Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1IPS6

Protein Details
Accession A0A4Z1IPS6    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-425EEFREREKMRQEKRRDEERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-254KFKHKKIPRGPPS
365-376RAGAGAGSRRRD
409-419RQEKRRDEERK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MAASLSRALPKPKYTGEEEDIPQHAQQRGPRILGAGALDDTQIVLKVGLSNLEQLKVSSNNTSRSQKTGPPPYGNRTVWRPRGQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKSTSSNNALALQVDGEGKVKYDAIARQGHNDKRIVHASFKDLIPLRQRADAGDINLDRPSEEEVAASTERTKNALATLVSGALAAQKPKNVNVGARKDPTYVRYTPANQMGDNSRKNDLIMKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPAPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKVYSVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKAQKEDHLRMLAQKAREERAGAGAGSRRRDSRSSRSRSGSYSESESDRSNSDDEEFREREKMRQEKRRDEERKLRQSRMGTERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSTETMFDSRLFNRTSGFDSGFNEDQAYDKPLFAAQDAISSIYRPRQNMDDDDDEAAAEGEMANIQKSNRFADALGKGTFQGAADVEAREGPVQFEKDSCDVFNVDDFLSKVGESSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.52
4 0.54
5 0.51
6 0.5
7 0.47
8 0.44
9 0.39
10 0.37
11 0.35
12 0.32
13 0.34
14 0.38
15 0.41
16 0.41
17 0.4
18 0.36
19 0.33
20 0.31
21 0.27
22 0.19
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.08
34 0.09
35 0.11
36 0.11
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.17
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.26
46 0.29
47 0.34
48 0.4
49 0.47
50 0.45
51 0.49
52 0.51
53 0.5
54 0.55
55 0.6
56 0.61
57 0.63
58 0.66
59 0.66
60 0.72
61 0.67
62 0.62
63 0.61
64 0.63
65 0.63
66 0.66
67 0.63
68 0.57
69 0.63
70 0.6
71 0.53
72 0.48
73 0.42
74 0.34
75 0.31
76 0.26
77 0.19
78 0.17
79 0.14
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.13
90 0.18
91 0.17
92 0.19
93 0.19
94 0.21
95 0.23
96 0.28
97 0.3
98 0.3
99 0.31
100 0.32
101 0.31
102 0.3
103 0.28
104 0.23
105 0.16
106 0.13
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.12
116 0.14
117 0.19
118 0.26
119 0.26
120 0.33
121 0.41
122 0.45
123 0.45
124 0.47
125 0.42
126 0.4
127 0.46
128 0.4
129 0.37
130 0.34
131 0.35
132 0.35
133 0.33
134 0.34
135 0.29
136 0.31
137 0.33
138 0.36
139 0.33
140 0.32
141 0.33
142 0.28
143 0.31
144 0.29
145 0.24
146 0.25
147 0.24
148 0.22
149 0.22
150 0.22
151 0.16
152 0.15
153 0.16
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.16
165 0.16
166 0.13
167 0.14
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.14
182 0.16
183 0.21
184 0.19
185 0.24
186 0.3
187 0.36
188 0.39
189 0.41
190 0.41
191 0.39
192 0.39
193 0.37
194 0.35
195 0.29
196 0.26
197 0.28
198 0.29
199 0.32
200 0.37
201 0.35
202 0.29
203 0.3
204 0.33
205 0.35
206 0.35
207 0.33
208 0.28
209 0.27
210 0.27
211 0.3
212 0.25
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.23
217 0.27
218 0.31
219 0.26
220 0.27
221 0.24
222 0.25
223 0.26
224 0.3
225 0.31
226 0.29
227 0.3
228 0.39
229 0.44
230 0.43
231 0.51
232 0.52
233 0.58
234 0.66
235 0.76
236 0.74
237 0.76
238 0.77
239 0.75
240 0.7
241 0.64
242 0.56
243 0.46
244 0.41
245 0.36
246 0.37
247 0.39
248 0.38
249 0.36
250 0.36
251 0.39
252 0.35
253 0.34
254 0.34
255 0.33
256 0.33
257 0.33
258 0.33
259 0.31
260 0.3
261 0.29
262 0.27
263 0.2
264 0.15
265 0.17
266 0.18
267 0.27
268 0.29
269 0.37
270 0.41
271 0.46
272 0.51
273 0.47
274 0.48
275 0.4
276 0.39
277 0.36
278 0.39
279 0.36
280 0.37
281 0.38
282 0.34
283 0.32
284 0.32
285 0.28
286 0.19
287 0.17
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.16
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.12
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.17
317 0.26
318 0.31
319 0.33
320 0.34
321 0.33
322 0.39
323 0.43
324 0.42
325 0.36
326 0.34
327 0.34
328 0.37
329 0.4
330 0.34
331 0.32
332 0.37
333 0.4
334 0.4
335 0.37
336 0.39
337 0.42
338 0.48
339 0.48
340 0.42
341 0.37
342 0.35
343 0.39
344 0.36
345 0.31
346 0.28
347 0.27
348 0.28
349 0.28
350 0.26
351 0.22
352 0.21
353 0.2
354 0.16
355 0.15
356 0.17
357 0.19
358 0.21
359 0.23
360 0.22
361 0.24
362 0.29
363 0.34
364 0.41
365 0.48
366 0.53
367 0.58
368 0.61
369 0.61
370 0.58
371 0.56
372 0.48
373 0.4
374 0.36
375 0.31
376 0.28
377 0.27
378 0.26
379 0.23
380 0.21
381 0.2
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.17
386 0.19
387 0.24
388 0.24
389 0.24
390 0.3
391 0.3
392 0.32
393 0.38
394 0.46
395 0.48
396 0.57
397 0.65
398 0.69
399 0.76
400 0.83
401 0.8
402 0.8
403 0.81
404 0.82
405 0.84
406 0.81
407 0.77
408 0.72
409 0.7
410 0.69
411 0.68
412 0.66
413 0.6
414 0.59
415 0.61
416 0.57
417 0.54
418 0.46
419 0.4
420 0.41
421 0.45
422 0.44
423 0.43
424 0.4
425 0.44
426 0.46
427 0.44
428 0.35
429 0.29
430 0.25
431 0.21
432 0.2
433 0.17
434 0.15
435 0.13
436 0.15
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.15
441 0.14
442 0.16
443 0.17
444 0.17
445 0.22
446 0.23
447 0.24
448 0.24
449 0.26
450 0.26
451 0.29
452 0.27
453 0.22
454 0.22
455 0.22
456 0.25
457 0.25
458 0.26
459 0.23
460 0.24
461 0.3
462 0.29
463 0.27
464 0.23
465 0.19
466 0.19
467 0.18
468 0.2
469 0.15
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.14
475 0.16
476 0.12
477 0.14
478 0.14
479 0.16
480 0.14
481 0.15
482 0.17
483 0.21
484 0.25
485 0.23
486 0.26
487 0.29
488 0.34
489 0.38
490 0.42
491 0.39
492 0.38
493 0.38
494 0.35
495 0.29
496 0.24
497 0.2
498 0.13
499 0.08
500 0.06
501 0.04
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.13
508 0.16
509 0.19
510 0.19
511 0.2
512 0.2
513 0.27
514 0.31
515 0.32
516 0.3
517 0.28
518 0.26
519 0.25
520 0.25
521 0.17
522 0.15
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.17
534 0.19
535 0.19
536 0.2
537 0.23
538 0.26
539 0.27
540 0.25
541 0.23
542 0.21
543 0.21
544 0.23
545 0.2
546 0.17
547 0.18
548 0.17
549 0.16
550 0.16
551 0.14