FuNGI

A0A4Z1IWL5

Protein Details

Accession

A0A4Z1IWL5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-54	FTRKVKAADPLRPRKKPIRRPNPSSIPAG	Hydrophilic
149-168	PISLHRRDPRKPPPGKAFKD	Basic
509-528	TPSGRPKHTDPLKKSKNLKR	Basic
536-561	ESSGNESSRKKHKKKHVSSSQPTGTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-46	KVKAADPLRPRKKPIRRP
158-160	RKP
435-449	KKKLGKGVRKALTKR
481-550	IDKKKDKEAKAKLKAEAKPSGTSSKGNTTPSGRPKHTDPLKKSKNLKRAGSPNLSESSGNESSRKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGMSNGRTPTPTPNSGGAPQFTRKVKAADPLRPRKKPIRRPNPSSIPAGANLNGLTPARPNGPTSLNNVSGPRAPGPRGPVPINGNVAPRQTYGGWTHPPKGEVTNYPLFTTRRALRDEIRYHAMRFSGKKEVDPTDQNEFTRPISLHRRDPRKPPPGKAFKDEDVVMEDVVDSKERERQEILKAEKEAQKAADRAQIAPTGNNANAAAAKKAQAFRNEKTTQVHRLDKTAEQKKESDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYESALSEVNVMFFTEGSAFKMIPVEKWYKFTSKNKFNTLTIDEAEALLSKKTKESRWAMKTQERNEAQRATQENIRGMNKLYTVKTESASFKGSSRNETRDIDELDFDADDLFQDDDELATVEPDRDEDTKNAQERIKQDQRGANLFGEADEETVEKDFIKEEQELEAKKKLGKGVRKALTKREKNFIYNSDSSNPYASSDSEDDTSDEEKQKEIDKKKDKEAKAKLKAEAKPSGTSSKGNTTPSGRPKHTDPLKKSKNLKRAGSPNLSESSGNESSRKKHKKKHVSSSQPTGTSTPIPGQPQRKSSIVKMSVNPNELSRISSSTPNPQSATSDGEATGGEMSDGAGSKKKKITLRMGGSPTTSRPGSPIPGKASGSRAGSPSQGAEATSPSGSGPITPKDIAGLPSTGVSISQILAHFRGRVGDGEGQTTKKEFMEMIKKYTKYGPDKLLRPKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.43
4	0.42
5	0.42
6	0.43
7	0.46
8	0.48
9	0.42
10	0.39
11	0.4
12	0.43
13	0.43
14	0.43
15	0.41
16	0.42
17	0.42
18	0.46
19	0.5
20	0.52
21	0.6
22	0.66
23	0.74
24	0.75
25	0.8
26	0.81
27	0.84
28	0.85
29	0.86
30	0.86
31	0.86
32	0.89
33	0.92
34	0.91
35	0.85
36	0.79
37	0.71
38	0.62
39	0.54
40	0.48
41	0.38
42	0.3
43	0.25
44	0.2
45	0.19
46	0.16
47	0.14
48	0.13
49	0.15
50	0.17
51	0.18
52	0.2
53	0.22
54	0.27
55	0.29
56	0.33
57	0.37
58	0.36
59	0.37
60	0.36
61	0.35
62	0.33
63	0.33
64	0.32
65	0.3
66	0.29
67	0.3
68	0.36
69	0.4
70	0.42
71	0.41
72	0.43
73	0.43
74	0.46
75	0.46
76	0.42
77	0.4
78	0.37
79	0.37
80	0.32
81	0.28
82	0.26
83	0.22
84	0.24
85	0.24
86	0.27
87	0.33
88	0.35
89	0.4
90	0.4
91	0.41
92	0.39
93	0.39
94	0.38
95	0.34
96	0.37
97	0.39
98	0.37
99	0.37
100	0.4
101	0.37
102	0.34
103	0.37
104	0.36
105	0.33
106	0.36
107	0.39
108	0.4
109	0.49
110	0.51
111	0.49
112	0.51
113	0.48
114	0.45
115	0.44
116	0.4
117	0.36
118	0.35
119	0.34
120	0.37
121	0.36
122	0.37
123	0.4
124	0.42
125	0.43
126	0.45
127	0.44
128	0.43
129	0.45
130	0.43
131	0.4
132	0.37
133	0.32
134	0.31
135	0.27
136	0.26
137	0.33
138	0.38
139	0.45
140	0.52
141	0.61
142	0.62
143	0.72
144	0.76
145	0.76
146	0.78
147	0.77
148	0.79
149	0.8
150	0.8
151	0.76
152	0.72
153	0.64
154	0.61
155	0.52
156	0.43
157	0.35
158	0.3
159	0.23
160	0.17
161	0.14
162	0.11
163	0.11
164	0.11
165	0.08
166	0.08
167	0.14
168	0.15
169	0.17
170	0.19
171	0.22
172	0.28
173	0.36
174	0.4
175	0.4
176	0.41
177	0.45
178	0.47
179	0.45
180	0.39
181	0.34
182	0.34
183	0.3
184	0.31
185	0.29
186	0.26
187	0.25
188	0.25
189	0.26
190	0.22
191	0.21
192	0.21
193	0.19
194	0.18
195	0.18
196	0.15
197	0.12
198	0.14
199	0.14
200	0.13
201	0.11
202	0.13
203	0.16
204	0.2
205	0.23
206	0.3
207	0.35
208	0.36
209	0.45
210	0.45
211	0.44
212	0.45
213	0.46
214	0.46
215	0.47
216	0.51
217	0.43
218	0.45
219	0.45
220	0.45
221	0.5
222	0.5
223	0.47
224	0.43
225	0.43
226	0.45
227	0.49
228	0.45
229	0.41
230	0.35
231	0.33
232	0.33
233	0.33
234	0.29
235	0.24
236	0.24
237	0.19
238	0.17
239	0.15
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.19
245	0.19
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.18
251	0.14
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.15
277	0.19
278	0.19
279	0.23
280	0.25
281	0.27
282	0.34
283	0.41
284	0.47
285	0.51
286	0.56
287	0.59
288	0.6
289	0.56
290	0.54
291	0.48
292	0.4
293	0.31
294	0.27
295	0.2
296	0.17
297	0.16
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.1
304	0.14
305	0.16
306	0.23
307	0.29
308	0.38
309	0.43
310	0.49
311	0.52
312	0.55
313	0.61
314	0.57
315	0.59
316	0.52
317	0.49
318	0.47
319	0.44
320	0.37
321	0.35
322	0.34
323	0.27
324	0.27
325	0.25
326	0.23
327	0.25
328	0.25
329	0.2
330	0.19
331	0.17
332	0.17
333	0.18
334	0.17
335	0.15
336	0.17
337	0.18
338	0.18
339	0.19
340	0.19
341	0.18
342	0.2
343	0.18
344	0.17
345	0.22
346	0.22
347	0.25
348	0.27
349	0.28
350	0.3
351	0.31
352	0.31
353	0.29
354	0.3
355	0.25
356	0.21
357	0.17
358	0.14
359	0.12
360	0.1
361	0.07
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.15
383	0.2
384	0.22
385	0.26
386	0.25
387	0.27
388	0.29
389	0.38
390	0.41
391	0.38
392	0.4
393	0.4
394	0.42
395	0.41
396	0.4
397	0.3
398	0.23
399	0.21
400	0.16
401	0.14
402	0.11
403	0.08
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.12
417	0.16
418	0.17
419	0.19
420	0.22
421	0.21
422	0.22
423	0.24
424	0.26
425	0.29
426	0.35
427	0.4
428	0.47
429	0.53
430	0.59
431	0.59
432	0.65
433	0.69
434	0.69
435	0.65
436	0.64
437	0.6
438	0.56
439	0.58
440	0.52
441	0.48
442	0.43
443	0.41
444	0.36
445	0.35
446	0.32
447	0.29
448	0.25
449	0.19
450	0.17
451	0.15
452	0.15
453	0.14
454	0.14
455	0.14
456	0.14
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.15
461	0.17
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.23
466	0.3
467	0.35
468	0.43
469	0.49
470	0.54
471	0.64
472	0.71
473	0.7
474	0.72
475	0.76
476	0.76
477	0.76
478	0.76
479	0.72
480	0.71
481	0.7
482	0.66
483	0.62
484	0.54
485	0.47
486	0.44
487	0.43
488	0.36
489	0.34
490	0.31
491	0.31
492	0.32
493	0.31
494	0.31
495	0.32
496	0.38
497	0.45
498	0.5
499	0.45
500	0.44
501	0.47
502	0.54
503	0.58
504	0.6
505	0.59
506	0.63
507	0.69
508	0.74
509	0.8
510	0.79
511	0.79
512	0.78
513	0.75
514	0.73
515	0.73
516	0.73
517	0.7
518	0.63
519	0.57
520	0.51
521	0.47
522	0.38
523	0.31
524	0.3
525	0.26
526	0.26
527	0.26
528	0.27
529	0.32
530	0.42
531	0.52
532	0.53
533	0.59
534	0.69
535	0.77
536	0.84
537	0.89
538	0.9
539	0.9
540	0.89
541	0.89
542	0.84
543	0.74
544	0.65
545	0.55
546	0.46
547	0.37
548	0.31
549	0.24
550	0.22
551	0.25
552	0.3
553	0.37
554	0.4
555	0.44
556	0.46
557	0.48
558	0.48
559	0.48
560	0.51
561	0.5
562	0.5
563	0.49
564	0.54
565	0.54
566	0.54
567	0.5
568	0.4
569	0.37
570	0.33
571	0.31
572	0.23
573	0.22
574	0.21
575	0.26
576	0.27
577	0.33
578	0.37
579	0.38
580	0.37
581	0.35
582	0.35
583	0.32
584	0.34
585	0.26
586	0.23
587	0.2
588	0.19
589	0.18
590	0.15
591	0.13
592	0.08
593	0.07
594	0.05
595	0.05
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.13
600	0.15
601	0.2
602	0.25
603	0.31
604	0.36
605	0.44
606	0.53
607	0.57
608	0.63
609	0.67
610	0.67
611	0.62
612	0.6
613	0.54
614	0.46
615	0.41
616	0.34
617	0.25
618	0.24
619	0.26
620	0.3
621	0.33
622	0.37
623	0.37
624	0.42
625	0.44
626	0.43
627	0.44
628	0.41
629	0.4
630	0.36
631	0.33
632	0.29
633	0.29
634	0.27
635	0.24
636	0.21
637	0.18
638	0.16
639	0.15
640	0.15
641	0.15
642	0.14
643	0.13
644	0.11
645	0.12
646	0.11
647	0.13
648	0.15
649	0.16
650	0.21
651	0.21
652	0.21
653	0.22
654	0.25
655	0.24
656	0.22
657	0.19
658	0.15
659	0.16
660	0.16
661	0.14
662	0.11
663	0.11
664	0.09
665	0.08
666	0.11
667	0.11
668	0.13
669	0.16
670	0.18
671	0.18
672	0.17
673	0.2
674	0.18
675	0.19
676	0.21
677	0.26
678	0.25
679	0.3
680	0.32
681	0.31
682	0.32
683	0.32
684	0.29
685	0.22
686	0.23
687	0.18
688	0.24
689	0.33
690	0.35
691	0.41
692	0.48
693	0.48
694	0.5
695	0.55
696	0.56
697	0.54
698	0.58
699	0.6
700	0.61
701	0.69

A0A4Z1IWL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer