FuNGI

A0A4Z1HDD5

Protein Details

Accession

A0A4Z1HDD5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
133-155	TTGRARFKPKNIRRDQADRDRLE	Hydrophilic
404-427	ISSQQSKIRPSRKKDKMPVIQTEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-24	ERGATSRGRPRGRGRGRGR
135-144	GRARFKPKNI
174-186	RRSQRGRGHIGRG
396-417	KKHPKREPISSQQSKIRPSRKK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAERGATSRGRPRGRGRGRGRGIAIEEIETPELRGVLDESSQPSQSPAPIAPVAPMAPMTQSTATIIPKIEPSDDAFDPNTSPAITPAATPAGTPAPTAATTSTRLPSRTESAIARGRGGASTRARGEATTGRARFKPKNIRRDQADRDRLEQEERDRIAANQAQAEKEARRSQRGRGHIGRGRGDAMGQNRGAGRGAPISSATGIFSVAPAAMDRKGGMDGFAIANTRGGGGGSGGGGSGGYGGSGSGIGGGVNVLSAENMATFNPEYPDDDGQARKVNIEMINLVDDDDEMAGSGRGGSGGFKSRSLAPIRIKREEHKERSNMMVSDPELAEIAKKQADEVEDSQSGEDVEMTMDGATTTDEPRTKGEPGLESPTMSKFPEFKAPSSPEDKKHPKREPISSQQSKIRPSRKKDKMPVIQTEEDKFEYERYLEDVDILAEELRLLRGTVDKTAKDKGKGNAVDVDGDVGMDGEQEQDEAQPEANHADGRIYLFQFPPVLPRLFNPQVENSDDVVVTQSSEKVDLTDEKENGIKKESEEVIIKTEPNLAQENEALVSEQGYIGKLVVRKSGKVELDWGGTSMAVGRGVPAAFLSQIVLAEDPKGEAPEGVATGLGKVMGKFIVTPDWEKIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.73
3	0.75
4	0.77
5	0.79
6	0.78
7	0.8
8	0.8
9	0.8
10	0.73
11	0.67
12	0.6
13	0.55
14	0.47
15	0.38
16	0.33
17	0.28
18	0.27
19	0.21
20	0.18
21	0.14
22	0.13
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.13
29	0.17
30	0.2
31	0.2
32	0.2
33	0.21
34	0.21
35	0.21
36	0.22
37	0.18
38	0.2
39	0.21
40	0.21
41	0.2
42	0.2
43	0.19
44	0.16
45	0.16
46	0.11
47	0.11
48	0.12
49	0.14
50	0.12
51	0.13
52	0.14
53	0.17
54	0.18
55	0.18
56	0.18
57	0.17
58	0.19
59	0.21
60	0.2
61	0.18
62	0.2
63	0.24
64	0.24
65	0.25
66	0.24
67	0.23
68	0.22
69	0.22
70	0.19
71	0.14
72	0.13
73	0.12
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.13
78	0.15
79	0.14
80	0.14
81	0.15
82	0.16
83	0.16
84	0.15
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.15
89	0.14
90	0.13
91	0.16
92	0.19
93	0.23
94	0.23
95	0.24
96	0.26
97	0.29
98	0.31
99	0.31
100	0.32
101	0.29
102	0.33
103	0.38
104	0.36
105	0.33
106	0.29
107	0.27
108	0.25
109	0.25
110	0.26
111	0.22
112	0.27
113	0.27
114	0.28
115	0.28
116	0.26
117	0.29
118	0.26
119	0.29
120	0.33
121	0.33
122	0.35
123	0.38
124	0.45
125	0.47
126	0.52
127	0.57
128	0.57
129	0.66
130	0.71
131	0.76
132	0.77
133	0.8
134	0.8
135	0.8
136	0.8
137	0.72
138	0.68
139	0.62
140	0.56
141	0.51
142	0.45
143	0.39
144	0.38
145	0.36
146	0.33
147	0.31
148	0.29
149	0.32
150	0.3
151	0.27
152	0.24
153	0.24
154	0.23
155	0.24
156	0.26
157	0.22
158	0.25
159	0.31
160	0.3
161	0.37
162	0.39
163	0.46
164	0.51
165	0.56
166	0.59
167	0.57
168	0.63
169	0.58
170	0.62
171	0.57
172	0.5
173	0.45
174	0.36
175	0.31
176	0.26
177	0.24
178	0.23
179	0.19
180	0.19
181	0.18
182	0.19
183	0.18
184	0.14
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.07
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.02
232	0.02
233	0.02
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.02
238	0.02
239	0.03
240	0.02
241	0.02
242	0.03
243	0.02
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.09
259	0.11
260	0.12
261	0.12
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.18
