLNTDLNGKMGTMKLPEHFPDTTVKVQTAVGPDGAITATTGAFIPSDSLLVDQLALMSISTKHRLRGLLEDGLKLAIGRQTSSHAQIRDEWTDVAVPAINPSVATIINEGGPRSGWESAVSPLSNPLKRPLSAAGRLPTPVSDSAKAQTKTFANDVALTLRKCATKEQEAEEARLRRRKARESGDGSRAGSINPGTPGSKAPDVLDKPPTKKEMKKKAEAKTSEAASHAAANVTTTQFLGGGKSMFGKKKQYSWMTAGGSGSGTSTPGKIMTQGLGSSGASPVANPGPEKLTTDGVRRLGTWREDGGKGRNIQLRDWIMVLEDDGREKKALQKAYAQVDEDRNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.63
4 0.64
5 0.62
6 0.64
7 0.61
8 0.62
9 0.63
10 0.62
11 0.59
12 0.55
13 0.54
14 0.46
15 0.49
16 0.5
17 0.44
18 0.45
19 0.41
20 0.41
21 0.4
22 0.41
23 0.45
24 0.43
25 0.52
26 0.58
27 0.65
28 0.64
29 0.66
30 0.73
31 0.74
32 0.79
33 0.78
34 0.79
35 0.78
36 0.81
37 0.78
38 0.69
39 0.62
40 0.56
41 0.52
42 0.42
43 0.36
44 0.36
45 0.33
46 0.31
47 0.27
48 0.25
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.18
53 0.18
54 0.22
55 0.23
56 0.21
57 0.19
58 0.2
59 0.24
60 0.24
61 0.26
62 0.23
63 0.23
64 0.28
65 0.32
66 0.37
67 0.34
68 0.31
69 0.28
70 0.28
71 0.28
72 0.23
73 0.21
74 0.15
75 0.15
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.21
80 0.22
81 0.26
82 0.25
83 0.26
84 0.25
85 0.25
86 0.31
87 0.32
88 0.33
89 0.27
90 0.3
91 0.28
92 0.29
93 0.28
94 0.24
95 0.23
96 0.2
97 0.21
98 0.21
99 0.27
100 0.25
101 0.25
102 0.23
103 0.26
104 0.32
105 0.33
106 0.34
107 0.28
108 0.31
109 0.38
110 0.41
111 0.37
112 0.37
113 0.43
114 0.44
115 0.43
116 0.41
117 0.35
118 0.35
119 0.35
120 0.29
121 0.23
122 0.18
123 0.2
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.2
132 0.24
133 0.27
134 0.29
135 0.28
136 0.26
137 0.24
138 0.24
139 0.19
140 0.17
141 0.18
142 0.15
143 0.15
144 0.18
145 0.2
146 0.23
147 0.24
148 0.28
149 0.34
150 0.38
151 0.42
152 0.43
153 0.43
154 0.4
155 0.4
156 0.38
157 0.3
158 0.25
159 0.2
160 0.16
161 0.13
162 0.12
163 0.09
164 0.06
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.13
182 0.17
183 0.2
184 0.19
185 0.2
186 0.23
187 0.22
188 0.25
189 0.24
190 0.25
191 0.23
192 0.24
193 0.24
194 0.22
195 0.23
196 0.21
197 0.21
198 0.16
199 0.17
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.21
205 0.2
206 0.19
207 0.23
208 0.24
209 0.23
210 0.22
211 0.23
212 0.18
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.2
229 0.21
230 0.2
231 0.21
232 0.25
233 0.29
234 0.3
235 0.27
236 0.3
237 0.3
238 0.33
239 0.35
240 0.28
241 0.25
242 0.26
243 0.33
244 0.29
245 0.29
246 0.27
247 0.25
248 0.22
249 0.21
250 0.17
251 0.13
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.21
256 0.21
257 0.27
258 0.3
259 0.35
260 0.32
261 0.32
262 0.31
263 0.26
264 0.26
265 0.22
266 0.22
267 0.2
268 0.19
269 0.2
270 0.22
271 0.23
272 0.25
273 0.26
274 0.26
275 0.25
276 0.27
277 0.28
278 0.26
279 0.24
280 0.22
281 0.2
282 0.18
283 0.11
284 0.07
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.11
298 0.12
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.12
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.05
341 0.07
342 0.11
343 0.12
344 0.14
345 0.16
346 0.18
347 0.19
348 0.23
349 0.25
350 0.26
351 0.27
352 0.26
353 0.23
354 0.22
355 0.2
356 0.15
357 0.11
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.11
363 0.13
364 0.17
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.24
369 0.27
370 0.26
371 0.25
372 0.21
373 0.17
374 0.16
375 0.15
376 0.12
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.14
402 0.13
403 0.11
404 0.16
405 0.22
406 0.23
407 0.22
408 0.27
409 0.28
410 0.28
411 0.3
412 0.31
413 0.31
414 0.33
415 0.37
416 0.33
417 0.31
418 0.31
419 0.29
420 0.23
421 0.2
422 0.2
423 0.18
424 0.17
425 0.18
426 0.21
427 0.29
428 0.29
429 0.27
430 0.28
431 0.27
432 0.28
433 0.28
434 0.27
435 0.19
436 0.19
437 0.2
438 0.19
439 0.21
440 0.18
441 0.18
442 0.19
443 0.2
444 0.2
445 0.24
446 0.27
447 0.3
448 0.34
449 0.37
450 0.43
451 0.43
452 0.45
453 0.47
454 0.47
455 0.46
456 0.48
457 0.46
458 0.45
459 0.51
460 0.56
461 0.59
462 0.61
463 0.65
464 0.67
465 0.72
466 0.7
467 0.66
468 0.58
469 0.5
470 0.42
471 0.32
472 0.26
473 0.2
474 0.16
475 0.14
476 0.15
477 0.13
478 0.14
479 0.16
480 0.19
481 0.2
482 0.18
483 0.18
484 0.25
485 0.27
486 0.3
487 0.37
488 0.39
489 0.41
490 0.46
491 0.51
492 0.5
493 0.55
494 0.62
495 0.65
496 0.68
497 0.74
498 0.77
499 0.8
500 0.83
501 0.78
502 0.73
503 0.68
504 0.62
505 0.53
506 0.45
507 0.37
508 0.27
509 0.25
510 0.19
511 0.14
512 0.11
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.13
526 0.19
527 0.24
528 0.28
529 0.36
530 0.38
531 0.45
532 0.54
533 0.55
534 0.55
535 0.55
536 0.58
537 0.51
538 0.5
539 0.43
540 0.34
541 0.29
542 0.23
543 0.19
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.11
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.14
557 0.15
558 0.15
559 0.13
560 0.12
561 0.12
562 0.1
563 0.09
564 0.12
565 0.13
566 0.15
567 0.14
568 0.16
569 0.18
570 0.2
571 0.23
572 0.22
573 0.26
574 0.27
575 0.32
576 0.36
577 0.37
578 0.37
579 0.35
580 0.36
581 0.36
582 0.37
583 0.35
584 0.33
585 0.35
586 0.38
587 0.42
588 0.44
589 0.45
590 0.44
591 0.48
592 0.49
593 0.46
594 0.43
595 0.47
596 0.44
597 0.39
598 0.36
599 0.29
600 0.25
601 0.23
602 0.22
603 0.17
604 0.14
605 0.17
606 0.18
607 0.2
608 0.2
609 0.21
610 0.28
611 0.32
612 0.38
613 0.36
614 0.43
615 0.49
616 0.56
617 0.59
618 0.54
619 0.52