Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1HJR0

Protein Details
Accession A0A4Z1HJR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-130EVDEKMDRRRKIRREAREKAEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-126RRRKIRREAREKA
Subcellular Location(s) mito 9.5, cyto_mito 9, nucl 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLSQKAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGQAAPTAYGATEKKDDEEDDERFQDPDNEVGLFSGGVYDKDDDEADRIYQEVDEKMDRRRKIRREAREKAEREEYERNNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWANLPEVGDLTGKNRRSKQELRKRFYAVPDSVIAGARDTTELGTTVMDDGGESAGGDGSDGTMTNFADIGAARDKVLKVKLDQASQGTDSMSGSATNIDPKGYLTSLAKSQINEGETQVGDIVRVRTLLESVIKTNPKHAPGWIAAARVEELAGKTVAARNIIARGCEYCPKSEDIWLENIRLNDNHNAKIIAANAIRNNDRSVRLWVESMKLESEPRAKKRVIRHALDHIPQSVNLWKEAVNLEEDPSDARLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETSENAQKVLNKARKAIPTSHEIWIAAARLGEQMGTASKINVMNRAVKALAKESAMLKREDWITEAEKCEEEGAVLTCGNIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDAKASINRGKYETARAIYAYALRVFVTSTKLWLAAADLEKNHGTKEALWQLLEKAVEARPTSEVLWMMLAKEKWLAGEVDNARRVLGKAFNQNPNNEEIWLAAVKLEAENNQPEQARELLKTARQEAPTDRVWTKSVAYERQLGNIDAALDLANQGLNLFPGAAKLWMMKGQIYEGEGKMPQAREAYSTGTKACPKSVPLWLLYSRLEERAGMVVKARSVLDRARLAVPKSPELWTESVRVERRANNTAQAKIMMAKALQEVPNSGLLYTESIWNLEARTQRKPRALEAIKKVDNDPILFVTIARIFWGERRLEKAQNWFEKAILLDSDLGDTWAWYYKFLLQHGTEEKRADVIQKCILSEPRHGEYWQAVAKDPKNAGKGIEEILKMVVEKVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.39
3 0.34
4 0.31
5 0.23
6 0.18
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.37
40 0.36
41 0.32
42 0.31
43 0.27
44 0.27
45 0.26
46 0.25
47 0.18
48 0.18
49 0.16
50 0.12
51 0.15
52 0.13
53 0.15
54 0.19
55 0.2
56 0.22
57 0.24
58 0.25
59 0.27
60 0.32
61 0.32
62 0.33
63 0.34
64 0.33
65 0.31
66 0.31
67 0.29
68 0.24
69 0.23
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.14
85 0.12
86 0.13
87 0.15
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.19
97 0.21
98 0.3
99 0.38
100 0.42
101 0.48
102 0.57
103 0.62
104 0.69
105 0.76
106 0.78
107 0.81
108 0.86
109 0.88
110 0.89
111 0.83
112 0.78
113 0.78
114 0.69
115 0.65
116 0.64
117 0.59
118 0.6
119 0.65
120 0.63
121 0.59
122 0.59
123 0.6
124 0.59
125 0.57
126 0.49
127 0.46
128 0.52
129 0.49
130 0.55
131 0.47
132 0.4
133 0.38
134 0.35
135 0.29
136 0.2
137 0.2
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.19
155 0.24
156 0.3
157 0.36
158 0.4
159 0.48
160 0.58
161 0.65
162 0.7
163 0.76
164 0.77
165 0.78
166 0.78
167 0.74
168 0.71
169 0.68
170 0.58
171 0.51
172 0.44
173 0.38
174 0.34
175 0.3
176 0.23
177 0.15
178 0.14
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.14
217 0.14
218 0.18
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.29
223 0.33
224 0.32
225 0.34
226 0.32
227 0.31
228 0.3
229 0.28
230 0.2
231 0.16
232 0.14
233 0.12
234 0.1
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.14
249 0.16
250 0.2
251 0.21
252 0.19
253 0.21
254 0.22
255 0.22
256 0.2
257 0.19
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.2
276 0.24
277 0.23
278 0.29
279 0.32
280 0.32
281 0.32
282 0.3
283 0.29
284 0.26
285 0.32
286 0.27
287 0.24
288 0.21
289 0.21
290 0.2
291 0.16
292 0.14
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.22
311 0.22
312 0.2
313 0.21
314 0.23
315 0.24
316 0.25
317 0.26
318 0.22
319 0.27
320 0.26
321 0.26
322 0.25
323 0.25
324 0.22
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.23
329 0.23
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.21
334 0.19
335 0.16
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.19
340 0.2
341 0.19
342 0.21
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.22
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.21
352 0.2
353 0.19
354 0.15
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.21
359 0.26
360 0.29
361 0.34
362 0.34
363 0.39
364 0.47
365 0.56
366 0.56
367 0.53
368 0.53
369 0.55
370 0.6
371 0.57
372 0.49
373 0.4
374 0.33
375 0.29
376 0.26
377 0.21
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.11
382 0.12
383 0.13
384 0.12
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.07
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.16
427 0.25
428 0.28
429 0.25
430 0.28
431 0.33
432 0.36
433 0.38
434 0.39
435 0.33
436 0.32
437 0.35
438 0.33
439 0.28
440 0.24
441 0.21
442 0.18
443 0.16
444 0.11
445 0.08
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.07
457 0.09
458 0.1
459 0.13
460 0.14
461 0.17
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.15
466 0.16
467 0.14
468 0.14
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.17
473 0.17
474 0.17
475 0.16
476 0.17
477 0.18
478 0.17
479 0.16
480 0.14
481 0.15
482 0.16
483 0.17
484 0.16
485 0.15
486 0.15
487 0.14
488 0.11
489 0.09
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.09
518 0.12
519 0.13
520 0.13
521 0.14
522 0.15
523 0.15
524 0.16
525 0.17
526 0.15
527 0.15
528 0.16
529 0.17
530 0.18
531 0.22
532 0.25
533 0.23
534 0.21
535 0.2
536 0.19
537 0.17
538 0.17
539 0.14
540 0.1
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.14
562 0.12
563 0.11
564 0.1
565 0.17
566 0.2
567 0.2
568 0.2
569 0.21
570 0.2
571 0.22
572 0.21
573 0.14
574 0.11
575 0.11
576 0.13
577 0.13
578 0.14
579 0.12
580 0.14
581 0.14
582 0.14
583 0.13
584 0.1
585 0.11
586 0.1
587 0.09
588 0.12
589 0.11
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.09
594 0.11
595 0.11
596 0.08
597 0.16
598 0.19
599 0.23
600 0.25
601 0.25
602 0.24
603 0.24
604 0.24
605 0.19
606 0.21
607 0.2
608 0.27
609 0.34
610 0.42
611 0.45
612 0.46
613 0.45
614 0.43
615 0.4
616 0.31
617 0.24
618 0.16
619 0.15
620 0.13
621 0.11
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.07
628 0.1
629 0.12
630 0.13
631 0.16
632 0.17
633 0.16
634 0.18
635 0.19
636 0.18
637 0.17
638 0.19
639 0.19
640 0.21
641 0.24
642 0.26
643 0.29
644 0.28
645 0.3
646 0.31
647 0.33
648 0.33
649 0.35
650 0.32
651 0.28
652 0.28
653 0.27
654 0.25
655 0.25
656 0.27
657 0.27
658 0.29
659 0.33
660 0.32
661 0.34
662 0.35
663 0.3
664 0.25
665 0.21
666 0.19
667 0.12
668 0.12
669 0.08
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.05
683 0.06
684 0.06
685 0.07
686 0.08
687 0.11
688 0.12
689 0.13
690 0.12
691 0.13
692 0.14
693 0.15
694 0.17
695 0.14
696 0.15
697 0.15
698 0.16
699 0.18
700 0.18
701 0.18
702 0.17
703 0.17
704 0.18
705 0.19
706 0.23
707 0.21
708 0.22
709 0.22
710 0.24
711 0.29
712 0.28
713 0.29
714 0.26
715 0.26
716 0.29
717 0.34
718 0.33
719 0.3
720 0.34
721 0.32
722 0.33
723 0.31
724 0.31
725 0.26
726 0.25
727 0.24
728 0.19
729 0.19
730 0.21
731 0.21
732 0.17
733 0.18
734 0.18
735 0.18
736 0.19
737 0.19
738 0.14
739 0.16
740 0.19
741 0.22
742 0.23
743 0.25
744 0.29
745 0.33
746 0.33
747 0.36
748 0.37
749 0.35
750 0.35
751 0.34
752 0.3
753 0.3
754 0.31
755 0.28
756 0.27
757 0.26
758 0.32
759 0.33
760 0.36
761 0.37
762 0.39
763 0.44
764 0.46
765 0.45
766 0.46
767 0.48
768 0.46
769 0.42
770 0.37
771 0.32
772 0.28
773 0.27
774 0.2
775 0.15
776 0.15
777 0.15
778 0.19
779 0.2
780 0.18
781 0.19
782 0.19
783 0.23
784 0.22
785 0.19
786 0.15
787 0.14
788 0.15
789 0.14
790 0.16
791 0.12
792 0.12
793 0.13
794 0.13
795 0.13
796 0.16
797 0.22
798 0.22
799 0.32
800 0.4
801 0.47
802 0.53
803 0.56
804 0.56
805 0.6
806 0.65
807 0.65
808 0.66
809 0.69
810 0.65
811 0.64
812 0.61
813 0.55
814 0.5
815 0.41
816 0.34
817 0.26
818 0.24
819 0.21
820 0.2
821 0.19
822 0.17
823 0.16
824 0.14
825 0.13
826 0.12
827 0.16
828 0.22
829 0.23
830 0.24
831 0.31
832 0.36
833 0.41
834 0.46
835 0.52
836 0.56
837 0.6
838 0.62
839 0.56
840 0.51
841 0.47
842 0.43
843 0.35
844 0.26
845 0.19
846 0.15
847 0.15
848 0.16
849 0.13
850 0.13
851 0.11
852 0.1
853 0.1
854 0.15
855 0.14
856 0.14
857 0.16
858 0.2
859 0.25
860 0.26
861 0.32
862 0.27
863 0.34
864 0.42
865 0.45
866 0.44
867 0.41
868 0.4
869 0.36
870 0.36
871 0.36
872 0.32
873 0.32
874 0.36
875 0.36
876 0.36
877 0.38
878 0.44
879 0.4
880 0.43
881 0.45
882 0.42
883 0.43
884 0.42
885 0.4
886 0.36
887 0.4
888 0.36
889 0.31
890 0.3
891 0.35
892 0.38
893 0.42
894 0.45
895 0.44
896 0.43
897 0.43
898 0.42
899 0.37
900 0.37
901 0.33
902 0.35
903 0.28
904 0.26
905 0.25
906 0.24
907 0.21