266	0.16
267	0.14
268	0.14
269	0.16
270	0.14
271	0.15
272	0.13
273	0.1
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.07
278	0.06
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.05
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.12
296	0.13
297	0.18
298	0.2
299	0.24
300	0.26
301	0.34
302	0.38
303	0.43
304	0.44
305	0.44
306	0.52
307	0.56
308	0.55
309	0.55
310	0.54
311	0.51
312	0.52
313	0.51
314	0.41
315	0.31
316	0.27
317	0.19
318	0.17
319	0.15
320	0.12
321	0.09
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.12
332	0.14
333	0.16
334	0.16
335	0.16
336	0.16
337	0.14
338	0.14
339	0.1
340	0.08
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.08
353	0.09
354	0.1
355	0.13
356	0.15
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.18
361	0.2
362	0.24
363	0.22
364	0.2
365	0.2
366	0.2
367	0.19
368	0.17
369	0.16
370	0.12
371	0.14
372	0.23
373	0.24
374	0.23
375	0.29
376	0.33
377	0.35
378	0.41
379	0.44
380	0.38
381	0.46
382	0.56
383	0.57
384	0.64
385	0.69
386	0.7
387	0.72
388	0.77
389	0.76
390	0.75
391	0.77
392	0.72
393	0.68
394	0.66
395	0.64
396	0.62
397	0.62
398	0.61
399	0.59
400	0.62
401	0.69
402	0.72
403	0.77
404	0.8
405	0.83
406	0.82
407	0.81
408	0.8
409	0.76
410	0.71
411	0.63
412	0.56
413	0.48
414	0.4
415	0.34
416	0.26
417	0.2
418	0.16
419	0.14
420	0.13
421	0.12
422	0.13
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.08
438	0.1
439	0.16
440	0.2
441	0.21
442	0.24
443	0.32
444	0.35
445	0.36
446	0.41
447	0.38
448	0.44
449	0.43
450	0.43
451	0.4
452	0.37
453	0.34
454	0.28
455	0.25
456	0.15
457	0.14
458	0.11
459	0.06
460	0.05
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.05
467	0.05
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.11
480	0.14
481	0.14
482	0.16
483	0.16
484	0.17
485	0.18
486	0.17
487	0.19
488	0.2
489	0.2
490	0.18
491	0.19
492	0.27
493	0.31
494	0.33
495	0.32
496	0.32
497	0.34
498	0.37
499	0.38
500	0.3
501	0.27
502	0.24
503	0.21
504	0.18
505	0.15
506	0.12
507	0.1
508	0.1
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.1
513	0.13
514	0.16
515	0.2
516	0.25
517	0.25
518	0.25
519	0.29
520	0.31
521	0.3
522	0.31
523	0.27
524	0.22
525	0.29
526	0.29
527	0.29
528	0.3
529	0.29
530	0.3
531	0.3
532	0.29
533	0.23
534	0.27
535	0.23
536	0.23
537	0.26
538	0.22
539	0.22
540	0.22
541	0.23
542	0.18
543	0.17
544	0.15
545	0.1
546	0.1
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.11
554	0.13
555	0.15
556	0.22
557	0.24
558	0.26
559	0.3
560	0.38
561	0.37
562	0.36
563	0.38
564	0.34
565	0.35
566	0.33
567	0.29
568	0.21
569	0.18
570	0.17
571	0.14
572	0.12
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.09
583	0.09
584	0.08
585	0.08
586	0.09
587	0.09
588	0.09
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.11
593	0.12
594	0.11
595	0.1
596	0.11
597	0.13
598	0.13
599	0.12
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.1
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.12
612	0.17
613	0.2
614	0.23

A0A4Z1HDD5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer