Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1HDK1

Protein Details
Accession A0A4Z1HDK1    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58SYNPNEKKTNKVGPKRTIARRGTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 19, cyto_nucl 11.833, cyto_pero 11.833, nucl 3.5, pero 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037700  NUP88/NUP82  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
Amino Acid Sequences MPQVLGYTPTWLSKPNPGHEIFTAKPTGIQTASGASYNPNEKKTNKVGPKRTIARRGTEIFVAVGKEIRWADLVYLKETWENKQENQRSFLKGKSQVEEEVEEEKNVARGYRTLKIPVADEIRQLVISPNSNFMAILTTHTVHVAILPEPSHLTAPDNGPMKIKTFHLGPTTHVTSRSGISTALWHPLGVNGTCLVTITKDAVVRVWELSTTDRWSFDKPTLVVDLKKLADGVSADQDFGASVAGQPSKFSPVAFEMEVASACFAGRGSGGWSPMTLWLAMREGDVYALCPLLPEKWAPPPTLIPSLSISIVSNIAAIEVDPTVTQGSKLLAQQQLDWMTDIDNQDPTQVQGSLGEPPIEVYARPSRPGKVPRLQGPFDFEMAPEVEDDEDDELFCDIYVIGPKLNAEELMDGEEEDELELDEVDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.45
4 0.45
5 0.49
6 0.48
7 0.52
8 0.44
9 0.41
10 0.37
11 0.3
12 0.31
13 0.28
14 0.29
15 0.22
16 0.22
17 0.18
18 0.19
19 0.2
20 0.18
21 0.17
22 0.15
23 0.19
24 0.27
25 0.3
26 0.32
27 0.36
28 0.38
29 0.46
30 0.53
31 0.59
32 0.6
33 0.66
34 0.71
35 0.74
36 0.83
37 0.84
38 0.84
39 0.84
40 0.79
41 0.75
42 0.72
43 0.68
44 0.6
45 0.52
46 0.43
47 0.33
48 0.3
49 0.24
50 0.17
51 0.15
52 0.12
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.18
60 0.2
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.22
65 0.23
66 0.25
67 0.29
68 0.31
69 0.34
70 0.44
71 0.51
72 0.5
73 0.54
74 0.55
75 0.53
76 0.52
77 0.51
78 0.49
79 0.49
80 0.5
81 0.48
82 0.45
83 0.42
84 0.41
85 0.39
86 0.33
87 0.29
88 0.25
89 0.22
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.1
96 0.13
97 0.18
98 0.24
99 0.26
100 0.27
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.31
105 0.32
106 0.26
107 0.25
108 0.23
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.16
113 0.14
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.14
121 0.14
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.16
152 0.15
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.21
157 0.25
158 0.28
159 0.27
160 0.26
161 0.24
162 0.21
163 0.21
164 0.2
165 0.14
166 0.11
167 0.1
168 0.12
169 0.12
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.11
177 0.1
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.19
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.03
229 0.03
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.08
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.18
284 0.21
285 0.22
286 0.23
287 0.26
288 0.29
289 0.33
290 0.32
291 0.25
292 0.24
293 0.25
294 0.23
295 0.2
296 0.16
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.08
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.1
316 0.12
317 0.18
318 0.2
319 0.21
320 0.22
321 0.26
322 0.27
323 0.25
324 0.24
325 0.18
326 0.16
327 0.19
328 0.19
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.15
341 0.16
342 0.16
343 0.13
344 0.13
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.22
350 0.24
351 0.28
352 0.3
353 0.33
354 0.41
355 0.5
356 0.53
357 0.53
358 0.59
359 0.64
360 0.69
361 0.68
362 0.62
363 0.61
364 0.54
365 0.47
366 0.39
367 0.3
368 0.25
369 0.23
370 0.21
371 0.13
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.05
385 0.07
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.15
392 0.17
393 0.15
394 0.12
395 0.12
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.06
406 0.06