Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1J3T7

Protein Details
Accession A0A4Z1J3T7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-402SKWSSGKRGTHYRKKRRWERIRHIVSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-394KRGTHYRKKRRWER
Subcellular Location(s) mito_nucl 10.833, nucl 10.5, mito 10, cyto_mito 8.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHNLVKANAWVALRLPSDNFKVLQVVPNTPISLGKYGTFPSNLIIDRPYNLKYELIDRQKDQKYSDLRIVPASEIHADTIAEENAAANPVPDENVIIGGDGVEFELVGENGEVIMRSNRETIDDSARQTLTQEEIETLKRDGAAAGKDLIAKLMLSHTALDEKTSFSLAKYKLLKTRKYLRQFTILPMDVAMINYWMMKEKDASKIMECRDEMLALAGSWANVHFSEDPESENTDDPLNTSGGGRLLVVDETGGLLVAAMAERMGLLYPEEDQDLPTEFTGASEEAQADKEPAPRHQHDRQYRPYASTNTLTLIHTNSQPNLSLLKYFNFNIDSPAASHPLTRRLLPISWLQLISPESDSLYSSPPPSATPEELSKWSSGKRGTHYRKKRRWERIRHIVSTTQHGDFTGLVVASNMDPISIIRRTIHLLRPSATITIYSPTIEPLVALADLYSTSRRTAFIQSPPEELKGLSQAEIATWQGNEDFPLNPSLILNTSVQSCRKREWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYLFTGTRVVPAEGKVSARGKFSKRPKVVEGEKTSTGATEDIEGSANKKIKLEPGILEVQTNGEQDVNMGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.28
5 0.31
6 0.3
7 0.26
8 0.28
9 0.28
10 0.32
11 0.3
12 0.3
13 0.3
14 0.31
15 0.31
16 0.27
17 0.28
18 0.25
19 0.24
20 0.22
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.2
27 0.19
28 0.23
29 0.22
30 0.21
31 0.23
32 0.21
33 0.22
34 0.25
35 0.25
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.27
41 0.34
42 0.4
43 0.43
44 0.44
45 0.52
46 0.57
47 0.59
48 0.55
49 0.54
50 0.52
51 0.52
52 0.57
53 0.51
54 0.46
55 0.46
56 0.45
57 0.37
58 0.32
59 0.29
60 0.23
61 0.19
62 0.18
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.16
107 0.19
108 0.22
109 0.27
110 0.29
111 0.29
112 0.32
113 0.32
114 0.29
115 0.27
116 0.25
117 0.19
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.1
154 0.18
155 0.18
156 0.24
157 0.28
158 0.32
159 0.38
160 0.46
161 0.5
162 0.51
163 0.6
164 0.63
165 0.67
166 0.71
167 0.66
168 0.67
169 0.63
170 0.6
171 0.57
172 0.48
173 0.39
174 0.31
175 0.28
176 0.2
177 0.18
178 0.14
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.14
188 0.2
189 0.23
190 0.25
191 0.24
192 0.3
193 0.31
194 0.33
195 0.3
196 0.26
197 0.23
198 0.22
199 0.19
200 0.14
201 0.13
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.05
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.12
278 0.13
279 0.17
280 0.23
281 0.26
282 0.33
283 0.38
284 0.46
285 0.5
286 0.57
287 0.61
288 0.62
289 0.6
290 0.57
291 0.54
292 0.48
293 0.43
294 0.36
295 0.29
296 0.22
297 0.23
298 0.19
299 0.16
300 0.14
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.12
325 0.14
326 0.13
327 0.19
328 0.2
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.21
333 0.21
334 0.23
335 0.19
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.14
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.14
355 0.16
356 0.16
357 0.18
358 0.19
359 0.21
360 0.23
361 0.24
362 0.21
363 0.2
364 0.2
365 0.21
366 0.23
367 0.25
368 0.29
369 0.39
370 0.48
371 0.57
372 0.67
373 0.74
374 0.78
375 0.85
376 0.89
377 0.9
378 0.9
379 0.91
380 0.9
381 0.9
382 0.9
383 0.82
384 0.75
385 0.69
386 0.6
387 0.56
388 0.48
389 0.38
390 0.3
391 0.27
392 0.24
393 0.18
394 0.17
395 0.11
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.09
407 0.09
408 0.11
409 0.1
410 0.12
411 0.16
412 0.21
413 0.28
414 0.29
415 0.31
416 0.32
417 0.33
418 0.33
419 0.3
420 0.26
421 0.2
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.12
444 0.14
445 0.2
446 0.25
447 0.3
448 0.38
449 0.39
450 0.43
451 0.44
452 0.42
453 0.37
454 0.31
455 0.26
456 0.22
457 0.21
458 0.16
459 0.15
460 0.14
461 0.13
462 0.14
463 0.13
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.11
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.15
483 0.19
484 0.24
485 0.29
486 0.3
487 0.33
488 0.41
489 0.47
490 0.52
491 0.56
492 0.6
493 0.65
494 0.7
495 0.7
496 0.66
497 0.66
498 0.58
499 0.5
500 0.42
501 0.37
502 0.32
503 0.3
504 0.28
505 0.23
506 0.25
507 0.24
508 0.23
509 0.18
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.14
514 0.11
515 0.13
516 0.13
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.14
521 0.15
522 0.18
523 0.18
524 0.2
525 0.23
526 0.26
527 0.27
528 0.3
529 0.36
530 0.4
531 0.48
532 0.57
533 0.62
534 0.65
535 0.69
536 0.7
537 0.73
538 0.75
539 0.76
540 0.74
541 0.69
542 0.64
543 0.58
544 0.52
545 0.43
546 0.35
547 0.25
548 0.17
549 0.14
550 0.12
551 0.12
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.2
556 0.24
557 0.23
558 0.24
559 0.26
560 0.31
561 0.36
562 0.39
563 0.35
564 0.36
565 0.41
566 0.39
567 0.38
568 0.31
569 0.29
570 0.27
571 0.24
572 0.19
573 0.14
574 0.13