Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1HDR2

Protein Details
Accession A0A4Z1HDR2    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-67NVATGSPTKSRKRAPPKKKAKSAAEPMIGHydrophilic
139-160IKEEEPKKMRSPRKRKAVDISABasic
493-519VVKKVVKKVGKGSRKRKRTSEDSDDEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-60KSRKRAPPKKKAKS
144-155PKKMRSPRKRKA
166-175PAKPAKAKKK
481-510KKQPGFRAGKKAVVKKVVKKVGKGSRKRKR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, mito 7, cyto_nucl 7, nucl 3.5, extr 3, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPTRAATRAAEAAAALNSAAATLSSPPNTPADGKKILENVATGSPTKSRKRAPPKKKAKSAAEPMIGGWDVLPHGMGQKGDLLEDDFGNTGAKVAPTTPKRATRARVTKTTVKTSIKDEDEEKPLKLGDSLIPNLLEDIKEEEPKKMRSPRKRKAVDISAEIDGSPAKPAKAKKKSYGIVFGETPFPDHVSPTAQEAETVNSLLTALHGEVKPPDSVPAPSETVTGCGEVPDVLDATMRTLLSAATTAGNANKSMAGLKAEYGLRTSGKGAGSVSWEAVLASSQEDVEEAIRSGGLAKVKAGYIKAILQVVFDKNTKLLEALLKEVDTDVPVPFVGKVLETREQKEAEIKSLRENMLSLDYVHSLDKPAAMRVLMDLPGIGIKTAACVALFCLGRPSFAVDTHVWRHCTWLGWVPEKASRDQTFSHCEVRIPDHLKYSLHQLLLRHGKTCGRCRAATTEGSVDWESTVCQIEHLVNRTGDKKQPGFRAGKKAVVKKVVKKVGKGSRKRKRTSEDSDDEAEVEADTENYMDLEEVKGEDESYIEVEADT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.1
3 0.07
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.04
8 0.05
9 0.08
10 0.12
11 0.14
12 0.15
13 0.17
14 0.19
15 0.21
16 0.24
17 0.27
18 0.3
19 0.35
20 0.35
21 0.38
22 0.39
23 0.39
24 0.36
25 0.32
26 0.27
27 0.25
28 0.25
29 0.22
30 0.2
31 0.24
32 0.31
33 0.38
34 0.42
35 0.47
36 0.56
37 0.67
38 0.76
39 0.81
40 0.84
41 0.88
42 0.92
43 0.94
44 0.93
45 0.91
46 0.91
47 0.89
48 0.87
49 0.79
50 0.69
51 0.58
52 0.52
53 0.42
54 0.32
55 0.21
56 0.13
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.06
61 0.07
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.18
83 0.21
84 0.28
85 0.34
86 0.41
87 0.46
88 0.53
89 0.57
90 0.6
91 0.67
92 0.67
93 0.68
94 0.68
95 0.71
96 0.7
97 0.71
98 0.68
99 0.62
100 0.58
101 0.55
102 0.56
103 0.49
104 0.46
105 0.42
106 0.39
107 0.42
108 0.42
109 0.37
110 0.3
111 0.28
112 0.26
113 0.23
114 0.19
115 0.15
116 0.18
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.14
124 0.09
125 0.13
126 0.13
127 0.19
128 0.2
129 0.24
130 0.29
131 0.33
132 0.4
133 0.45
134 0.53
135 0.59
136 0.69
137 0.74
138 0.8
139 0.82
140 0.8
141 0.8
142 0.79
143 0.73
144 0.66
145 0.6
146 0.5
147 0.44
148 0.37
149 0.28
150 0.19
151 0.14
152 0.12
153 0.09
154 0.09
155 0.13
156 0.2
157 0.31
158 0.4
159 0.46
160 0.52
161 0.6
162 0.64
163 0.64
164 0.67
165 0.59
166 0.52
167 0.47
168 0.41
169 0.35
170 0.3
171 0.27
172 0.18
173 0.17
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.13
186 0.13
187 0.1
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.08
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.18
327 0.19
328 0.22
329 0.25
330 0.26
331 0.26
332 0.3
333 0.27
334 0.27
335 0.29
336 0.27
337 0.28
338 0.32
339 0.32
340 0.26
341 0.25
342 0.21
343 0.19
344 0.19
345 0.15
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.2
384 0.16
385 0.16
386 0.21
387 0.17
388 0.22
389 0.27
390 0.31
391 0.29
392 0.28
393 0.31
394 0.28
395 0.29
396 0.26
397 0.28
398 0.29
399 0.31
400 0.32
401 0.31
402 0.34
403 0.34
404 0.34
405 0.35
406 0.31
407 0.3
408 0.32
409 0.35
410 0.37
411 0.38
412 0.41
413 0.33
414 0.33
415 0.33
416 0.34
417 0.38
418 0.36
419 0.34
420 0.34
421 0.36
422 0.35
423 0.33
424 0.37
425 0.33
426 0.3
427 0.31
428 0.27
429 0.34
430 0.42
431 0.43
432 0.36
433 0.33
434 0.37
435 0.43
436 0.5
437 0.51
438 0.47
439 0.47
440 0.49
441 0.54
442 0.52
443 0.47
444 0.42
445 0.36
446 0.3
447 0.33
448 0.29
449 0.23
450 0.19
451 0.17
452 0.14
453 0.12
454 0.14
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.15
459 0.2
460 0.23
461 0.26
462 0.25
463 0.29
464 0.32
465 0.35
466 0.37
467 0.41
468 0.44
469 0.46
470 0.53
471 0.58
472 0.63
473 0.66
474 0.7
475 0.66
476 0.68
477 0.68
478 0.69
479 0.68
480 0.69
481 0.7
482 0.69
483 0.75
484 0.77
485 0.73
486 0.7
487 0.73
488 0.74
489 0.76
490 0.78
491 0.78
492 0.79
493 0.85
494 0.88
495 0.87
496 0.86
497 0.86
498 0.85
499 0.84
500 0.8
501 0.75
502 0.71
503 0.62
504 0.53
505 0.43
506 0.34
507 0.23
508 0.17
509 0.11
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.06
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.1