FuNGI

A5E3M8

Protein Details

Accession

A5E3M8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-79	VKDFEKPVRLHRKDPRNMQFH	Basic
184-209	PDGGARKNKKNLFKRKTKQINLMDEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-122	REKEEAEKQNATKQETKKGKGEGKDKDKGKGKD
189-200	RKNKKNLFKRKT
422-436	RKVDKEGKKLKKMLN

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	lel:LELG_04216 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQQVPQVKTEPGIKKEPGTENNEEWQTIPLKSYGPEDVDENTRIHIMKLISRNDVNIVKDFEKPVRLHRKDPRNMQFHLTRQELDQRKREKEEAEKQNATKQETKKGKGEGKDKDKGKGKDKENENENENGGENEKEQEEGNTEGDGKSDVKSDKAKEEIKSKIAPEEGKLMRGQADLSQVAPDGGARKNKKNLFKRKTKQINLMDEAKRKLRYEEHYPWVIEDYTGKNVYVGNYEAGSTELLHVLFVFDKDGFKMIPAEKVYRFTPRNKYATLTLEEAEQKMEKNSSVPRWLMKHIENDSIAEGSPDQRFRNNSPSANGRVINDNTRGRRMRTVIGGSSSSGHTNSGSGKDRDSDHDDLDFEEEFADDEEAPIMDGDEEENKMSERKIKKEMLRAAHLNADEDADVEDDLDDLFETEKSRKVDKEGKKLKKMLNKREGGIYDSDDEERELLPYLSKSDLESDEESDNEIKVKQEPNQEEAGSGATSGPGAGESVGPAMRHITAAYLGDGFVTILAPKEFLSTFPAGEWVPNGRKRPTSPIGVEMASPQKKSKTGNVSSSDKDKDIDKDNKNNNDNNKENENNALMNTVTVKREPSREPVSRSASPVNAEGSTYDLNDAGPSNLLVTVNEILSIVKDRPLTTKELLLGLKNRISAHADNKQRIIAIVKQNLKLVDGKLALRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.48
3	0.54
4	0.59
5	0.58
6	0.57
7	0.58
8	0.54
9	0.59
10	0.57
11	0.49
12	0.41
13	0.38
14	0.33
15	0.27
16	0.25
17	0.19
18	0.19
19	0.2
20	0.23
21	0.23
22	0.22
23	0.23
24	0.23
25	0.25
26	0.28
27	0.28
28	0.25
29	0.22
30	0.23
31	0.22
32	0.2
33	0.22
34	0.19
35	0.24
36	0.32
37	0.35
38	0.38
39	0.38
40	0.39
41	0.4
42	0.42
43	0.38
44	0.34
45	0.35
46	0.31
47	0.34
48	0.37
49	0.35
50	0.38
51	0.36
52	0.43
53	0.49
54	0.52
55	0.58
56	0.64
57	0.71
58	0.73
59	0.83
60	0.82
61	0.77
62	0.75
63	0.73
64	0.7
65	0.66
66	0.64
67	0.57
68	0.48
69	0.44
70	0.52
71	0.54
72	0.54
73	0.56
74	0.57
75	0.61
76	0.66
77	0.67
78	0.64
79	0.65
80	0.68
81	0.7
82	0.71
83	0.7
84	0.66
85	0.68
86	0.66
87	0.61
88	0.59
89	0.53
90	0.54
91	0.56
92	0.6
93	0.59
94	0.63
95	0.64
96	0.64
97	0.69
98	0.69
99	0.69
100	0.72
101	0.69
102	0.69
103	0.71
104	0.71
105	0.71
106	0.7
107	0.68
108	0.69
109	0.74
110	0.74
111	0.72
112	0.7
113	0.64
114	0.57
115	0.51
116	0.42
117	0.35
118	0.27
119	0.21
120	0.17
121	0.14
122	0.13
123	0.13
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.13
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.13
132	0.12
133	0.13
134	0.13
135	0.12
136	0.1
137	0.14
138	0.14
139	0.18
140	0.23
141	0.26
142	0.29
143	0.35
144	0.39
145	0.39
146	0.45
147	0.46
148	0.46
149	0.47
150	0.43
151	0.4
152	0.39
153	0.36
154	0.31
155	0.35
156	0.31
157	0.29
158	0.28
159	0.25
160	0.22
161	0.21
162	0.2
163	0.13
164	0.16
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.13
169	0.12
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.13
174	0.21
175	0.25
176	0.31
177	0.4
178	0.47
179	0.56
180	0.64
181	0.71
182	0.73
183	0.8
184	0.82
185	0.84
186	0.89
187	0.85
188	0.85
189	0.82
190	0.81
191	0.74
192	0.74
193	0.69
194	0.63
195	0.59
196	0.54
197	0.49
198	0.41
199	0.4
200	0.38
201	0.38
202	0.43
203	0.47
204	0.48
205	0.49
206	0.48
207	0.45
208	0.4
209	0.34
210	0.25
211	0.2
212	0.16
213	0.17
214	0.17
215	0.17
216	0.15
217	0.15
218	0.16
219	0.15
220	0.14
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.11
244	0.11
245	0.15
246	0.17
247	0.2
248	0.21
249	0.24
250	0.25
251	0.29
252	0.31
253	0.34
254	0.42
255	0.46
256	0.48
257	0.47
258	0.47
259	0.43
260	0.44
261	0.4
262	0.32
263	0.24
264	0.23
265	0.22
266	0.2
267	0.17
268	0.14
269	0.11
270	0.11
271	0.11
272	0.09
273	0.11
274	0.15
275	0.17
276	0.21
277	0.22
278	0.24
279	0.26
280	0.28
281	0.3
282	0.29
283	0.32
284	0.31
285	0.33
286	0.3
287	0.27
288	0.25
289	0.21
290	0.18
291	0.12
292	0.09
293	0.08
294	0.1
295	0.12
296	0.12
297	0.15
298	0.18
299	0.21
300	0.29
301	0.31
302	0.3
303	0.31
304	0.34
305	0.35
306	0.35
307	0.33
308	0.25
309	0.26
310	0.26
311	0.26
312	0.27
313	0.28
314	0.27
315	0.32
316	0.33
317	0.3
318	0.33
319	0.32
320	0.29
321	0.28
322	0.29
323	0.24
324	0.23
325	0.22
326	0.18
327	0.17
328	0.15
329	0.12
330	0.1
331	0.09
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.12
336	0.15
337	0.15
338	0.15
339	0.17
340	0.18
341	0.21
342	0.26
343	0.23
344	0.2
345	0.21
346	0.2
347	0.19
348	0.19
349	0.15
350	0.09
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.08
373	0.15
374	0.18
375	0.23
376	0.3
377	0.36
378	0.41
379	0.49
380	0.55
381	0.52
382	0.53
383	0.5
384	0.45
385	0.42
386	0.37
387	0.29
388	0.22
389	0.18
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.06
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.06
405	0.07
406	0.12
407	0.14
408	0.17
409	0.18
410	0.24
411	0.34
412	0.41
413	0.51
414	0.57
415	0.64
416	0.69
417	0.75
418	0.74
419	0.74
420	0.76
421	0.76
422	0.75
423	0.69
424	0.63
425	0.61
426	0.56
427	0.49
428	0.41
429	0.32
430	0.23
431	0.21
432	0.2
433	0.15
434	0.14
435	0.12
436	0.1
437	0.09
438	0.08
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.12
447	0.14
448	0.16
449	0.17
450	0.18
451	0.17
452	0.17
453	0.18
454	0.16
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.13
460	0.16
461	0.2
462	0.28
463	0.31
464	0.33
465	0.36
466	0.35
467	0.31
468	0.28
469	0.25
470	0.16
471	0.13
472	0.09
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.03
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.14
510	0.14
511	0.14
512	0.14
513	0.16
514	0.14
515	0.14
516	0.15
517	0.16
518	0.22
519	0.28
520	0.32
521	0.34
522	0.39
523	0.42
524	0.5
525	0.49
526	0.49
527	0.46
528	0.46
529	0.45
530	0.41
531	0.38
532	0.32
533	0.36
534	0.31
535	0.3
536	0.28
537	0.29
538	0.32
539	0.35
540	0.4
541	0.41
542	0.45
543	0.52
544	0.56
545	0.58
546	0.58
547	0.61
548	0.55
549	0.46
550	0.4
551	0.35
552	0.33
553	0.37
554	0.43
555	0.45
556	0.52
557	0.6
558	0.68
559	0.71
560	0.73
561	0.73
562	0.72
563	0.7
564	0.65
565	0.64
566	0.57
567	0.53
568	0.5
569	0.43
570	0.35
571	0.3
572	0.25
573	0.17
574	0.16
575	0.18
576	0.16
577	0.16
578	0.16
579	0.21
580	0.23
581	0.29
582	0.32
583	0.37
584	0.43
585	0.48
586	0.53
587	0.57
588	0.61
589	0.58
590	0.59
591	0.56
592	0.49
593	0.44
594	0.4
595	0.34
596	0.27
597	0.25
598	0.2
599	0.19
600	0.18
601	0.16
602	0.15
603	0.12
604	0.12
605	0.12
606	0.13
607	0.1
608	0.09
609	0.09
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.12
615	0.12
616	0.12
617	0.12
618	0.11
619	0.1
620	0.11
621	0.14
622	0.12
623	0.14
624	0.16
625	0.18
626	0.23
627	0.26
628	0.31
629	0.3
630	0.33
631	0.31
632	0.35
633	0.35
634	0.35
635	0.37
636	0.36
637	0.37
638	0.36
639	0.34
640	0.32
641	0.36
642	0.36
643	0.4
644	0.44
645	0.5
646	0.52
647	0.54
648	0.52
649	0.47
650	0.43
651	0.39
652	0.38
653	0.39
654	0.43
655	0.48
656	0.48
657	0.51
658	0.5
659	0.48
660	0.43
661	0.35
662	0.33
663	0.3

A5E3M8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer